FuNGI

A0A550CQC1

Protein Details

Accession

A0A550CQC1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-447	GDWSKQIRRGARPRCGARRREKARRREKADAGGAC	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-440	IRRGARPRCGARRREKARRREK

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 10.5, nucl 5.5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003660 HAMP_dom
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0007165 P:signal transduction
Pfam	View protein in Pfam PF00672 HAMP
PROSITE	View protein in PROSITE PS50885 HAMP
CDD	cd06225 HAMP

Amino Acid Sequences

MDGGDSFVHEPDTFVQFLLLLLPVLQAPQNATKIPTFPGPRNWATDMILKDLKSMASRMHKAERALHDSTNANSADRTEREVPAPEPRRRTNSTPPGTKANANASANANANASDAEEPVDSPPEKRERVLEQPNGKPMKLDISSMPSSLSELNGVFNRGYTDAAGQAFVKGPVFSHSAPPTVQALPESICCPTCNSKVKIPDGIAMMNRFRTVDTTPAGRDGPPPMAPLGPTYAAHASLPRAQELSLLETQVMEVARVCKAVASGDLTQRIDIPVQGATMVQLKDIINTMVDKLGVFAEEVSRVALEVGTEGKLGGQALVLDVEGTWRDLTAIVNKLAANLTSQVRSIATVTKAVALGDLSKQIEVEASGEILDLKNTVNGMVIRLRALAAEVTRVTLEVGSQGKWVEAVALGDWSKQIRRGARPRCGARRREKARRREKADAGGACPPGAPSTVIQKGSRNTLQYNGDLSNLNYNAVICRTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.14
4	0.14
5	0.14
6	0.11
7	0.07
8	0.06
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.09
13	0.08
14	0.12
15	0.17
16	0.2
17	0.2
18	0.23
19	0.24
20	0.25
21	0.27
22	0.32
23	0.32
24	0.34
25	0.42
26	0.47
27	0.48
28	0.52
29	0.52
30	0.47
31	0.44
32	0.45
33	0.38
34	0.37
35	0.37
36	0.31
37	0.3
38	0.28
39	0.27
40	0.22
41	0.22
42	0.23
43	0.28
44	0.33
45	0.37
46	0.44
47	0.46
48	0.47
49	0.54
50	0.55
51	0.52
52	0.51
53	0.46
54	0.42
55	0.4
56	0.38
57	0.35
58	0.28
59	0.22
60	0.19
61	0.21
62	0.23
63	0.22
64	0.28
65	0.26
66	0.27
67	0.29
68	0.32
69	0.32
70	0.37
71	0.45
72	0.45
73	0.49
74	0.54
75	0.59
76	0.61
77	0.66
78	0.67
79	0.69
80	0.71
81	0.7
82	0.68
83	0.67
84	0.64
85	0.59
86	0.52
87	0.48
88	0.47
89	0.4
90	0.4
91	0.35
92	0.35
93	0.34
94	0.3
95	0.24
96	0.16
97	0.16
98	0.13
99	0.12
100	0.09
101	0.08
102	0.09
103	0.08
104	0.09
105	0.09
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.19
110	0.25
111	0.27
112	0.27
113	0.31
114	0.32
115	0.42
116	0.5
117	0.51
118	0.52
119	0.55
120	0.62
121	0.6
122	0.54
123	0.45
124	0.37
125	0.36
126	0.29
127	0.26
128	0.2
129	0.24
130	0.25
131	0.25
132	0.24
133	0.17
134	0.17
135	0.16
136	0.14
137	0.09
138	0.08
139	0.11
140	0.11
141	0.12
142	0.11
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.11
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.13
161	0.13
162	0.17
163	0.18
164	0.19
165	0.19
166	0.21
167	0.21
168	0.18
169	0.17
170	0.12
171	0.12
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.13
179	0.16
180	0.23
181	0.29
182	0.32
183	0.36
184	0.42
185	0.44
186	0.44
187	0.41
188	0.36
189	0.3
190	0.29
191	0.25
192	0.21
193	0.19
194	0.16
195	0.15
196	0.12
197	0.11
198	0.12
199	0.11
200	0.12
201	0.13
202	0.15
203	0.15
204	0.16
205	0.17
206	0.15
207	0.16
208	0.14
209	0.15
210	0.14
211	0.14
212	0.13
213	0.12
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.12
231	0.12
232	0.14
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.09
251	0.11
252	0.13
253	0.16
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.15
258	0.12
259	0.1
260	0.09
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.11
319	0.14
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.16
325	0.15
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.14
336	0.13
337	0.14
338	0.14
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.11
369	0.13
370	0.14
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.11
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.12
402	0.14
403	0.15
404	0.19
405	0.25
406	0.29
407	0.39
408	0.49
409	0.58
410	0.65
411	0.73
412	0.78
413	0.83
414	0.85
415	0.85
416	0.85
417	0.87
418	0.87
419	0.89
420	0.89
421	0.89
422	0.91
423	0.91
424	0.9
425	0.89
426	0.86
427	0.84
428	0.83
429	0.76
430	0.68
431	0.64
432	0.55
433	0.45
434	0.38
435	0.29
436	0.21
437	0.19
438	0.16
439	0.12
440	0.19
441	0.26
442	0.3
443	0.31
444	0.36
445	0.38
446	0.45
447	0.49
448	0.45
449	0.41
450	0.44
451	0.46
452	0.43
453	0.43
454	0.36
455	0.33
456	0.3
457	0.29
458	0.3
459	0.26
460	0.24
461	0.21
462	0.2
463	0.21

A0A550CQC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer