Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CIV0

Protein Details
Accession A0A550CIV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-55DSDSSHKIWKKEKKDKHGDKHKHKEDKHKDKHGPPQFPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-49KIWKKEKKDKHGDKHKHKEDKHKDKHG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006616  DM9_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF11901  DUF3421  
Amino Acid Sequences MSPRRKSLDSSDSSDSDSDSSHKIWKKEKKDKHGDKHKHKEDKHKDKHGPPQFPSNAPMTSPPPPNYTPNPPSSGYRLPLATTQAFPANAQQLGPPPCTDLDGSPIYIGSALFDNSVHPCKIGPHLQTYAAVAYAGAELLHSGRFDLLPFLPEQMEWVHTSGGRIPQGRRPVEGGYEESGAKLYHAIATIDGLRVPGKTGEHLGAANVSFGGAEHVVRDGYEVLCWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.36
3 0.27
4 0.22
5 0.19
6 0.16
7 0.17
8 0.23
9 0.28
10 0.32
11 0.42
12 0.5
13 0.59
14 0.67
15 0.76
16 0.79
17 0.85
18 0.9
19 0.92
20 0.93
21 0.93
22 0.93
23 0.94
24 0.94
25 0.92
26 0.88
27 0.88
28 0.88
29 0.89
30 0.88
31 0.87
32 0.86
33 0.84
34 0.88
35 0.86
36 0.83
37 0.74
38 0.74
39 0.67
40 0.6
41 0.55
42 0.48
43 0.38
44 0.31
45 0.31
46 0.25
47 0.27
48 0.3
49 0.3
50 0.31
51 0.33
52 0.38
53 0.4
54 0.44
55 0.43
56 0.42
57 0.43
58 0.4
59 0.4
60 0.41
61 0.4
62 0.33
63 0.3
64 0.27
65 0.24
66 0.24
67 0.25
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.16
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.14
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.13
118 0.11
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.16
150 0.18
151 0.21
152 0.22
153 0.28
154 0.36
155 0.37
156 0.36
157 0.35
158 0.33
159 0.32
160 0.32
161 0.29
162 0.23
163 0.23
164 0.21
165 0.18
166 0.17
167 0.14
168 0.12
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.1