Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DGG6

Protein Details
Accession C5DGG6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30QSDKNTKHTRVRNMLLRRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11.333, cyto_nucl 6.333, cyto 6, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040152  Atp25  
IPR025210  ATP25_mRNA_stabil_dom  
IPR043519  NT_sf  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0140053  P:mitochondrial gene expression  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
KEGG lth:KLTH0D05170g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13929  mRNA_stabil  
PF02410  RsfS  
Amino Acid Sequences MIERLILFNFQSDKNTKHTRVRNMLLRRAAAALPARKTPLHCYRRLGGSYRALSGSLLLRDEEKRLPHRVQDERDEAKADTDLAADGDSAATKPWYLNIVERPAQNMPLHQQEIVFPANSPKSLETIATFLRDKLGLSDVLIFDLRDSQDEQVTAASKISDFMVMATAKSGRHGHKSFIELNTLLKQEFKTVGQVEGNISANELRRRQKRLARHTNLSKSMGSRTATTRSGSNLESWYMIDCRLDNIFVNILTENKRQDLNLEELYAPPDQKHLYRREAPAEDVAPKEGDDNVLAGLKRLAARNQRRYFTTVPARVQIIDALSRQDFDLVLNVVSASKMDSLDILKAANQTLRSMPYGVKIEGESWITFLDEVWPLAPYSQDFWSTRLELFKLLNCAAPGQVNVDRVFTGYLKFKLASGESLTKSDLVEFLQLVETNLSENSHVDYEDLVAKNKCVLEALKLYKGLDPRLILDSEVMCLLLSTLSITQSGSTSTLRAFYEMVEFASREFSQEPPVPVTATVLRILADKQDYARILRFWEKSIASSPEKDHRPWPLFLDTVASTGDQEFAKKVIRDGHLLWIKRNGVKASPELREAIERLFAVADPAEVAFKDVKEFLTVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.46
3 0.49
4 0.56
5 0.63
6 0.67
7 0.72
8 0.78
9 0.79
10 0.79
11 0.8
12 0.77
13 0.69
14 0.6
15 0.54
16 0.45
17 0.41
18 0.4
19 0.37
20 0.34
21 0.36
22 0.37
23 0.37
24 0.4
25 0.44
26 0.47
27 0.49
28 0.51
29 0.54
30 0.57
31 0.63
32 0.64
33 0.59
34 0.56
35 0.57
36 0.54
37 0.5
38 0.45
39 0.37
40 0.32
41 0.3
42 0.27
43 0.19
44 0.18
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.23
49 0.26
50 0.29
51 0.33
52 0.39
53 0.42
54 0.45
55 0.53
56 0.58
57 0.6
58 0.61
59 0.64
60 0.61
61 0.59
62 0.55
63 0.47
64 0.39
65 0.33
66 0.25
67 0.17
68 0.14
69 0.12
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.18
85 0.23
86 0.3
87 0.33
88 0.34
89 0.36
90 0.35
91 0.38
92 0.33
93 0.3
94 0.28
95 0.31
96 0.32
97 0.28
98 0.27
99 0.24
100 0.27
101 0.26
102 0.21
103 0.14
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.21
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.19
159 0.28
160 0.29
161 0.32
162 0.34
163 0.39
164 0.41
165 0.37
166 0.37
167 0.29
168 0.3
169 0.29
170 0.26
171 0.21
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.18
176 0.16
177 0.18
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.16
189 0.19
190 0.24
191 0.29
192 0.34
193 0.41
194 0.48
195 0.53
196 0.6
197 0.67
198 0.73
199 0.72
200 0.75
201 0.78
202 0.78
203 0.76
204 0.68
205 0.58
206 0.48
207 0.44
208 0.39
209 0.31
210 0.25
211 0.24
212 0.25
213 0.26
214 0.25
215 0.23
216 0.21
217 0.23
218 0.21
219 0.2
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.16
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.14
259 0.2
260 0.24
261 0.29
262 0.35
263 0.38
264 0.41
265 0.42
266 0.4
267 0.36
268 0.32
269 0.27
270 0.22
271 0.2
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.14
288 0.22
289 0.31
290 0.42
291 0.46
292 0.47
293 0.48
294 0.52
295 0.49
296 0.47
297 0.46
298 0.41
299 0.37
300 0.37
301 0.35
302 0.3
303 0.28
304 0.22
305 0.14
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.15
344 0.17
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.11
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.13
369 0.13
370 0.15
371 0.18
372 0.19
373 0.19
374 0.19
375 0.18
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.17
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.11
387 0.12
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.15
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.17
404 0.16
405 0.17
406 0.21
407 0.2
408 0.21
409 0.21
410 0.2
411 0.19
412 0.17
413 0.14
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.14
435 0.15
436 0.16
437 0.16
438 0.17
439 0.19
440 0.19
441 0.18
442 0.14
443 0.14
444 0.15
445 0.23
446 0.27
447 0.27
448 0.28
449 0.28
450 0.29
451 0.31
452 0.29
453 0.25
454 0.22
455 0.21
456 0.23
457 0.22
458 0.19
459 0.18
460 0.16
461 0.14
462 0.13
463 0.1
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.13
485 0.12
486 0.15
487 0.14
488 0.15
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.17
493 0.16
494 0.14
495 0.15
496 0.15
497 0.2
498 0.25
499 0.27
500 0.25
501 0.26
502 0.25
503 0.24
504 0.26
505 0.22
506 0.19
507 0.18
508 0.15
509 0.14
510 0.15
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.16
516 0.21
517 0.22
518 0.24
519 0.26
520 0.23
521 0.26
522 0.33
523 0.33
524 0.31
525 0.36
526 0.34
527 0.33
528 0.37
529 0.39
530 0.35
531 0.37
532 0.39
533 0.42
534 0.46
535 0.46
536 0.46
537 0.49
538 0.5
539 0.49
540 0.49
541 0.45
542 0.41
543 0.38
544 0.38
545 0.28
546 0.24
547 0.23
548 0.18
549 0.14
550 0.13
551 0.16
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.14
556 0.19
557 0.19
558 0.22
559 0.28
560 0.3
561 0.34
562 0.35
563 0.43
564 0.44
565 0.45
566 0.45
567 0.45
568 0.47
569 0.46
570 0.5
571 0.42
572 0.4
573 0.43
574 0.48
575 0.48
576 0.46
577 0.46
578 0.42
579 0.41
580 0.4
581 0.36
582 0.3
583 0.26
584 0.22
585 0.21
586 0.2
587 0.18
588 0.15
589 0.14
590 0.12
591 0.09
592 0.1
593 0.1
594 0.09
595 0.12
596 0.12
597 0.12
598 0.15
599 0.16
600 0.16