FuNGI

A0A550CJH2

Protein Details

Accession

A0A550CJH2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
222-246	GQVNKFSHVKRKRDDPKYSNQQKNS	Hydrophilic
257-285	GQKKPGRGKRGSGKDKKAKGKQNTGNGGH	Basic
800-824	LRALTFWRRAERKKQHNPKRTIFMA	Hydrophilic
1045-1073	HRESEEPIKRRPGRPRKNKVGSGSRKTPA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
258-277	QKKPGRGKRGSGKDKKAKGK
1052-1070	IKRRPGRPRKNKVGSGSRK
1149-1184	PAAKKAKLNTGVARATKAAATKAAAKGKGKGKGTRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 8.5, cyto_mito 7, mito 4.5

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MYRSPKEMLVIGASSIIMSNALFTQVPLLDGHNYRKWAQAVTAHLMSYGVFDVVSGDRETRPSPIAATANSSSNDDEIRQWKSDDQKANGTLQCRISPEIMTGIPDASKASAHALWEYLESEFDSPQPAEIFSWYKTAFNFRFRANEHPDPQISVLNDMFARLTQEGETLSDFFKAMLMLNATPVASIVEHVLQSFAKDKLTPAVVREALLTHYTHKQDLQGQVNKFSHVKRKRDDPKYSNQQKNSGSSSNSDGNAGQKKPGRGKRGSGKDKKAKGKQNTGNGGHAHSHAAVSEIAGSISVGSLTVAPPAPKSSHVALITPAGTSVRKVKEKAPINDDEAVANTEISRGVKNVFALAEQIDVPVTFESFRTLDKVVNDGGIPKDDEAMGSPTPRASASTLTLDNAPPAKRARTGEHPDVADAMQQQEFQSFLLDSGSNEMPIEPPLTLRAKSHSATVSLCLNPRNVRKLSASSQNLINGGPNGEINHWVGTPLDDILLEMPEDDLEDPFEYLPDPSEFSPSSRAPSPEGTEFSEPPSSSAPPSDSEEWPTTSEAPSEDLESEEPNPEEPEPEEPESSPPKYGRFRVQEDCVADHNGTRHTITFHHTLPHDDLFNATPRAETAFRPKSDPPERYPIPDSCDRCHSCRRSVYFQSPVVKNQLTAEYNALMAEYERDGLHGLRPEVAVNRLAIEGYTYAFNRGKEVNLYIANKVAHTYWLIRVHFHTEGHTFGCPTSMYETITAQPPVSRGEKGKAFIVPAQYHPEGLEDREMLVSIIAAIVYKRLWGLSHGPVFTQEVEETLRALTFWRRAERKKQHNPKRTIFMALTQAQHACNGFGAQEGSDALLWAFIVPMQPAREVFEDDTLWRNLCQALHDRAVAIKTYVERTGSQKLRRVSNDRPFYFNEDAHNRYMPNILCYKRDHFDADRDWLERALALGIIKRSFKMRANGTATAPDPVKDKNFKPIARAMPDQPTEVGAKNKTVRVLMYAVKIGGKRHWTPFIAAPGDNWATYEEVFHPNFDISAVKRDSTLGPYSFVTFCQAAYAHRESEEPIKRRPGRPRKNKVGSGSRKTPAVTSLSPSQHSKLYKQLYVKNSKEVMLEEEEDNDRAVCETDEEFEPQQSDDEDGEETDEEFSRLESEIVTPATKGAPAAKKAKLNTGVARATKAAATKAAAKGKGKGKGTRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.11
3	0.09
4	0.06
5	0.05
6	0.07
7	0.06
8	0.08
9	0.08
10	0.08
11	0.11
12	0.11
13	0.13
14	0.12
15	0.14
16	0.18
17	0.22
18	0.29
19	0.31
20	0.35
21	0.35
22	0.41
23	0.4
24	0.37
25	0.37
26	0.36
27	0.37
28	0.4
29	0.4
30	0.34
31	0.32
32	0.29
33	0.25
34	0.21
35	0.15
36	0.09
37	0.07
38	0.07
39	0.09
40	0.1
41	0.12
42	0.12
43	0.13
44	0.14
45	0.18
46	0.19
47	0.2
48	0.21
49	0.2
50	0.21
51	0.24
52	0.27
53	0.25
54	0.29
55	0.28
56	0.3
57	0.3
58	0.3
59	0.25
60	0.23
61	0.23
62	0.19
63	0.23
64	0.24
65	0.28
66	0.28
67	0.29
68	0.33
69	0.4
70	0.48
71	0.5
72	0.5
73	0.53
74	0.54
75	0.59
76	0.57
77	0.51
78	0.48
79	0.43
80	0.41
81	0.36
82	0.36
83	0.3
84	0.28
85	0.27
86	0.25
87	0.22
88	0.2
89	0.18
90	0.16
91	0.15
92	0.14
93	0.13
94	0.1
95	0.1
96	0.09
97	0.13
98	0.13
99	0.14
100	0.15
101	0.15
102	0.15
103	0.16
104	0.16
105	0.12
106	0.12
107	0.11
108	0.12
109	0.11
110	0.11
111	0.14
112	0.12
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.13
117	0.16
118	0.19
119	0.16
120	0.22
121	0.21
122	0.22
123	0.23
124	0.31
125	0.32
126	0.37
127	0.39
128	0.36
129	0.43
130	0.44
131	0.52
132	0.51
133	0.56
134	0.52
135	0.55
136	0.54
137	0.49
138	0.48
139	0.43
140	0.34
141	0.29
142	0.25
143	0.21
144	0.2
145	0.17
146	0.16
147	0.12
148	0.15
149	0.11
150	0.12
151	0.1
152	0.11
153	0.12
154	0.13
155	0.14
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.08
164	0.09
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.09
181	0.11
182	0.14
183	0.13
184	0.13
185	0.13
186	0.15
187	0.18
188	0.23
189	0.23
190	0.22
191	0.28
192	0.27
193	0.27
194	0.26
195	0.23
196	0.2
197	0.2
198	0.19
199	0.15
200	0.21
201	0.22
202	0.23
203	0.23
204	0.25
205	0.3
206	0.36
207	0.42
208	0.43
209	0.43
210	0.5
211	0.49
212	0.48
213	0.46
214	0.43
215	0.44
216	0.46
217	0.53
218	0.51
219	0.61
220	0.69
221	0.76
222	0.82
223	0.78
224	0.8
225	0.83
226	0.88
227	0.86
228	0.8
229	0.78
230	0.71
231	0.69
232	0.64
233	0.56
234	0.47
235	0.41
236	0.41
237	0.37
238	0.33
239	0.29
240	0.24
241	0.27
242	0.31
243	0.3
244	0.3
245	0.31
246	0.37
247	0.45
248	0.52
249	0.54
250	0.52
251	0.6
252	0.65
253	0.72
254	0.77
255	0.77
256	0.79
257	0.81
258	0.85
259	0.87
260	0.86
261	0.85
262	0.83
263	0.84
264	0.81
265	0.81
266	0.81
267	0.74
268	0.69
269	0.61
270	0.54
271	0.45
272	0.38
273	0.3
274	0.21
275	0.18
276	0.13
277	0.13
278	0.1
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.04
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.09
296	0.11
297	0.13
298	0.14
299	0.18
300	0.18
301	0.23
302	0.24
303	0.23
304	0.22
305	0.23
306	0.22
307	0.18
308	0.16
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.17
313	0.21
314	0.25
315	0.28
316	0.32
317	0.4
318	0.49
319	0.54
320	0.53
321	0.5
322	0.5
323	0.51
324	0.46
325	0.38
326	0.29
327	0.24
328	0.18
329	0.14
330	0.1
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.11
358	0.12
359	0.14
360	0.14
361	0.16
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.13
366	0.13
367	0.12
368	0.12
369	0.1
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.09
383	0.11
384	0.12
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.16
390	0.16
391	0.18
392	0.16
393	0.16
394	0.18
395	0.19
396	0.22
397	0.25
398	0.28
399	0.34
400	0.42
401	0.44
402	0.46
403	0.44
404	0.4
405	0.38
406	0.33
407	0.25
408	0.18
409	0.14
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.06
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.06
431	0.06
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.13
436	0.16
437	0.19
438	0.2
439	0.23
440	0.2
441	0.2
442	0.2
443	0.21
444	0.2
445	0.18
446	0.19
447	0.17
448	0.19
449	0.22
450	0.26
451	0.31
452	0.28
453	0.3
454	0.31
455	0.34
456	0.36
457	0.4
458	0.39
459	0.34
460	0.35
461	0.33
462	0.31
463	0.26
464	0.22
465	0.13
466	0.11
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.03
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.07
500	0.06
501	0.08
502	0.08
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.17
507	0.16
508	0.18
509	0.19
510	0.2
511	0.19
512	0.21
513	0.23
514	0.21
515	0.22
516	0.22
517	0.22
518	0.21
519	0.21
520	0.22
521	0.19
522	0.18
523	0.17
524	0.15
525	0.13
526	0.14
527	0.13
528	0.12
529	0.16
530	0.18
531	0.17
532	0.2
533	0.21
534	0.21
535	0.21
536	0.2
537	0.17
538	0.14
539	0.14
540	0.1
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.08
552	0.09
553	0.08
554	0.09
555	0.09
556	0.11
557	0.13
558	0.15
559	0.15
560	0.14
561	0.18
562	0.21
563	0.21
564	0.2
565	0.17
566	0.21
567	0.24
568	0.27
569	0.32
570	0.34
571	0.38
572	0.4
573	0.42
574	0.41
575	0.38
576	0.37
577	0.3
578	0.26
579	0.21
580	0.17
581	0.16
582	0.13
583	0.12
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.11
588	0.14
589	0.16
590	0.16
591	0.18
592	0.18
593	0.19
594	0.2
595	0.2
596	0.17
597	0.14
598	0.14
599	0.12
600	0.14
601	0.13
602	0.11
603	0.09
604	0.09
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.19
609	0.24
610	0.25
611	0.29
612	0.3
613	0.37
614	0.43
615	0.46
616	0.4
617	0.43
618	0.43
619	0.44
620	0.46
621	0.39
622	0.36
623	0.39
624	0.38
625	0.31
626	0.39
627	0.37
628	0.37
629	0.44
630	0.43
631	0.43
632	0.47
633	0.5
634	0.49
635	0.52
636	0.53
637	0.5
638	0.51
639	0.51
640	0.46
641	0.43
642	0.4
643	0.34
644	0.29
645	0.25
646	0.25
647	0.19
648	0.18
649	0.18
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.11
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.06
662	0.07
663	0.09
664	0.1
665	0.11
666	0.11
667	0.11
668	0.12
669	0.12
670	0.13
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.09
675	0.09
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.06
682	0.1
683	0.12
684	0.12
685	0.14
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.16
690	0.15
691	0.18
692	0.19
693	0.17
694	0.2
695	0.19
696	0.17
697	0.17
698	0.14
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.14
703	0.2
704	0.21
705	0.21
706	0.22
707	0.25
708	0.26
709	0.24
710	0.22
711	0.17
712	0.18
713	0.18
714	0.17
715	0.13
716	0.11
717	0.12
718	0.1
719	0.09
720	0.11
721	0.1
722	0.11
723	0.11
724	0.13
725	0.13
726	0.15
727	0.15
728	0.12
729	0.12
730	0.12
731	0.14
732	0.16
733	0.16
734	0.16
735	0.2
736	0.23
737	0.24
738	0.25
739	0.23
740	0.22
741	0.23
742	0.26
743	0.23
744	0.22
745	0.26
746	0.24
747	0.23
748	0.22
749	0.21
750	0.17
751	0.16
752	0.16
753	0.1
754	0.11
755	0.1
756	0.1
757	0.08
758	0.07
759	0.06
760	0.04
761	0.04
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.08
772	0.13
773	0.18
774	0.22
775	0.22
776	0.22
777	0.22
778	0.24
779	0.21
780	0.18
781	0.12
782	0.09
783	0.11
784	0.11
785	0.1
786	0.09
787	0.08
788	0.07
789	0.08
790	0.11
791	0.14
792	0.18
793	0.26
794	0.33
795	0.39
796	0.5
797	0.59
798	0.67
799	0.73
800	0.8
801	0.83
802	0.87
803	0.9
804	0.85
805	0.83
806	0.73
807	0.67
808	0.57
809	0.49
810	0.45
811	0.4
812	0.34
813	0.28
814	0.27
815	0.22
816	0.23
817	0.2
818	0.13
819	0.1
820	0.09
821	0.08
822	0.07
823	0.08
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.04
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.05
838	0.07
839	0.08
840	0.1
841	0.1
842	0.13
843	0.14
844	0.16
845	0.17
846	0.17
847	0.17
848	0.17
849	0.2
850	0.18
851	0.18
852	0.15
853	0.15
854	0.15
855	0.14
856	0.16
857	0.19
858	0.22
859	0.24
860	0.24
861	0.23
862	0.23
863	0.24
864	0.21
865	0.15
866	0.12
867	0.12
868	0.15
869	0.16
870	0.16
871	0.17
872	0.21
873	0.3
874	0.35
875	0.39
876	0.42
877	0.46
878	0.52
879	0.57
880	0.6
881	0.6
882	0.63
883	0.68
884	0.64
885	0.63
886	0.58
887	0.58
888	0.55
889	0.46
890	0.43
891	0.39
892	0.4
893	0.38
894	0.37
895	0.3
896	0.28
897	0.31
898	0.25
899	0.23
900	0.27
901	0.26
902	0.29
903	0.33
904	0.36
905	0.34
906	0.36
907	0.37
908	0.33
909	0.38
910	0.39
911	0.41
912	0.39
913	0.38
914	0.36
915	0.31
916	0.27
917	0.2
918	0.16
919	0.11
920	0.09
921	0.08
922	0.1
923	0.12
924	0.15
925	0.15
926	0.16
927	0.18
928	0.22
929	0.26
930	0.31
931	0.34
932	0.41
933	0.46
934	0.48
935	0.47
936	0.46
937	0.42
938	0.38
939	0.33
940	0.25
941	0.21
942	0.21
943	0.26
944	0.29
945	0.29
946	0.36
947	0.44
948	0.44
949	0.47
950	0.52
951	0.53
952	0.53
953	0.55
954	0.49
955	0.5
956	0.5
957	0.46
958	0.38
959	0.32
960	0.29
961	0.28
962	0.29
963	0.22
964	0.27
965	0.29
966	0.31
967	0.31
968	0.3
969	0.28
970	0.26
971	0.28
972	0.26
973	0.25
974	0.24
975	0.22
976	0.24
977	0.25
978	0.24
979	0.25
980	0.29
981	0.31
982	0.35
983	0.4
984	0.39
985	0.41
986	0.44
987	0.46
988	0.42
989	0.38
990	0.33
991	0.32
992	0.32
993	0.28
994	0.23
995	0.17
996	0.15
997	0.15
998	0.17
999	0.14
1000	0.19
1001	0.19
1002	0.19
1003	0.19
1004	0.18
1005	0.18
1006	0.17
1007	0.17
1008	0.13
1009	0.21
1010	0.22
1011	0.21
1012	0.21
1013	0.23
1014	0.24
1015	0.26
1016	0.3
1017	0.23
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.27
1021	0.25
1022	0.24
1023	0.23
1024	0.17
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.16
1028	0.14
1029	0.21
1030	0.24
1031	0.21
1032	0.21
1033	0.22
1034	0.22
1035	0.32
1036	0.39
1037	0.37
1038	0.4
1039	0.49
1040	0.56
1041	0.63
1042	0.72
1043	0.74
1044	0.75
1045	0.83
1046	0.87
1047	0.88
1048	0.91
1049	0.9
1050	0.89
1051	0.88
1052	0.88
1053	0.85
1054	0.83
1055	0.74
1056	0.67
1057	0.6
1058	0.52
1059	0.45
1060	0.41
1061	0.34
1062	0.31
1063	0.36
1064	0.37
1065	0.4
1066	0.42
1067	0.4
1068	0.4
1069	0.41
1070	0.39
1071	0.4
1072	0.43
1073	0.45
1074	0.5
1075	0.56
1076	0.59
1077	0.66
1078	0.66
1079	0.65
1080	0.6
1081	0.56
1082	0.51
1083	0.44
1084	0.39
1085	0.33
1086	0.33
1087	0.25
1088	0.26
1089	0.26
1090	0.25
1091	0.24
1092	0.19
1093	0.15
1094	0.13
1095	0.13
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.14
1100	0.16
1101	0.2
1102	0.2
1103	0.21
1104	0.21
1105	0.19
1106	0.2
1107	0.17
1108	0.18
1109	0.14
1110	0.14
1111	0.14
1112	0.13
1113	0.14
1114	0.13
1115	0.12
1116	0.12
1117	0.12
1118	0.11
1119	0.1
1120	0.1
1121	0.1
1122	0.11
1123	0.1
1124	0.09
1125	0.1
1126	0.13
1127	0.15
1128	0.15
1129	0.14
1130	0.14
1131	0.15
1132	0.15
1133	0.14
1134	0.2
1135	0.25
1136	0.31
1137	0.38
1138	0.43
1139	0.49
1140	0.51
1141	0.59
1142	0.57
1143	0.57
1144	0.56
1145	0.57
1146	0.58
1147	0.54
1148	0.54
1149	0.46
1150	0.4
1151	0.36
1152	0.32
1153	0.26
1154	0.22
1155	0.23
1156	0.27
1157	0.33
1158	0.39
1159	0.42
1160	0.42
1161	0.48
1162	0.53
1163	0.59
1164	0.59

A0A550CJH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer