Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C9W1

Protein Details
Accession A0A550C9W1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-225TSPTTRPSSGKRPRRRPSTRASPRPRPQPIVEKKPTRQPPPEKQDPSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-217SSGKRPRRRPSTRASPRPRPQPIVEKKPTRQPP
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.333, mito 11, nucl 10.5, cyto_mito 6.833, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR040250  Nucleobindin  
Gene Ontology GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13499  EF-hand_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS50222  EF_HAND_2  
Amino Acid Sequences MKSFARRLSFIAFATSVLAHGGHHDSPGPEKGETIQEYAQRHMSKEHHIDSFDLPSFFQLHDLDGDGVWSRAEIEAIYGVHHVYSQKKSKDDVEHQKKADTIVETVLEKMDTNKDGEIALEEFVVVGLTGLPNFDNLGAEGHHYDIESEFFLHHEEEFHSTPETQTDESYNHPRTSSTSPTTRPSSGKRPRRRPSTRASPRPRPQPIVEKKPTRQPPPEKQDPSVRFAGAKDEAGKMGEWGSGEEGYKTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.07
7 0.1
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.15
12 0.15
13 0.19
14 0.24
15 0.24
16 0.2
17 0.2
18 0.22
19 0.27
20 0.27
21 0.27
22 0.26
23 0.28
24 0.31
25 0.32
26 0.37
27 0.31
28 0.31
29 0.33
30 0.33
31 0.36
32 0.41
33 0.42
34 0.38
35 0.38
36 0.39
37 0.35
38 0.37
39 0.31
40 0.24
41 0.2
42 0.18
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.11
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.12
71 0.18
72 0.26
73 0.29
74 0.31
75 0.34
76 0.39
77 0.45
78 0.5
79 0.55
80 0.58
81 0.61
82 0.6
83 0.59
84 0.53
85 0.46
86 0.4
87 0.29
88 0.2
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.03
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.17
156 0.25
157 0.27
158 0.25
159 0.25
160 0.25
161 0.27
162 0.32
163 0.34
164 0.31
165 0.34
166 0.36
167 0.41
168 0.45
169 0.44
170 0.43
171 0.43
172 0.49
173 0.54
174 0.61
175 0.67
176 0.73
177 0.8
178 0.86
179 0.89
180 0.85
181 0.85
182 0.86
183 0.86
184 0.86
185 0.86
186 0.86
187 0.86
188 0.89
189 0.86
190 0.81
191 0.76
192 0.76
193 0.77
194 0.76
195 0.77
196 0.76
197 0.73
198 0.77
199 0.8
200 0.77
201 0.78
202 0.77
203 0.79
204 0.79
205 0.85
206 0.8
207 0.76
208 0.78
209 0.72
210 0.67
211 0.6
212 0.51
213 0.42
214 0.37
215 0.38
216 0.3
217 0.29
218 0.26
219 0.24
220 0.24
221 0.23
222 0.23
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.14