FuNGI

A0A550C7N8

Protein Details

Accession

A0A550C7N8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
44-70	LAECEEFRRIRPKKKPGQETQPEQEVK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
54-58	RPKKK

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 13, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002575 Aminoglycoside_PTrfase IPR011009 Kinase-like_dom_sf IPR010920 LSM_dom_sf IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01636 APH PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01717 Sm_B

Amino Acid Sequences

MPPPKSKGGKMLGLINWRIKVTINDGRQLVGQMLAFDRHMNLVLAECEEFRRIRPKKKPGQETQPEQEVKRALGLVILRGETVVSLSVESPPPVQEDDKKSALPVGPGRVGAPPFQGPPMGFPPPGMPGPPPALQAGRLASRPALVVLEVLPSWTVRPTSMKVMISLCERARNGANCANGQDHSKRILPQARGAEDEEDVGEDAYVVLDVEAEGTWKDCNVNLHIQASRQDWKLPAKKFWLARRIFRILNRAVEDVEVASTLLAPLEASVLSIWARLQRTTSTEAHALRYLRSVGLDIPIPRLILSCVYRGTTYTVMTRVPGTNMMHAIRQGNLTPNVVKTVASEVSIALGELDTLRQSPSDAGKVMMSASGHDLPDPVVFFEDRSGPYPSVIELWAHCGDYSDLAEMMGDVDQETLDIMAADPIRYVHPDMRLYNIIVRDGHLSGIIDWEDSGWFPSSWQVHTLRWPRIGCSGPWLQYWLEYWFSEEAEAAYVASKSFLIKSPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.51
3	0.47
4	0.41
5	0.39
6	0.33
7	0.31
8	0.32
9	0.36
10	0.35
11	0.38
12	0.38
13	0.38
14	0.37
15	0.35
16	0.28
17	0.21
18	0.17
19	0.13
20	0.14
21	0.15
22	0.14
23	0.14
24	0.14
25	0.13
26	0.14
27	0.13
28	0.11
29	0.12
30	0.12
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.16
36	0.16
37	0.18
38	0.28
39	0.35
40	0.44
41	0.54
42	0.64
43	0.71
44	0.81
45	0.88
46	0.87
47	0.9
48	0.9
49	0.88
50	0.84
51	0.83
52	0.76
53	0.67
54	0.62
55	0.53
56	0.43
57	0.36
58	0.29
59	0.2
60	0.19
61	0.19
62	0.17
63	0.17
64	0.16
65	0.14
66	0.13
67	0.13
68	0.1
69	0.1
70	0.08
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.1
75	0.11
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.14
80	0.16
81	0.18
82	0.23
83	0.29
84	0.34
85	0.36
86	0.35
87	0.34
88	0.35
89	0.34
90	0.31
91	0.28
92	0.27
93	0.26
94	0.26
95	0.27
96	0.26
97	0.26
98	0.21
99	0.21
100	0.18
101	0.17
102	0.18
103	0.19
104	0.15
105	0.19
106	0.22
107	0.22
108	0.2
109	0.2
110	0.2
111	0.22
112	0.23
113	0.2
114	0.16
115	0.16
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.2
123	0.2
124	0.18
125	0.17
126	0.16
127	0.15
128	0.15
129	0.14
130	0.12
131	0.1
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.12
145	0.14
146	0.19
147	0.24
148	0.24
149	0.25
150	0.25
151	0.26
152	0.25
153	0.27
154	0.22
155	0.22
156	0.22
157	0.22
158	0.26
159	0.26
160	0.28
161	0.28
162	0.29
163	0.25
164	0.27
165	0.26
166	0.22
167	0.24
168	0.21
169	0.19
170	0.2
171	0.22
172	0.22
173	0.27
174	0.33
175	0.31
176	0.35
177	0.38
178	0.36
179	0.36
180	0.35
181	0.3
182	0.23
183	0.22
184	0.15
185	0.1
186	0.09
187	0.07
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.02
195	0.02
196	0.02
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.06
206	0.08
207	0.11
208	0.14
209	0.15
210	0.18
211	0.18
212	0.19
213	0.21
214	0.22
215	0.23
216	0.2
217	0.2
218	0.21
219	0.28
220	0.35
221	0.34
222	0.35
223	0.36
224	0.4
225	0.44
226	0.48
227	0.49
228	0.45
229	0.47
230	0.5
231	0.5
232	0.47
233	0.44
234	0.44
235	0.37
236	0.37
237	0.34
238	0.28
239	0.24
240	0.22
241	0.19
242	0.13
243	0.1
244	0.06
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.02
251	0.02
252	0.02
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.14
267	0.19
268	0.2
269	0.19
270	0.23
271	0.23
272	0.24
273	0.26
274	0.23
275	0.19
276	0.19
277	0.17
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.09
282	0.09
283	0.11
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.14
298	0.16
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.14
305	0.16
306	0.13
307	0.13
308	0.16
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.17
314	0.18
315	0.18
316	0.14
317	0.14
318	0.14
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.17
323	0.17
324	0.18
325	0.17
326	0.16
327	0.12
328	0.14
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.09
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.09
347	0.11
348	0.14
349	0.14
350	0.14
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.13
355	0.1
356	0.08
357	0.12
358	0.13
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.16
373	0.19
374	0.18
375	0.19
376	0.19
377	0.18
378	0.16
379	0.15
380	0.13
381	0.1
382	0.15
383	0.16
384	0.16
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.15
389	0.15
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.06
397	0.05
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.12
414	0.15
415	0.16
416	0.21
417	0.27
418	0.27
419	0.32
420	0.33
421	0.33
422	0.34
423	0.32
424	0.29
425	0.24
426	0.25
427	0.22
428	0.2
429	0.19
430	0.15
431	0.14
432	0.12
433	0.15
434	0.13
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.09
439	0.09
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.16
445	0.19
446	0.2
447	0.25
448	0.26
449	0.26
450	0.36
451	0.44
452	0.45
453	0.49
454	0.49
455	0.47
456	0.51
457	0.51
458	0.42
459	0.41
460	0.42
461	0.37
462	0.37
463	0.37
464	0.3
465	0.28
466	0.3
467	0.26
468	0.22
469	0.2
470	0.22
471	0.2
472	0.2
473	0.19
474	0.17
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.12

A0A550C7N8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer