FuNGI

C5DBS1

Protein Details

Accession

C5DBS1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-62	HEVLRKSRSQLKRIEERRRLDLKN	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 9.5, nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
KEGG	lth:KLTH0A04906g -
Pfam	View protein in Pfam PF13041 PPR_2

Amino Acid Sequences

MVRKATIVNLTTFLRGLHVQVPNCASQLRDRITHFERNHEVLRKSRSQLKRIEERRRLDLKNLNKTPYSQQHARHVLKRKYEVPSEDLDSTKLGPTSESDLRFLKLTHDKRLLYTILGVTGEQLRDSKLIAADVSKFLSRNQLEKAVFLARLAKSRGVVGMNKVIEHFCQVKQDAGSAIDMYNWRKKWDIPPNEFTHTILFDGLANVKQPLSEKQSQRVLKIAKLLLEREEMNIAGFNASLSALANSVNVEYAFELFDARKKQISPDAITYTILLRALSLTQDDKLCMARLDAVMASVPRKFLDGRVVYEYCHVLHNRKDSMLSKMAIKALANFFDINIPLEKISFPAGVNLPSLQFWDVKQRFDSNKFVADLFFQNCERNKLYELAWETYKAWNSENPRLLELPVHERMIRIVTAAFPTKCAEMATEVFKNVNLRHRSGKNGMLLVYRAFERQAGKKFINDSESNVDKLLTQLFDFSIELEGKHWKELGTRVLNWKAWMFCWNVVNKANERRKISNERAKWILDQYLRTILTGQTNRAGIQHEDHAGLRHVGLESVRFLSSFADHFKIKGESELNDFVSEHDRQFFLYRRLLLRFKDRILEQVKILEGRPGSAESVEESIKQTAEKLLATKLPDQA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.19
4	0.23
5	0.27
6	0.27
7	0.31
8	0.35
9	0.33
10	0.33
11	0.31
12	0.25
13	0.26
14	0.33
15	0.33
16	0.35
17	0.36
18	0.43
19	0.49
20	0.57
21	0.52
22	0.52
23	0.54
24	0.54
25	0.59
26	0.58
27	0.57
28	0.55
29	0.61
30	0.59
31	0.58
32	0.63
33	0.64
34	0.64
35	0.68
36	0.7
37	0.73
38	0.76
39	0.82
40	0.81
41	0.78
42	0.8
43	0.8
44	0.74
45	0.72
46	0.71
47	0.7
48	0.72
49	0.72
50	0.67
51	0.59
52	0.6
53	0.6
54	0.61
55	0.59
56	0.55
57	0.55
58	0.61
59	0.69
60	0.72
61	0.71
62	0.73
63	0.71
64	0.73
65	0.74
66	0.71
67	0.67
68	0.68
69	0.64
70	0.57
71	0.54
72	0.5
73	0.46
74	0.4
75	0.34
76	0.28
77	0.25
78	0.23
79	0.19
80	0.15
81	0.13
82	0.14
83	0.2
84	0.25
85	0.25
86	0.26
87	0.27
88	0.28
89	0.28
90	0.26
91	0.27
92	0.31
93	0.34
94	0.4
95	0.45
96	0.45
97	0.46
98	0.5
99	0.44
100	0.34
101	0.33
102	0.25
103	0.19
104	0.19
105	0.16
106	0.13
107	0.15
108	0.14
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.13
119	0.14
120	0.15
121	0.16
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.23
126	0.23
127	0.25
128	0.27
129	0.33
130	0.32
131	0.32
132	0.34
133	0.28
134	0.26
135	0.23
136	0.26
137	0.19
138	0.24
139	0.25
140	0.24
141	0.22
142	0.22
143	0.24
144	0.21
145	0.22
146	0.21
147	0.25
148	0.24
149	0.24
150	0.24
151	0.22
152	0.19
153	0.21
154	0.2
155	0.15
156	0.2
157	0.2
158	0.22
159	0.21
160	0.22
161	0.2
162	0.18
163	0.17
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.14
168	0.16
169	0.22
170	0.22
171	0.23
172	0.24
173	0.28
174	0.35
175	0.44
176	0.5
177	0.5
178	0.57
179	0.61
180	0.63
181	0.6
182	0.51
183	0.43
184	0.33
185	0.26
186	0.18
187	0.13
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.1
197	0.14
198	0.2
199	0.27
200	0.29
201	0.35
202	0.44
203	0.46
204	0.45
205	0.47
206	0.42
207	0.36
208	0.39
209	0.34
210	0.3
211	0.3
212	0.3
213	0.24
214	0.24
215	0.23
216	0.18
217	0.17
218	0.13
219	0.11
220	0.11
221	0.09
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.1
245	0.12
246	0.13
247	0.15
248	0.15
249	0.17
250	0.23
251	0.27
252	0.26
253	0.28
254	0.3
255	0.28
256	0.28
257	0.26
258	0.2
259	0.17
260	0.14
261	0.09
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.16
291	0.17
292	0.19
293	0.24
294	0.24
295	0.23
296	0.24
297	0.24
298	0.16
299	0.17
300	0.16
301	0.14
302	0.17
303	0.22
304	0.21
305	0.21
306	0.23
307	0.22
308	0.25
309	0.26
310	0.23
311	0.2
312	0.2
313	0.21
314	0.19
315	0.17
316	0.15
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.18
346	0.2
347	0.21
348	0.22
349	0.27
350	0.3
351	0.34
352	0.39
353	0.3
354	0.31
355	0.31
356	0.29
357	0.24
358	0.22
359	0.21
360	0.17
361	0.17
362	0.15
363	0.18
364	0.19
365	0.23
366	0.22
367	0.21
368	0.21
369	0.21
370	0.21
371	0.22
372	0.24
373	0.22
374	0.21
375	0.21
376	0.2
377	0.22
378	0.23
379	0.19
380	0.17
381	0.19
382	0.24
383	0.31
384	0.35
385	0.33
386	0.33
387	0.32
388	0.32
389	0.29
390	0.25
391	0.24
392	0.21
393	0.21
394	0.19
395	0.19
396	0.19
397	0.19
398	0.16
399	0.11
400	0.09
401	0.09
402	0.11
403	0.15
404	0.14
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.13
413	0.16
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.17
418	0.19
419	0.19
420	0.26
421	0.25
422	0.27
423	0.35
424	0.37
425	0.42
426	0.44
427	0.46
428	0.4
429	0.39
430	0.37
431	0.3
432	0.29
433	0.23
434	0.2
435	0.16
436	0.13
437	0.11
438	0.13
439	0.15
440	0.21
441	0.27
442	0.32
443	0.32
444	0.35
445	0.38
446	0.38
447	0.4
448	0.35
449	0.31
450	0.33
451	0.34
452	0.31
453	0.28
454	0.25
455	0.19
456	0.19
457	0.18
458	0.11
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.11
464	0.1
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.11
469	0.17
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.15
474	0.18
475	0.22
476	0.3
477	0.29
478	0.32
479	0.38
480	0.43
481	0.43
482	0.42
483	0.41
484	0.33
485	0.29
486	0.29
487	0.25
488	0.23
489	0.27
490	0.28
491	0.29
492	0.33
493	0.36
494	0.38
495	0.46
496	0.51
497	0.52
498	0.57
499	0.57
500	0.61
501	0.67
502	0.71
503	0.71
504	0.68
505	0.67
506	0.65
507	0.62
508	0.56
509	0.5
510	0.47
511	0.4
512	0.36
513	0.33
514	0.36
515	0.34
516	0.31
517	0.29
518	0.24
519	0.29
520	0.29
521	0.28
522	0.26
523	0.26
524	0.27
525	0.27
526	0.28
527	0.21
528	0.21
529	0.23
530	0.21
531	0.22
532	0.22
533	0.23
534	0.21
535	0.2
536	0.17
537	0.15
538	0.13
539	0.13
540	0.13
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.14
545	0.13
546	0.13
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.17
551	0.19
552	0.19
553	0.19
554	0.23
555	0.24
556	0.23
557	0.26
558	0.25
559	0.23
560	0.29
561	0.33
562	0.3
563	0.28
564	0.28
565	0.24
566	0.26
567	0.26
568	0.21
569	0.2
570	0.19
571	0.2
572	0.25
573	0.29
574	0.3
575	0.35
576	0.38
577	0.4
578	0.47
579	0.5
580	0.5
581	0.54
582	0.55
583	0.51
584	0.54
585	0.5
586	0.52
587	0.51
588	0.49
589	0.41
590	0.39
591	0.39
592	0.34
593	0.34
594	0.3
595	0.25
596	0.23
597	0.24
598	0.21
599	0.19
600	0.18
601	0.18
602	0.15
603	0.18
604	0.17
605	0.17
606	0.18
607	0.18
608	0.18
609	0.18
610	0.17
611	0.18
612	0.19
613	0.2
614	0.19
615	0.22
616	0.25
617	0.29

C5DBS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer