FuNGI

A0A550CK60

Protein Details

Accession

A0A550CK60

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
712-740	RVQHHSGAQRPRVRRRWPAEHAGRGRRAL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
350-361	RGVRRRARPAKA
719-740	AQRPRVRRRWPAEHAGRGRRAL

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 7, mito 3, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012310 DNA_ligase_ATP-dep_cent IPR016059 DNA_ligase_ATP-dep_CS IPR012308 DNA_ligase_ATP-dep_N IPR036599 DNA_ligase_N_sf IPR029710 LIG4 IPR012340 NA-bd_OB-fold
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0003910 F:DNA ligase (ATP) activity GO:0051103 P:DNA ligation involved in DNA repair GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF01068 DNA_ligase_A_M PF04675 DNA_ligase_A_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00697 DNA_LIGASE_A1 PS00333 DNA_LIGASE_A2 PS50160 DNA_LIGASE_A3

Amino Acid Sequences

MAQHFLTHFPEPPPHTTRIVFCLLFPELDYYRKYHLQEAKLAQAVAQALSLSHSRLVTWKEAGSTGCLGREIRKALEHKSSNLDEASRLSVDEVNDLLDELASLSPNSDASIHTKYPRDIRRSRHEILSVLFRRLNPTDAGVLAQIILKDLIPLLYPVKLTGYGSELRAYNTKSVKHLLVQDAMDVWDPSGRLRRLHRTHANLRYATEAFERNEEEFKPHVGVMIPIIHSIKLQGVKNAFNTFAARSSRVWVETKYDGERAQIHVQIMSDGTSHITIYSKSGRNSTLDRIAVHWIVRQALGLPDPENGYEGRPDCRVTKSVILDAEMVAWDTDHVDEFWRIRSLVERTARGVRRRARPAKAKTLHQDLHDGYSQSSLMSDCDEDTCEEAHLSLVFFDIMVLNDESLLGRPYAHRRALLESVVQPISNYCMFSERYPVDIPRTSQSQQDSDTEDDEPSDKVSSPPSTHAQRALTQLYRIFAQHLVQRREGVVIKAEESFYNDYCRQWGKLKRDYIPGYGDTLDLALIGAAWDKERARTLGVSPSAYTTFYIGALTNAEDRKKNPSIKPNYHVYFVSSYGLSRRQLEDMTSRINARSTVLFSDLRMTNPKNTPIGHPELEYTLRLYDGLAKPHIVFCEPMLAEVYGAGFDVSRGSKPFDTLFAATISSLPSFGLSFFWYSPHTTALDTYFLAALRTALPPYLQDPQHRGPAAHRVQHHSGAQRPRVRRRWPAEHAGRGRRALASHDGGPTRRREWQTQAWP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.45
3	0.45
4	0.46
5	0.43
6	0.45
7	0.38
8	0.33
9	0.34
10	0.3
11	0.27
12	0.25
13	0.25
14	0.2
15	0.24
16	0.25
17	0.24
18	0.28
19	0.34
20	0.35
21	0.39
22	0.45
23	0.46
24	0.53
25	0.55
26	0.55
27	0.52
28	0.5
29	0.41
30	0.36
31	0.32
32	0.23
33	0.19
34	0.12
35	0.09
36	0.11
37	0.12
38	0.11
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.17
43	0.21
44	0.23
45	0.25
46	0.26
47	0.25
48	0.27
49	0.27
50	0.25
51	0.25
52	0.22
53	0.2
54	0.21
55	0.2
56	0.23
57	0.28
58	0.28
59	0.27
60	0.33
61	0.35
62	0.39
63	0.48
64	0.47
65	0.44
66	0.49
67	0.48
68	0.44
69	0.42
70	0.37
71	0.29
72	0.27
73	0.27
74	0.2
75	0.18
76	0.16
77	0.17
78	0.17
79	0.17
80	0.15
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.1
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.09
97	0.13
98	0.19
99	0.22
100	0.26
101	0.3
102	0.33
103	0.42
104	0.49
105	0.53
106	0.55
107	0.61
108	0.67
109	0.71
110	0.71
111	0.68
112	0.63
113	0.56
114	0.52
115	0.54
116	0.46
117	0.41
118	0.4
119	0.34
120	0.36
121	0.35
122	0.35
123	0.25
124	0.25
125	0.22
126	0.2
127	0.21
128	0.15
129	0.13
130	0.11
131	0.11
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.18
153	0.17
154	0.18
155	0.22
156	0.22
157	0.25
158	0.27
159	0.28
160	0.29
161	0.32
162	0.32
163	0.32
164	0.35
165	0.33
166	0.32
167	0.3
168	0.27
169	0.24
170	0.23
171	0.2
172	0.14
173	0.11
174	0.09
175	0.09
176	0.1
177	0.18
178	0.19
179	0.23
180	0.29
181	0.39
182	0.44
183	0.54
184	0.6
185	0.61
186	0.69
187	0.73
188	0.74
189	0.65
190	0.6
191	0.55
192	0.46
193	0.39
194	0.32
195	0.27
196	0.21
197	0.23
198	0.23
199	0.2
200	0.22
201	0.21
202	0.21
203	0.19
204	0.19
205	0.18
206	0.16
207	0.16
208	0.14
209	0.14
210	0.12
211	0.14
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.12
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.15
220	0.16
221	0.19
222	0.21
223	0.23
224	0.27
225	0.27
226	0.24
227	0.2
228	0.21
229	0.18
230	0.2
231	0.2
232	0.19
233	0.18
234	0.21
235	0.22
236	0.23
237	0.24
238	0.2
239	0.23
240	0.23
241	0.26
242	0.25
243	0.25
244	0.23
245	0.23
246	0.24
247	0.24
248	0.24
249	0.24
250	0.21
251	0.2
252	0.2
253	0.18
254	0.16
255	0.12
256	0.09
257	0.06
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.06
264	0.09
265	0.16
266	0.19
267	0.2
268	0.23
269	0.24
270	0.26
271	0.29
272	0.3
273	0.29
274	0.26
275	0.26
276	0.25
277	0.27
278	0.25
279	0.22
280	0.2
281	0.15
282	0.14
283	0.14
284	0.12
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.11
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.15
301	0.16
302	0.18
303	0.19
304	0.19
305	0.23
306	0.22
307	0.24
308	0.23
309	0.22
310	0.19
311	0.18
312	0.15
313	0.1
314	0.08
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.14
330	0.15
331	0.21
332	0.24
333	0.23
334	0.25
335	0.33
336	0.38
337	0.37
338	0.43
339	0.43
340	0.48
341	0.57
342	0.62
343	0.63
344	0.68
345	0.7
346	0.73
347	0.7
348	0.67
349	0.62
350	0.63
351	0.57
352	0.48
353	0.47
354	0.36
355	0.35
356	0.3
357	0.26
358	0.18
359	0.16
360	0.15
361	0.1
362	0.1
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.04
395	0.05
396	0.07
397	0.13
398	0.18
399	0.2
400	0.2
401	0.21
402	0.25
403	0.27
404	0.26
405	0.22
406	0.17
407	0.19
408	0.18
409	0.17
410	0.13
411	0.11
412	0.13
413	0.11
414	0.1
415	0.07
416	0.1
417	0.11
418	0.12
419	0.17
420	0.15
421	0.17
422	0.18
423	0.19
424	0.21
425	0.22
426	0.23
427	0.2
428	0.24
429	0.22
430	0.25
431	0.26
432	0.24
433	0.24
434	0.24
435	0.25
436	0.21
437	0.22
438	0.19
439	0.17
440	0.15
441	0.14
442	0.12
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.11
448	0.13
449	0.14
450	0.18
451	0.22
452	0.25
453	0.26
454	0.29
455	0.28
456	0.29
457	0.31
458	0.32
459	0.27
460	0.25
461	0.25
462	0.22
463	0.21
464	0.18
465	0.16
466	0.13
467	0.14
468	0.16
469	0.24
470	0.26
471	0.26
472	0.27
473	0.26
474	0.28
475	0.27
476	0.24
477	0.19
478	0.16
479	0.16
480	0.16
481	0.17
482	0.14
483	0.16
484	0.17
485	0.14
486	0.19
487	0.18
488	0.18
489	0.21
490	0.22
491	0.22
492	0.27
493	0.35
494	0.38
495	0.45
496	0.51
497	0.52
498	0.58
499	0.59
500	0.54
501	0.5
502	0.42
503	0.36
504	0.31
505	0.26
506	0.18
507	0.15
508	0.11
509	0.07
510	0.06
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.11
521	0.12
522	0.13
523	0.15
524	0.17
525	0.22
526	0.23
527	0.23
528	0.21
529	0.22
530	0.21
531	0.2
532	0.19
533	0.12
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.12
542	0.14
543	0.16
544	0.17
545	0.18
546	0.26
547	0.33
548	0.39
549	0.42
550	0.5
551	0.59
552	0.65
553	0.69
554	0.7
555	0.65
556	0.6
557	0.54
558	0.46
559	0.38
560	0.32
561	0.28
562	0.19
563	0.17
564	0.17
565	0.22
566	0.2
567	0.2
568	0.21
569	0.22
570	0.22
571	0.24
572	0.25
573	0.24
574	0.26
575	0.25
576	0.25
577	0.23
578	0.24
579	0.21
580	0.19
581	0.18
582	0.16
583	0.16
584	0.19
585	0.18
586	0.18
587	0.23
588	0.23
589	0.23
590	0.27
591	0.28
592	0.31
593	0.35
594	0.39
595	0.37
596	0.37
597	0.4
598	0.4
599	0.44
600	0.38
601	0.35
602	0.32
603	0.31
604	0.31
605	0.27
606	0.22
607	0.16
608	0.14
609	0.13
610	0.12
611	0.18
612	0.19
613	0.23
614	0.23
615	0.24
616	0.24
617	0.27
618	0.28
619	0.2
620	0.18
621	0.14
622	0.21
623	0.19
624	0.19
625	0.19
626	0.18
627	0.16
628	0.16
629	0.15
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.04
634	0.04
635	0.07
636	0.08
637	0.1
638	0.12
639	0.16
640	0.17
641	0.2
642	0.21
643	0.21
644	0.24
645	0.24
646	0.23
647	0.2
648	0.19
649	0.17
650	0.16
651	0.15
652	0.11
653	0.1
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.11
661	0.11
662	0.13
663	0.15
664	0.17
665	0.18
666	0.19
667	0.19
668	0.17
669	0.19
670	0.19
671	0.19
672	0.17
673	0.16
674	0.15
675	0.14
676	0.14
677	0.12
678	0.11
679	0.1
680	0.12
681	0.12
682	0.11
683	0.11
684	0.13
685	0.16
686	0.23
687	0.25
688	0.29
689	0.36
690	0.4
691	0.48
692	0.48
693	0.45
694	0.41
695	0.48
696	0.51
697	0.49
698	0.5
699	0.49
700	0.53
701	0.58
702	0.59
703	0.55
704	0.56
705	0.59
706	0.63
707	0.64
708	0.68
709	0.73
710	0.77
711	0.8
712	0.82
713	0.82
714	0.84
715	0.83
716	0.85
717	0.84
718	0.85
719	0.85
720	0.84
721	0.8
722	0.72
723	0.66
724	0.58
725	0.49
726	0.44
727	0.42
728	0.37
729	0.35
730	0.38
731	0.4
732	0.41
733	0.45
734	0.45
735	0.42
736	0.47
737	0.49
738	0.5
739	0.54

A0A550CK60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer