FuNGI

A0A550C9P1

Protein Details

Accession

A0A550C9P1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
233-257	NLNPIKASQRKPRRANIQKRDWAHV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 11.5, nucl 7, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MDPRGHAELVEQAAGASSGSSQDFLEQLGLAGLPSKEDVHRQIEEKLLLSRAELPSHWLSTYQITWETKPEIPALLDLHPSPAPTSLTFVRSGLNGRVSGYTEVVNPRVSTALNSSSLTRAPASSANFVRGKSGHVPFLPGGLEDVIISRDSVDMSEDEKKQLRTVAPGLSRGLRLPGDPKEDTVLHDLEDIYPSMDGDMEADGDAYDGHAEPEAVISGITEIDELLPTTRANLNPIKASQRKPRRANIQKRDWAHVIDVNKPLNNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKQAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSQNVGILTGDVQINPEANCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVSIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTAQRPVPLEHYLYAGRDLFKIVDAKRNFLGQGYKDAGEALRRKQDKEREAAGLAPVQRVGARGAAQARGGRGGASGGRTMHVDKNLYVHLLGNLRKRNLLPVVVFTLSKKRCEENASTLTNQDLCTSVEKSEVHVAVEKALSRLKAPDRKLPQIARMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKELVEILFARGLVKMLFATETFAMGVNMPAKCVVFSGIRKHDGRSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVANDSLPEQTALHTMVLGTPGKLISQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENASQRLLPDQQKRVVESEKKLATFERLECDICLPSVESYYDNSYDVVNMNQRLLSMAVAHPQGARLLSAGRVVVLNDGHFKKNTIAALLRQAPVQASDDGVLSKVRTYYVLHLSIQQPKAGILVDINMEAIPPTWPPEANSLPVDDAVYELAAVPLTSISLVTARTIKVEVDAIVDRHLISRMRDGLAQLSALADEWASAKEIPEIDWSRMRALEFQEILRNRSGLVKRSRDSTCLQCPDFGRHYTIIHAEKVLRANIANLKLAISDQNLELIPDYEQRIEVLKELKFIDENSTVSLKGRVACEINSANELVLTELILENTLANYNPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPVFPPKLQEGREAIMAISDRVGATQDRHKVAAEDFRSNLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITALTDVAEGTIVRVINRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEESQIKIKRDIVFAASLYF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.12
3	0.07
4	0.05
5	0.07
6	0.08
7	0.09
8	0.08
9	0.1
10	0.1
11	0.11
12	0.11
13	0.09
14	0.09
15	0.09
16	0.08
17	0.07
18	0.1
19	0.09
20	0.09
21	0.1
22	0.13
23	0.14
24	0.2
25	0.25
26	0.28
27	0.33
28	0.34
29	0.37
30	0.4
31	0.4
32	0.37
33	0.35
34	0.31
35	0.27
36	0.26
37	0.3
38	0.26
39	0.27
40	0.25
41	0.28
42	0.29
43	0.31
44	0.3
45	0.24
46	0.23
47	0.25
48	0.26
49	0.23
50	0.25
51	0.26
52	0.28
53	0.32
54	0.34
55	0.32
56	0.33
57	0.32
58	0.27
59	0.25
60	0.27
61	0.25
62	0.22
63	0.22
64	0.2
65	0.23
66	0.21
67	0.21
68	0.19
69	0.19
70	0.19
71	0.17
72	0.22
73	0.21
74	0.24
75	0.24
76	0.24
77	0.22
78	0.22
79	0.25
80	0.24
81	0.24
82	0.22
83	0.23
84	0.24
85	0.25
86	0.25
87	0.23
88	0.2
89	0.2
90	0.23
91	0.24
92	0.24
93	0.21
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.18
98	0.19
99	0.21
100	0.21
101	0.22
102	0.23
103	0.23
104	0.24
105	0.24
106	0.2
107	0.16
108	0.17
109	0.2
110	0.23
111	0.28
112	0.28
113	0.33
114	0.34
115	0.34
116	0.35
117	0.31
118	0.33
119	0.33
120	0.35
121	0.34
122	0.32
123	0.36
124	0.32
125	0.34
126	0.29
127	0.21
128	0.19
129	0.14
130	0.13
131	0.09
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.09
141	0.08
142	0.12
143	0.19
144	0.2
145	0.24
146	0.29
147	0.3
148	0.3
149	0.34
150	0.32
151	0.32
152	0.34
153	0.37
154	0.35
155	0.37
156	0.38
157	0.35
158	0.34
159	0.29
160	0.29
161	0.22
162	0.21
163	0.24
164	0.27
165	0.31
166	0.31
167	0.31
168	0.32
169	0.32
170	0.33
171	0.32
172	0.26
173	0.2
174	0.21
175	0.2
176	0.16
177	0.17
178	0.14
179	0.1
180	0.1
181	0.09
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.1
217	0.14
218	0.14
219	0.19
220	0.23
221	0.25
222	0.28
223	0.31
224	0.37
225	0.4
226	0.47
227	0.53
228	0.59
229	0.67
230	0.71
231	0.77
232	0.79
233	0.83
234	0.88
235	0.87
236	0.87
237	0.85
238	0.81
239	0.79
240	0.7
241	0.61
242	0.52
243	0.46
244	0.38
245	0.35
246	0.37
247	0.33
248	0.32
249	0.31
250	0.29
251	0.27
252	0.29
253	0.24
254	0.19
255	0.22
256	0.21
257	0.22
258	0.22
259	0.21
260	0.2
261	0.2
262	0.21
263	0.15
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.17
269	0.19
270	0.25
271	0.27
272	0.26
273	0.26
274	0.25
275	0.26
276	0.26
277	0.27
278	0.21
279	0.19
280	0.19
281	0.17
282	0.17
283	0.14
284	0.1
285	0.06
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.11
313	0.12
314	0.14
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.2
319	0.22
320	0.22
321	0.26
322	0.34
323	0.35
324	0.44
325	0.45
326	0.51
327	0.54
328	0.55
329	0.61
330	0.53
331	0.47
332	0.45
333	0.48
334	0.44
335	0.44
336	0.45
337	0.34
338	0.35
339	0.32
340	0.24
341	0.18
342	0.15
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.09
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.15
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.11
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.07
382	0.06
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.07
389	0.09
390	0.09
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.04
411	0.03
412	0.03
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.11
424	0.15
425	0.15
426	0.21
427	0.29
428	0.32
429	0.35
430	0.38
431	0.4
432	0.39
433	0.44
434	0.4
435	0.37
436	0.39
437	0.41
438	0.4
439	0.38
440	0.36
441	0.31
442	0.3
443	0.24
444	0.21
445	0.19
446	0.19
447	0.17
448	0.16
449	0.18
450	0.17
451	0.17
452	0.17
453	0.15
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.1
458	0.11
459	0.15
460	0.14
461	0.22
462	0.22
463	0.24
464	0.24
465	0.25
466	0.23
467	0.21
468	0.23
469	0.16
470	0.21
471	0.2
472	0.2
473	0.19
474	0.19
475	0.17
476	0.19
477	0.21
478	0.19
479	0.25
480	0.26
481	0.29
482	0.36
483	0.44
484	0.43
485	0.46
486	0.45
487	0.4
488	0.39
489	0.38
490	0.31
491	0.26
492	0.21
493	0.16
494	0.13
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.13
506	0.13
507	0.12
508	0.11
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.07
513	0.08
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.11
519	0.13
520	0.14
521	0.14
522	0.13
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.13
527	0.11
528	0.11
529	0.14
530	0.17
531	0.21
532	0.24
533	0.25
534	0.26
535	0.26
536	0.27
537	0.25
538	0.24
539	0.19
540	0.17
541	0.19
542	0.18
543	0.18
544	0.15
545	0.22
546	0.21
547	0.23
548	0.23
549	0.22
550	0.24
551	0.29
552	0.32
553	0.3
554	0.35
555	0.35
556	0.34
557	0.32
558	0.3
559	0.26
560	0.23
561	0.15
562	0.11
563	0.09
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.13
568	0.13
569	0.14
570	0.16
571	0.16
572	0.14
573	0.15
574	0.15
575	0.13
576	0.14
577	0.12
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.09
582	0.13
583	0.18
584	0.25
585	0.27
586	0.34
587	0.38
588	0.42
589	0.48
590	0.46
591	0.47
592	0.49
593	0.48
594	0.42
595	0.38
596	0.35
597	0.31
598	0.3
599	0.23
600	0.15
601	0.13
602	0.11
603	0.1
604	0.09
605	0.08
606	0.07
607	0.06
608	0.06
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.03
617	0.04
618	0.03
619	0.04
620	0.04
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.05
632	0.04
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.09
649	0.09
650	0.12
651	0.19
652	0.22
653	0.27
654	0.28
655	0.3
656	0.34
657	0.37
658	0.39
659	0.39
660	0.39
661	0.34
662	0.39
663	0.38
664	0.33
665	0.31
666	0.27
667	0.21
668	0.17
669	0.17
670	0.11
671	0.12
672	0.11
673	0.08
674	0.09
675	0.1
676	0.1
677	0.11
678	0.12
679	0.13
680	0.13
681	0.13
682	0.13
683	0.12
684	0.12
685	0.11
686	0.1
687	0.08
688	0.08
689	0.07
690	0.06
691	0.05
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.04
697	0.04
698	0.05
699	0.06
700	0.07
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.09
706	0.08
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.09
712	0.09
713	0.09
714	0.13
715	0.14
716	0.15
717	0.2
718	0.2
719	0.21
720	0.21
721	0.21
722	0.17
723	0.16
724	0.15
725	0.11
726	0.1
727	0.08
728	0.07
729	0.06
730	0.05
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.08
735	0.1
736	0.13
737	0.14
738	0.13
739	0.14
740	0.15
741	0.17
742	0.17
743	0.22
744	0.25
745	0.28
746	0.3
747	0.29
748	0.29
749	0.29
750	0.33
751	0.33
752	0.35
753	0.35
754	0.37
755	0.39
756	0.4
757	0.4
758	0.42
759	0.41
760	0.37
761	0.4
762	0.38
763	0.37
764	0.36
765	0.33
766	0.3
767	0.28
768	0.26
769	0.22
770	0.21
771	0.21
772	0.21
773	0.22
774	0.18
775	0.14
776	0.13
777	0.1
778	0.08
779	0.09
780	0.09
781	0.08
782	0.1
783	0.12
784	0.12
785	0.12
786	0.12
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.13
792	0.12
793	0.13
794	0.12
795	0.12
796	0.12
797	0.12
798	0.1
799	0.08
800	0.08
801	0.11
802	0.11
803	0.11
804	0.1
805	0.1
806	0.11
807	0.1
808	0.09
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.08
813	0.08
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.13
821	0.16
822	0.17
823	0.18
824	0.19
825	0.18
826	0.22
827	0.21
828	0.18
829	0.18
830	0.18
831	0.24
832	0.27
833	0.26
834	0.22
835	0.22
836	0.2
837	0.19
838	0.2
839	0.13
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.1
844	0.1
845	0.09
846	0.07
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.09
851	0.11
852	0.15
853	0.2
854	0.23
855	0.22
856	0.26
857	0.29
858	0.36
859	0.35
860	0.3
861	0.25
862	0.23
863	0.23
864	0.19
865	0.15
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.07
870	0.08
871	0.06
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.05
876	0.05
877	0.08
878	0.09
879	0.1
880	0.12
881	0.18
882	0.19
883	0.22
884	0.22
885	0.2
886	0.2
887	0.2
888	0.18
889	0.12
890	0.1
891	0.07
892	0.06
893	0.05
894	0.05
895	0.04
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.03
900	0.04
901	0.04
902	0.03
903	0.04
904	0.05
905	0.05
906	0.07
907	0.09
908	0.09
909	0.1
910	0.11
911	0.11
912	0.11
913	0.12
914	0.11
915	0.12
916	0.14
917	0.13
918	0.13
919	0.14
920	0.13
921	0.12
922	0.15
923	0.14
924	0.14
925	0.19
926	0.21
927	0.21
928	0.22
929	0.22
930	0.22
931	0.2
932	0.19
933	0.13
934	0.11
935	0.09
936	0.08
937	0.07
938	0.05
939	0.04
940	0.05
941	0.06
942	0.07
943	0.07
944	0.07
945	0.1
946	0.11
947	0.11
948	0.19
949	0.21
950	0.23
951	0.27
952	0.27
953	0.27
954	0.28
955	0.28
956	0.24
957	0.25
958	0.28
959	0.25
960	0.26
961	0.32
962	0.32
963	0.34
964	0.31
965	0.28
966	0.22
967	0.29
968	0.31
969	0.32
970	0.4
971	0.45
972	0.45
973	0.52
974	0.53
975	0.49
976	0.5
977	0.49
978	0.5
979	0.49
980	0.48
981	0.46
982	0.46
983	0.49
984	0.49
985	0.43
986	0.38
987	0.32
988	0.32
989	0.3
990	0.35
991	0.31
992	0.27
993	0.27
994	0.24
995	0.26
996	0.28
997	0.27
998	0.21
999	0.19
1000	0.22
1001	0.25
1002	0.27
1003	0.25
1004	0.21
1005	0.21
1006	0.2
1007	0.2
1008	0.18
1009	0.14
1010	0.13
1011	0.12
1012	0.14
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.12
1017	0.12
1018	0.13
1019	0.15
1020	0.13
1021	0.14
1022	0.14
1023	0.16
1024	0.16
1025	0.18
1026	0.2
1027	0.19
1028	0.22
1029	0.22
1030	0.23
1031	0.22
1032	0.22
1033	0.24
1034	0.22
1035	0.22
1036	0.22
1037	0.22
1038	0.21
1039	0.21
1040	0.22
1041	0.19
1042	0.19
1043	0.2
1044	0.2
1045	0.21
1046	0.21
1047	0.26
1048	0.26
1049	0.25
1050	0.24
1051	0.23
1052	0.19
1053	0.17
1054	0.17
1055	0.12
1056	0.09
1057	0.07
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.06
1064	0.07
1065	0.08
1066	0.07
1067	0.08
1068	0.09
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.09
1074	0.1
1075	0.09
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.12
1085	0.13
1086	0.16
1087	0.2
1088	0.21
1089	0.21
1090	0.26
1091	0.3
1092	0.3
1093	0.3
1094	0.29
1095	0.3
1096	0.35
1097	0.35
1098	0.36
1099	0.36
1100	0.33
1101	0.35
1102	0.33
1103	0.27
1104	0.24
1105	0.23
1106	0.17
1107	0.14
1108	0.12
1109	0.1
1110	0.09
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.14
1114	0.21
1115	0.28
1116	0.3
1117	0.31
1118	0.32
1119	0.32
1120	0.34
1121	0.4
1122	0.37
1123	0.35
1124	0.34
1125	0.4
1126	0.41
1127	0.39
1128	0.36
1129	0.27
1130	0.23
1131	0.18
1132	0.24
1133	0.17
1134	0.16
1135	0.15
1136	0.19
1137	0.18
1138	0.17
1139	0.17
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.11
1143	0.11
1144	0.13
1145	0.14
1146	0.15
1147	0.15
1148	0.16
1149	0.18
1150	0.2
1151	0.19
1152	0.13
1153	0.13
1154	0.12
1155	0.1
1156	0.1
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.09
1160	0.09
1161	0.09
1162	0.12
1163	0.13
1164	0.16
1165	0.19
1166	0.21
1167	0.22
1168	0.25
1169	0.32
1170	0.34
1171	0.35
1172	0.34
1173	0.33
1174	0.33
1175	0.37
1176	0.37
1177	0.32
1178	0.3
1179	0.28
1180	0.26
1181	0.25
1182	0.24
1183	0.18
1184	0.16
1185	0.17
1186	0.16
1187	0.15
1188	0.16
1189	0.15
1190	0.23
1191	0.27
1192	0.31
1193	0.38
1194	0.47
1195	0.52
1196	0.53
1197	0.57
1198	0.53
1199	0.51
1200	0.48
1201	0.41
1202	0.35

A0A550C9P1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer