Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550C0D0

Protein Details
Accession A0A550C0D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1221-1248GGDAPTSPRKKSKNKKDMKNQKGDYIMKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-317KLNGKPKKNATKAAAGPKQRVSKKDAAAKAAKTKATKKASK
1229-1236RKKSKNKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSSPIGSWDLSASMTCVALPPSAVARDEHTLQLQLALDVSPPGKVQQALLEDAQRRLFTYVFPPSYPKVTLPRNAVDIPFFYSILHPAPMPASRSVQDYAQPMDLKPTLLPFQRRSVHFLLGHEGLGFSADGNLIPKPASSFSFWDKVTSGGRDFYLNRLSSAVSLTGPEDTNPALGAILAEEPGLGKTLETISLILLTRAKDAQRNPSQKRWDSEAKVDVRTVKTTLIVTPVTLAAQWCEELANHAPSLKVLVYDGWTNVPVPIFRKQSEYDRVHKLNGKPKKNATKAAAGPKQRVSKKDAAAKAAKTKATKKASKSATPVVDADAEYPQDFPEWVNSYDVVIVTYRVLASELARPRRQDVVYANVDRPRSPLVICEWSRVVMDEVQMVGGGKTEDMVSLIPRNASYAVSGTPARQQVSDLIHVLRFLRVDDVVGSSRLWNRLMLPAYAAHFTAFIQQYAVRTVKASVKDELTIPQQTRYVVPVEMGRVERHVYDEALDRILFELGLDSRGVAASEGWELDSSLLRTLQRQLGDKVVKAPLKSMEQGARETGKNTMDDRKSKILLLTRQAQLVQQLAGDPKRERKSLAVLEKALQAAESMQSGHCKGDELKKAYTDAQSEDEADESDAEAGPGEGKQRADSPSTEVSDDSDEAGIPKTPDGDAVHFLLGDINHSQAYAKADELRRTLLKKYLPETEARKAMEVLRKNEETQEIDDDDVPVIEVPYLEKGAPLQWRTHIKEILMKSFRAEEDADGGEYQRSLDEQPTHICWPTRGAMTNERTLLAAHDAKEAKQRKTKAAQQAIGAADDDRDDEEDEEILDQRDVIDLLPEHEVLQKTLSDERKTLYASMQGRSIKSIMTDIHAQGAKLPEKKPEKTDLQDAVARLRVLMKEQSWNWRTTSTPDLAHMRRAFNQRVMRFLTVSGAVEWEGMLDDALTSTDNELVQLDARINTNVARQAISGAPRQEGEEDEDEDEEACILCRCEFGCMKLWISKPEGKTCPVCRVPINPKSLQRFTVDDKKAPPPAQPSKNGEAAPQTRRRIEYNTIDPGTYKDIQAVECEGDYGHKIQTLIRHLLYIQLSDEGAKSIVFSAWADSLFILQNAMRENGIPCLRIDQADAANKFRTDPTMQVLLLHGERENAGLNVTCASRVFLLESVVHHGFEIQAIARIDRMGQTRSTEVYCYYAEDTIEKNILDLAAKRGLSLYTKANALGTVNVSFAGGDAPTSPRKKSKNKKDMKNQKGDYIMKTDDMLAILFPHMFEDLEYLLPEEAMGSVHETMEGEQEARGLPGGSGSGGSGTQQVNAVAGPSRLRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.15
10 0.17
11 0.16
12 0.19
13 0.23
14 0.25
15 0.26
16 0.25
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.22
21 0.17
22 0.16
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.19
34 0.22
35 0.24
36 0.26
37 0.32
38 0.32
39 0.34
40 0.36
41 0.31
42 0.29
43 0.28
44 0.26
45 0.21
46 0.26
47 0.32
48 0.31
49 0.32
50 0.36
51 0.37
52 0.41
53 0.41
54 0.38
55 0.37
56 0.42
57 0.47
58 0.49
59 0.5
60 0.5
61 0.51
62 0.48
63 0.41
64 0.36
65 0.34
66 0.29
67 0.25
68 0.2
69 0.19
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.15
74 0.14
75 0.17
76 0.2
77 0.22
78 0.22
79 0.24
80 0.24
81 0.28
82 0.29
83 0.27
84 0.28
85 0.29
86 0.29
87 0.3
88 0.3
89 0.26
90 0.31
91 0.3
92 0.27
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.31
97 0.38
98 0.36
99 0.44
100 0.5
101 0.52
102 0.55
103 0.53
104 0.54
105 0.49
106 0.47
107 0.44
108 0.37
109 0.35
110 0.28
111 0.24
112 0.16
113 0.14
114 0.12
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.17
128 0.21
129 0.26
130 0.32
131 0.31
132 0.31
133 0.29
134 0.31
135 0.31
136 0.31
137 0.28
138 0.24
139 0.24
140 0.26
141 0.27
142 0.28
143 0.32
144 0.28
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.22
149 0.23
150 0.19
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.17
188 0.19
189 0.23
190 0.27
191 0.36
192 0.44
193 0.53
194 0.58
195 0.64
196 0.72
197 0.72
198 0.73
199 0.7
200 0.7
201 0.64
202 0.65
203 0.64
204 0.59
205 0.54
206 0.51
207 0.49
208 0.42
209 0.4
210 0.34
211 0.26
212 0.24
213 0.24
214 0.22
215 0.21
216 0.18
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.14
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.15
236 0.18
237 0.14
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.21
252 0.25
253 0.25
254 0.3
255 0.32
256 0.39
257 0.47
258 0.5
259 0.49
260 0.53
261 0.55
262 0.55
263 0.59
264 0.58
265 0.58
266 0.62
267 0.63
268 0.61
269 0.69
270 0.74
271 0.74
272 0.75
273 0.69
274 0.69
275 0.68
276 0.7
277 0.68
278 0.62
279 0.6
280 0.59
281 0.63
282 0.59
283 0.56
284 0.53
285 0.54
286 0.57
287 0.61
288 0.58
289 0.56
290 0.57
291 0.58
292 0.58
293 0.55
294 0.52
295 0.48
296 0.51
297 0.54
298 0.57
299 0.6
300 0.57
301 0.61
302 0.64
303 0.65
304 0.65
305 0.63
306 0.56
307 0.52
308 0.47
309 0.39
310 0.34
311 0.27
312 0.23
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.12
322 0.15
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.17
329 0.12
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.15
340 0.21
341 0.28
342 0.31
343 0.32
344 0.34
345 0.4
346 0.39
347 0.37
348 0.34
349 0.35
350 0.39
351 0.41
352 0.41
353 0.38
354 0.39
355 0.34
356 0.33
357 0.28
358 0.22
359 0.19
360 0.19
361 0.2
362 0.28
363 0.29
364 0.3
365 0.27
366 0.26
367 0.26
368 0.25
369 0.21
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.15
401 0.17
402 0.18
403 0.16
404 0.17
405 0.19
406 0.21
407 0.22
408 0.2
409 0.18
410 0.17
411 0.18
412 0.18
413 0.14
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.14
426 0.16
427 0.16
428 0.14
429 0.14
430 0.19
431 0.2
432 0.18
433 0.17
434 0.16
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.14
442 0.13
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.14
447 0.17
448 0.18
449 0.12
450 0.12
451 0.14
452 0.18
453 0.21
454 0.23
455 0.21
456 0.22
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.22
461 0.22
462 0.2
463 0.2
464 0.2
465 0.2
466 0.2
467 0.19
468 0.17
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.14
474 0.15
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.11
482 0.11
483 0.14
484 0.13
485 0.14
486 0.13
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.1
515 0.13
516 0.15
517 0.17
518 0.19
519 0.2
520 0.26
521 0.27
522 0.26
523 0.26
524 0.29
525 0.28
526 0.25
527 0.26
528 0.22
529 0.23
530 0.23
531 0.23
532 0.22
533 0.22
534 0.23
535 0.23
536 0.22
537 0.2
538 0.2
539 0.2
540 0.17
541 0.17
542 0.18
543 0.24
544 0.26
545 0.29
546 0.33
547 0.34
548 0.33
549 0.32
550 0.33
551 0.31
552 0.31
553 0.32
554 0.33
555 0.3
556 0.3
557 0.3
558 0.27
559 0.22
560 0.19
561 0.15
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.11
566 0.14
567 0.14
568 0.21
569 0.24
570 0.25
571 0.25
572 0.25
573 0.31
574 0.36
575 0.41
576 0.36
577 0.33
578 0.34
579 0.34
580 0.32
581 0.24
582 0.17
583 0.1
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.05
588 0.05
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.07
593 0.08
594 0.1
595 0.17
596 0.23
597 0.26
598 0.27
599 0.27
600 0.29
601 0.3
602 0.3
603 0.23
604 0.18
605 0.17
606 0.16
607 0.16
608 0.14
609 0.12
610 0.1
611 0.09
612 0.07
613 0.05
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.03
619 0.04
620 0.04
621 0.05
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.1
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.17
630 0.18
631 0.19
632 0.19
633 0.16
634 0.16
635 0.15
636 0.15
637 0.11
638 0.08
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.1
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.07
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.13
668 0.15
669 0.18
670 0.19
671 0.2
672 0.2
673 0.22
674 0.23
675 0.23
676 0.24
677 0.25
678 0.27
679 0.3
680 0.29
681 0.31
682 0.34
683 0.34
684 0.34
685 0.32
686 0.29
687 0.24
688 0.28
689 0.29
690 0.29
691 0.29
692 0.3
693 0.3
694 0.3
695 0.31
696 0.29
697 0.25
698 0.21
699 0.2
700 0.16
701 0.15
702 0.15
703 0.13
704 0.11
705 0.09
706 0.07
707 0.05
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.03
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.09
718 0.13
719 0.14
720 0.14
721 0.19
722 0.26
723 0.29
724 0.33
725 0.31
726 0.28
727 0.33
728 0.34
729 0.37
730 0.32
731 0.29
732 0.25
733 0.26
734 0.25
735 0.22
736 0.2
737 0.12
738 0.12
739 0.13
740 0.12
741 0.1
742 0.1
743 0.08
744 0.08
745 0.07
746 0.05
747 0.05
748 0.06
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.14
753 0.16
754 0.18
755 0.19
756 0.18
757 0.16
758 0.17
759 0.18
760 0.17
761 0.17
762 0.19
763 0.25
764 0.28
765 0.31
766 0.28
767 0.26
768 0.25
769 0.22
770 0.2
771 0.16
772 0.15
773 0.13
774 0.17
775 0.17
776 0.18
777 0.26
778 0.31
779 0.32
780 0.37
781 0.39
782 0.42
783 0.48
784 0.55
785 0.57
786 0.59
787 0.56
788 0.5
789 0.52
790 0.45
791 0.39
792 0.31
793 0.21
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.05
810 0.06
811 0.06
812 0.05
813 0.06
814 0.05
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.09
819 0.12
820 0.12
821 0.11
822 0.12
823 0.11
824 0.12
825 0.18
826 0.22
827 0.2
828 0.21
829 0.22
830 0.23
831 0.23
832 0.23
833 0.18
834 0.2
835 0.21
836 0.21
837 0.25
838 0.25
839 0.24
840 0.25
841 0.24
842 0.17
843 0.16
844 0.17
845 0.12
846 0.13
847 0.15
848 0.14
849 0.18
850 0.18
851 0.17
852 0.17
853 0.22
854 0.23
855 0.25
856 0.26
857 0.3
858 0.37
859 0.4
860 0.42
861 0.44
862 0.46
863 0.45
864 0.51
865 0.46
866 0.42
867 0.42
868 0.38
869 0.33
870 0.29
871 0.25
872 0.18
873 0.17
874 0.14
875 0.14
876 0.17
877 0.17
878 0.2
879 0.23
880 0.32
881 0.33
882 0.34
883 0.33
884 0.31
885 0.3
886 0.28
887 0.31
888 0.24
889 0.22
890 0.24
891 0.3
892 0.3
893 0.36
894 0.35
895 0.33
896 0.36
897 0.42
898 0.42
899 0.42
900 0.49
901 0.43
902 0.45
903 0.46
904 0.41
905 0.35
906 0.32
907 0.26
908 0.19
909 0.19
910 0.14
911 0.11
912 0.09
913 0.09
914 0.08
915 0.06
916 0.05
917 0.04
918 0.04
919 0.03
920 0.03
921 0.03
922 0.04
923 0.04
924 0.04
925 0.05
926 0.06
927 0.06
928 0.07
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.09
937 0.1
938 0.1
939 0.12
940 0.15
941 0.15
942 0.14
943 0.13
944 0.15
945 0.17
946 0.19
947 0.2
948 0.19
949 0.19
950 0.19
951 0.19
952 0.18
953 0.17
954 0.19
955 0.17
956 0.17
957 0.17
958 0.17
959 0.16
960 0.15
961 0.14
962 0.09
963 0.07
964 0.06
965 0.06
966 0.06
967 0.06
968 0.07
969 0.07
970 0.12
971 0.13
972 0.15
973 0.22
974 0.23
975 0.26
976 0.3
977 0.32
978 0.31
979 0.36
980 0.39
981 0.36
982 0.42
983 0.43
984 0.41
985 0.47
986 0.47
987 0.5
988 0.48
989 0.47
990 0.42
991 0.47
992 0.53
993 0.53
994 0.56
995 0.52
996 0.56
997 0.61
998 0.61
999 0.55
1000 0.49
1001 0.46
1002 0.46
1003 0.5
1004 0.47
1005 0.43
1006 0.44
1007 0.48
1008 0.51
1009 0.48
1010 0.46
1011 0.45
1012 0.51
1013 0.54
1014 0.58
1015 0.58
1016 0.56
1017 0.6
1018 0.56
1019 0.48
1020 0.46
1021 0.46
1022 0.47
1023 0.48
1024 0.48
1025 0.47
1026 0.49
1027 0.51
1028 0.48
1029 0.5
1030 0.49
1031 0.48
1032 0.52
1033 0.49
1034 0.46
1035 0.43
1036 0.39
1037 0.38
1038 0.3
1039 0.24
1040 0.18
1041 0.19
1042 0.19
1043 0.21
1044 0.2
1045 0.15
1046 0.14
1047 0.14
1048 0.11
1049 0.1
1050 0.12
1051 0.12
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.12
1055 0.14
1056 0.2
1057 0.25
1058 0.27
1059 0.26
1060 0.26
1061 0.24
1062 0.29
1063 0.28
1064 0.23
1065 0.18
1066 0.14
1067 0.14
1068 0.14
1069 0.14
1070 0.1
1071 0.09
1072 0.08
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.08
1076 0.08
1077 0.08
1078 0.09
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.1
1082 0.09
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.1
1086 0.09
1087 0.08
1088 0.1
1089 0.12
1090 0.13
1091 0.12
1092 0.12
1093 0.14
1094 0.19
1095 0.21
1096 0.19
1097 0.17
1098 0.2
1099 0.21
1100 0.2
1101 0.21
1102 0.18
1103 0.22
1104 0.29
1105 0.3
1106 0.3
1107 0.32
1108 0.31
1109 0.31
1110 0.28
1111 0.28
1112 0.23
1113 0.24
1114 0.26
1115 0.28
1116 0.28
1117 0.27
1118 0.27
1119 0.26
1120 0.23
1121 0.22
1122 0.17
1123 0.13
1124 0.13
1125 0.13
1126 0.14
1127 0.1
1128 0.11
1129 0.1
1130 0.1
1131 0.11
1132 0.11
1133 0.11
1134 0.1
1135 0.11
1136 0.11
1137 0.11
1138 0.12
1139 0.11
1140 0.13
1141 0.14
1142 0.15
1143 0.2
1144 0.2
1145 0.19
1146 0.17
1147 0.17
1148 0.15
1149 0.14
1150 0.14
1151 0.08
1152 0.12
1153 0.13
1154 0.13
1155 0.13
1156 0.14
1157 0.14
1158 0.17
1159 0.2
1160 0.18
1161 0.19
1162 0.23
1163 0.25
1164 0.27
1165 0.28
1166 0.25
1167 0.23
1168 0.23
1169 0.22
1170 0.21
1171 0.2
1172 0.19
1173 0.18
1174 0.19
1175 0.19
1176 0.19
1177 0.21
1178 0.18
1179 0.16
1180 0.15
1181 0.15
1182 0.15
1183 0.15
1184 0.16
1185 0.2
1186 0.2
1187 0.2
1188 0.2
1189 0.21
1190 0.22
1191 0.24
1192 0.24
1193 0.21
1194 0.23
1195 0.23
1196 0.23
1197 0.22
1198 0.2
1199 0.19
1200 0.16
1201 0.14
1202 0.14
1203 0.13
1204 0.13
1205 0.11
1206 0.1
1207 0.09
1208 0.06
1209 0.06
1210 0.07
1211 0.11
1212 0.19
1213 0.23
1214 0.27
1215 0.35
1216 0.45
1217 0.56
1218 0.65
1219 0.73
1220 0.76
1221 0.83
1222 0.9
1223 0.93
1224 0.95
1225 0.94
1226 0.94
1227 0.86
1228 0.82
1229 0.81
1230 0.75
1231 0.67
1232 0.63
1233 0.54
1234 0.44
1235 0.41
1236 0.34
1237 0.26
1238 0.22
1239 0.18
1240 0.12
1241 0.11
1242 0.11
1243 0.1
1244 0.09
1245 0.09
1246 0.09
1247 0.08
1248 0.08
1249 0.1
1250 0.1
1251 0.11
1252 0.11
1253 0.12
1254 0.11
1255 0.11
1256 0.1
1257 0.08
1258 0.07
1259 0.06
1260 0.07
1261 0.08
1262 0.09
1263 0.09
1264 0.1
1265 0.1
1266 0.1
1267 0.13
1268 0.13
1269 0.11
1270 0.11
1271 0.12
1272 0.12
1273 0.12
1274 0.12
1275 0.09
1276 0.08
1277 0.09
1278 0.09
1279 0.08
1280 0.08
1281 0.08
1282 0.08
1283 0.08
1284 0.09
1285 0.12
1286 0.12
1287 0.13
1288 0.14
1289 0.14
1290 0.13
1291 0.13
1292 0.14
1293 0.12
1294 0.13