FuNGI

C5DHQ5

Protein Details

Accession

C5DHQ5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
643-662	GINYKKKLDEYKKRGNYPTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 8.5, cyto_mito 6, extr 3, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR034352 Rim4_RRM1 IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	lth:KLTH0E06226g -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12453 RRM1_RIM4_like cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MSLESATTAIDPTAAFAAQTSAKDGLLVPDVSDSIAQFLPTEVSSSESEDEEEAGSAAGGSARPPTASDPHPESCGAPESESEFLEELDDISDGEGAGAASKEKDSAPGAGAGAGAGAGAASGIASAHVAPRSGIAASEAAPKFRGRPSSCVFVASLAASLGDDDLCLSVTENFKKFGRLTMVKVLRDPANRPYAFVQYTNDADAKKALKEAQGSSLNGRTIRCGPARVNRTLFVCYKGRNLNSSGLVSAAFVNQLLEKFGELEQLVACRDQFFHRKNNAYSGSDRSNAWFIQFAYRDDAIRAFANLKSDLNWVVEWAQNIEAPSHMNMLSDSKNLVIREETEPENEGACIMPADSYSESSGSEVVIDQKSIFVGQLDPMATEEGVLERFSRHGSILELNLISKPNNVFAFIRFTTEEAAAAALEMENHAMFLNKTMHVQYREIGGIKKFRRGNYNHRNNNNGVHGNHNPSGSGNGSRHESTSNSQAYNQATYQPPRLNLAPPPINVGKRRSSTGSGNYNHHYQHYPFGHEFQVYAHQPHQLSMMGGPKKSKASLRHRNVEITKSIDESNNDSTNTSSNNNNNDTDNLNGGASEKSKGLPNELKSAASQSFVTDVTSDTSGSAGNNDASTNASTSRYTYSAGGINYKKKLDEYKKRGNYPTFDPYYYPPYYYPVEFPLNPMGPSGLAGRAGPGAPLSASGSPAHPGNQPYFMYYPLPQGSGMEFADMHNMMVPHLGGSPGPMGSPIFPLPISQQHFIPSDRSVSFNGEEKAALEY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.08
4	0.11
5	0.13
6	0.14
7	0.16
8	0.16
9	0.15
10	0.16
11	0.17
12	0.16
13	0.18
14	0.17
15	0.14
16	0.14
17	0.15
18	0.15
19	0.15
20	0.12
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.1
25	0.1
26	0.12
27	0.11
28	0.13
29	0.1
30	0.13
31	0.14
32	0.17
33	0.18
34	0.16
35	0.17
36	0.16
37	0.16
38	0.14
39	0.13
40	0.1
41	0.08
42	0.07
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.05
47	0.06
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.11
52	0.15
53	0.2
54	0.23
55	0.29
56	0.33
57	0.35
58	0.37
59	0.37
60	0.33
61	0.31
62	0.33
63	0.27
64	0.22
65	0.21
66	0.21
67	0.22
68	0.21
69	0.2
70	0.15
71	0.14
72	0.14
73	0.13
74	0.1
75	0.09
76	0.08
77	0.06
78	0.06
79	0.07
80	0.05
81	0.05
82	0.05
83	0.04
84	0.05
85	0.06
86	0.06
87	0.07
88	0.07
89	0.09
90	0.08
91	0.12
92	0.13
93	0.14
94	0.15
95	0.16
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.11
100	0.09
101	0.07
102	0.05
103	0.03
104	0.02
105	0.02
106	0.02
107	0.02
108	0.02
109	0.02
110	0.02
111	0.02
112	0.03
113	0.03
114	0.06
115	0.07
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.19
126	0.18
127	0.18
128	0.2
129	0.2
130	0.22
131	0.26
132	0.34
133	0.29
134	0.37
135	0.4
136	0.46
137	0.46
138	0.45
139	0.4
140	0.32
141	0.29
142	0.21
143	0.17
144	0.09
145	0.09
146	0.07
147	0.07
148	0.06
149	0.05
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.09
157	0.14
158	0.19
159	0.2
160	0.23
161	0.23
162	0.27
163	0.27
164	0.28
165	0.33
166	0.31
167	0.34
168	0.42
169	0.47
170	0.44
171	0.45
172	0.44
173	0.4
174	0.4
175	0.39
176	0.36
177	0.39
178	0.38
179	0.39
180	0.38
181	0.38
182	0.36
183	0.35
184	0.3
185	0.24
186	0.25
187	0.25
188	0.25
189	0.19
190	0.18
191	0.2
192	0.19
193	0.16
194	0.18
195	0.18
196	0.19
197	0.23
198	0.24
199	0.27
200	0.3
201	0.3
202	0.3
203	0.32
204	0.3
205	0.28
206	0.27
207	0.23
208	0.22
209	0.26
210	0.25
211	0.26
212	0.28
213	0.35
214	0.41
215	0.44
216	0.43
217	0.4
218	0.41
219	0.41
220	0.38
221	0.33
222	0.31
223	0.27
224	0.31
225	0.35
226	0.34
227	0.33
228	0.35
229	0.34
230	0.32
231	0.31
232	0.25
233	0.19
234	0.17
235	0.15
236	0.12
237	0.09
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.08
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.09
258	0.13
259	0.21
260	0.23
261	0.32
262	0.38
263	0.44
264	0.45
265	0.51
266	0.5
267	0.45
268	0.44
269	0.41
270	0.37
271	0.33
272	0.32
273	0.26
274	0.25
275	0.21
276	0.19
277	0.16
278	0.13
279	0.18
280	0.19
281	0.19
282	0.21
283	0.21
284	0.21
285	0.19
286	0.19
287	0.15
288	0.13
289	0.13
290	0.1
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.12
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.1
317	0.11
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.12
323	0.13
324	0.11
325	0.12
326	0.14
327	0.17
328	0.17
329	0.15
330	0.16
331	0.16
332	0.15
333	0.12
334	0.1
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.03
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.12
396	0.12
397	0.18
398	0.16
399	0.18
400	0.15
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.14
405	0.08
406	0.08
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.04
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.12
424	0.16
425	0.18
426	0.18
427	0.16
428	0.17
429	0.18
430	0.18
431	0.18
432	0.17
433	0.23
434	0.24
435	0.3
436	0.31
437	0.33
438	0.4
439	0.44
440	0.52
441	0.56
442	0.65
443	0.67
444	0.67
445	0.69
446	0.62
447	0.6
448	0.54
449	0.47
450	0.37
451	0.33
452	0.32
453	0.33
454	0.33
455	0.29
456	0.24
457	0.2
458	0.21
459	0.17
460	0.18
461	0.14
462	0.13
463	0.16
464	0.17
465	0.17
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.22
470	0.24
471	0.21
472	0.22
473	0.25
474	0.25
475	0.25
476	0.23
477	0.2
478	0.21
479	0.23
480	0.27
481	0.26
482	0.25
483	0.26
484	0.28
485	0.26
486	0.25
487	0.31
488	0.29
489	0.27
490	0.31
491	0.32
492	0.35
493	0.36
494	0.38
495	0.36
496	0.35
497	0.37
498	0.35
499	0.36
500	0.37
501	0.41
502	0.44
503	0.41
504	0.43
505	0.43
506	0.43
507	0.4
508	0.37
509	0.32
510	0.25
511	0.3
512	0.28
513	0.31
514	0.28
515	0.3
516	0.29
517	0.27
518	0.26
519	0.18
520	0.23
521	0.19
522	0.2
523	0.19
524	0.22
525	0.22
526	0.22
527	0.22
528	0.16
529	0.15
530	0.15
531	0.22
532	0.2
533	0.21
534	0.22
535	0.23
536	0.24
537	0.27
538	0.31
539	0.33
540	0.41
541	0.51
542	0.59
543	0.65
544	0.65
545	0.7
546	0.67
547	0.62
548	0.54
549	0.47
550	0.4
551	0.33
552	0.32
553	0.26
554	0.25
555	0.25
556	0.27
557	0.25
558	0.25
559	0.23
560	0.22
561	0.22
562	0.23
563	0.2
564	0.2
565	0.23
566	0.28
567	0.31
568	0.32
569	0.31
570	0.3
571	0.3
572	0.26
573	0.22
574	0.17
575	0.14
576	0.13
577	0.12
578	0.12
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.11
583	0.16
584	0.16
585	0.22
586	0.27
587	0.29
588	0.35
589	0.36
590	0.36
591	0.32
592	0.35
593	0.29
594	0.24
595	0.21
596	0.14
597	0.15
598	0.14
599	0.14
600	0.1
601	0.1
602	0.11
603	0.12
604	0.11
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.08
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.1
616	0.11
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.12
621	0.14
622	0.17
623	0.16
624	0.17
625	0.17
626	0.18
627	0.2
628	0.21
629	0.27
630	0.29
631	0.34
632	0.36
633	0.37
634	0.36
635	0.35
636	0.45
637	0.48
638	0.54
639	0.57
640	0.64
641	0.72
642	0.78
643	0.83
644	0.79
645	0.73
646	0.69
647	0.69
648	0.62
649	0.55
650	0.5
651	0.46
652	0.46
653	0.43
654	0.38
655	0.29
656	0.28
657	0.3
658	0.29
659	0.28
660	0.26
661	0.3
662	0.28
663	0.31
664	0.35
665	0.33
666	0.31
667	0.3
668	0.25
669	0.19
670	0.2
671	0.19
672	0.12
673	0.11
674	0.11
675	0.11
676	0.12
677	0.12
678	0.11
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.09
683	0.11
684	0.1
685	0.12
686	0.13
687	0.14
688	0.15
689	0.16
690	0.17
691	0.18
692	0.21
693	0.22
694	0.27
695	0.26
696	0.29
697	0.29
698	0.29
699	0.28
700	0.26
701	0.3
702	0.26
703	0.27
704	0.23
705	0.23
706	0.22
707	0.22
708	0.21
709	0.15
710	0.14
711	0.13
712	0.18
713	0.17
714	0.15
715	0.14
716	0.14
717	0.13
718	0.14
719	0.13
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.08
724	0.09
725	0.11
726	0.1
727	0.1
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.15
732	0.14
733	0.15
734	0.14
735	0.16
736	0.19
737	0.27
738	0.31
739	0.29
740	0.29
741	0.32
742	0.35
743	0.35
744	0.35
745	0.28
746	0.29
747	0.28
748	0.3
749	0.28
750	0.3
751	0.31
752	0.33
753	0.32
754	0.27
755	0.26

C5DHQ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer