Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C602

Protein Details
Accession A0A550C602    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-88ANAMEKSKTTRHRPKKGSQHADVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013226  Pal1  
Pfam View protein in Pfam  
PF08316  Pal1  
Amino Acid Sequences MTHGAPPRPPKDVTDAVRETVQVRGQDQQRHRIGRSQSSIPPQTTSRPSPASHRSHSQDSVARTANAMEKSKTTRHRPKKGSQHADVIDRLDFTGVGPMFHHDGPFDACAPSRNRQRNKAPMMAWSGSGAAPEGYVAPGSPYAEPYVPEPPKKKVDAIAEAWGIHEPEPFEEFFAGGDSGNTPASSIYNGRAAALPKHIRDRRDGHLDDGASPRRSGQRTRGTIPPPQPIFVPDSSAVEQSYPVDYTPPAVSPNSAPKRSKSLMQRIRKMRETPNVPVNNDYEGVDPPASPNETRQRPTHRTQNSYMGGGATPRRDRRVEEPSEPFVFIENSAPAHKDLPATPGSKDTPESPPDAAQTGYFDGYSSPGGGGLGRKTSLMKKVGRVVRGRDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.47
4 0.47
5 0.44
6 0.37
7 0.33
8 0.32
9 0.25
10 0.24
11 0.3
12 0.35
13 0.44
14 0.48
15 0.53
16 0.58
17 0.62
18 0.62
19 0.62
20 0.62
21 0.62
22 0.62
23 0.59
24 0.57
25 0.6
26 0.63
27 0.57
28 0.54
29 0.47
30 0.48
31 0.49
32 0.47
33 0.45
34 0.43
35 0.43
36 0.48
37 0.55
38 0.56
39 0.54
40 0.57
41 0.56
42 0.59
43 0.59
44 0.57
45 0.52
46 0.48
47 0.48
48 0.43
49 0.37
50 0.31
51 0.31
52 0.31
53 0.3
54 0.3
55 0.25
56 0.27
57 0.32
58 0.39
59 0.45
60 0.5
61 0.57
62 0.65
63 0.74
64 0.79
65 0.83
66 0.87
67 0.9
68 0.88
69 0.82
70 0.8
71 0.73
72 0.69
73 0.6
74 0.5
75 0.4
76 0.31
77 0.26
78 0.17
79 0.14
80 0.09
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.16
97 0.2
98 0.27
99 0.35
100 0.43
101 0.49
102 0.57
103 0.66
104 0.72
105 0.74
106 0.73
107 0.64
108 0.59
109 0.59
110 0.51
111 0.42
112 0.32
113 0.26
114 0.19
115 0.18
116 0.13
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.2
134 0.22
135 0.27
136 0.3
137 0.33
138 0.38
139 0.39
140 0.39
141 0.35
142 0.38
143 0.38
144 0.37
145 0.35
146 0.3
147 0.28
148 0.27
149 0.22
150 0.17
151 0.12
152 0.11
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.18
182 0.2
183 0.19
184 0.28
185 0.31
186 0.3
187 0.35
188 0.39
189 0.38
190 0.44
191 0.43
192 0.36
193 0.36
194 0.35
195 0.31
196 0.31
197 0.3
198 0.22
199 0.21
200 0.21
201 0.23
202 0.25
203 0.26
204 0.31
205 0.37
206 0.41
207 0.44
208 0.49
209 0.46
210 0.51
211 0.52
212 0.51
213 0.42
214 0.38
215 0.35
216 0.3
217 0.31
218 0.25
219 0.23
220 0.16
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.11
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.13
240 0.24
241 0.28
242 0.34
243 0.34
244 0.35
245 0.43
246 0.44
247 0.48
248 0.47
249 0.51
250 0.55
251 0.63
252 0.7
253 0.71
254 0.77
255 0.76
256 0.72
257 0.69
258 0.69
259 0.65
260 0.62
261 0.63
262 0.6
263 0.55
264 0.52
265 0.45
266 0.38
267 0.33
268 0.28
269 0.2
270 0.15
271 0.17
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.14
278 0.2
279 0.27
280 0.33
281 0.37
282 0.42
283 0.49
284 0.54
285 0.6
286 0.64
287 0.63
288 0.63
289 0.64
290 0.67
291 0.6
292 0.54
293 0.47
294 0.38
295 0.3
296 0.27
297 0.26
298 0.22
299 0.27
300 0.3
301 0.35
302 0.36
303 0.4
304 0.45
305 0.51
306 0.52
307 0.52
308 0.54
309 0.55
310 0.55
311 0.51
312 0.44
313 0.35
314 0.29
315 0.23
316 0.19
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.2
327 0.23
328 0.24
329 0.23
330 0.27
331 0.28
332 0.28
333 0.29
334 0.28
335 0.3
336 0.31
337 0.34
338 0.31
339 0.31
340 0.3
341 0.3
342 0.26
343 0.2
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.15
348 0.13
349 0.12
350 0.14
351 0.14
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.14
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.21
363 0.27
364 0.33
365 0.38
366 0.4
367 0.44
368 0.53
369 0.59
370 0.63
371 0.64