Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1A2

Protein Details
Accession A0A550C1A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34QSRKPTSKSRTKSASLKTKSHydrophilic
67-91ACKPSREKSVPQSKIRTRTKEPDAKHydrophilic
515-534LPTPVPRKGHKQYKPYFFEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR004582  Checkpoint_prot_Rad17_Rad24  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03215  Rad17  
CDD cd18139  HLD_clamp_RarA  
Amino Acid Sequences MPQSPSQSSINKLSQSRKPTSKSRTKSASLKTKSLTPGVIDAQSKRFDPLSVFKEVIDVDALPEVPACKPSREKSVPQSKIRTRTKEPDAKGKGKQYEEEDNRLWVDLYEPTTEAELAVHVKKVASVRTWMKEALEGEKLRKYRRILVLTGPAGTGKTSTVKVLAREMGLDIMEWRNETSANKAPAEWDDYGLDHYAPSPQEAFSTFMTRASRCRDVFSSTARPHIILLEDLPNILHPAVQNSFHESLLGLVRPSDVPLPPIIIVVSDAGLRGTDIDESSARYGKDTVIDVRTILPKELFNGPFVTEIPFNPIAPTLMTRALKAMLAKRPTQPSADFLETLVATANGDIRSAIMALQFTSVASKPGKKGKIDRAVLEAVTRREQSLVLFHLLGKILYNKRKGDAPAPSHSAKDIQKDRDLDKTLKNPAPLPPWLSEHDRKASRVNVDEIYADAPIDSSLMSLYIHQNYTPFCEDVDQCEGVSEWLSWVDSSGGEAWYQANPHRFHLLALGTMHSLPTPVPRKGHKQYKPYFFEALSKEKDAYDGVRDVRSWLEDKWSRTDVITGLGGVLKARDSGPLQARAPSSHRLFTQLKFMRGAAGDEEQLQENEVAVEEEATLDSDQQVDAGYAVDEDRQDGGWLESDDIEDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.66
4 0.66
5 0.67
6 0.71
7 0.75
8 0.78
9 0.78
10 0.79
11 0.79
12 0.77
13 0.8
14 0.8
15 0.8
16 0.75
17 0.75
18 0.68
19 0.66
20 0.63
21 0.57
22 0.49
23 0.4
24 0.39
25 0.35
26 0.37
27 0.33
28 0.32
29 0.34
30 0.35
31 0.33
32 0.31
33 0.29
34 0.25
35 0.27
36 0.33
37 0.31
38 0.33
39 0.33
40 0.3
41 0.32
42 0.3
43 0.26
44 0.19
45 0.15
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.16
54 0.17
55 0.21
56 0.28
57 0.32
58 0.42
59 0.48
60 0.55
61 0.6
62 0.69
63 0.72
64 0.73
65 0.8
66 0.77
67 0.81
68 0.83
69 0.81
70 0.78
71 0.78
72 0.8
73 0.79
74 0.76
75 0.76
76 0.76
77 0.75
78 0.73
79 0.73
80 0.69
81 0.63
82 0.64
83 0.59
84 0.61
85 0.59
86 0.59
87 0.51
88 0.46
89 0.44
90 0.39
91 0.33
92 0.22
93 0.18
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.17
111 0.19
112 0.18
113 0.24
114 0.3
115 0.33
116 0.36
117 0.34
118 0.32
119 0.32
120 0.32
121 0.28
122 0.29
123 0.27
124 0.28
125 0.33
126 0.36
127 0.36
128 0.4
129 0.4
130 0.42
131 0.5
132 0.52
133 0.49
134 0.51
135 0.55
136 0.5
137 0.47
138 0.38
139 0.29
140 0.24
141 0.21
142 0.16
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.21
151 0.22
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.2
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.25
173 0.29
174 0.23
175 0.18
176 0.15
177 0.15
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.16
193 0.15
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.22
198 0.26
199 0.32
200 0.29
201 0.33
202 0.32
203 0.34
204 0.35
205 0.38
206 0.41
207 0.34
208 0.38
209 0.35
210 0.33
211 0.29
212 0.27
213 0.22
214 0.13
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.17
230 0.19
231 0.17
232 0.17
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.1
294 0.1
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.08
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.17
312 0.18
313 0.2
314 0.23
315 0.26
316 0.3
317 0.3
318 0.31
319 0.27
320 0.25
321 0.27
322 0.26
323 0.22
324 0.18
325 0.18
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.23
353 0.27
354 0.29
355 0.36
356 0.43
357 0.52
358 0.52
359 0.49
360 0.46
361 0.43
362 0.4
363 0.35
364 0.28
365 0.2
366 0.21
367 0.19
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.1
381 0.14
382 0.19
383 0.24
384 0.29
385 0.29
386 0.3
387 0.34
388 0.36
389 0.36
390 0.38
391 0.38
392 0.38
393 0.42
394 0.41
395 0.37
396 0.36
397 0.36
398 0.3
399 0.33
400 0.35
401 0.34
402 0.38
403 0.41
404 0.42
405 0.44
406 0.45
407 0.41
408 0.39
409 0.41
410 0.44
411 0.44
412 0.43
413 0.38
414 0.38
415 0.39
416 0.36
417 0.33
418 0.28
419 0.28
420 0.3
421 0.35
422 0.35
423 0.35
424 0.41
425 0.4
426 0.4
427 0.41
428 0.42
429 0.39
430 0.38
431 0.37
432 0.3
433 0.28
434 0.26
435 0.23
436 0.19
437 0.14
438 0.11
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.04
447 0.04
448 0.06
449 0.09
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.19
456 0.2
457 0.17
458 0.15
459 0.18
460 0.18
461 0.21
462 0.25
463 0.2
464 0.18
465 0.18
466 0.18
467 0.14
468 0.15
469 0.1
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.14
486 0.2
487 0.21
488 0.24
489 0.27
490 0.26
491 0.25
492 0.28
493 0.25
494 0.2
495 0.19
496 0.18
497 0.15
498 0.15
499 0.15
500 0.1
501 0.1
502 0.08
503 0.16
504 0.21
505 0.24
506 0.29
507 0.34
508 0.44
509 0.54
510 0.64
511 0.64
512 0.69
513 0.74
514 0.8
515 0.8
516 0.75
517 0.69
518 0.59
519 0.58
520 0.52
521 0.5
522 0.44
523 0.39
524 0.36
525 0.32
526 0.32
527 0.27
528 0.24
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.23
533 0.23
534 0.23
535 0.23
536 0.24
537 0.22
538 0.18
539 0.26
540 0.29
541 0.32
542 0.37
543 0.38
544 0.36
545 0.34
546 0.36
547 0.27
548 0.24
549 0.22
550 0.15
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.12
560 0.12
561 0.2
562 0.26
563 0.32
564 0.33
565 0.36
566 0.38
567 0.38
568 0.41
569 0.42
570 0.39
571 0.37
572 0.36
573 0.39
574 0.42
575 0.39
576 0.46
577 0.44
578 0.43
579 0.41
580 0.41
581 0.37
582 0.34
583 0.35
584 0.27
585 0.23
586 0.21
587 0.2
588 0.22
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.14
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.09
617 0.09
618 0.1
619 0.11
620 0.11
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.15
625 0.16
626 0.16
627 0.15