Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CQD7

Protein Details
Accession A0A550CQD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-145VDARRRRESFFKQKCRLRRRGLRMRKITKEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-141RRRESFFKQKCRLRRRGLRMRKI
311-325RKGAVRGRGRGQRGA
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8, mito 7, nucl 5.5, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
Amino Acid Sequences MAGPVRDSLVATEGQLVSLVNQLRLKNIFAFVTEGVELGSIGGALSAMSFRTLNKRSYLVDVLAFTPRQMQPLFDIIADESVTKLMWDGRMDASELLHGHAVELRGALDLQLADVDARRRRESFFKQKCRLRRRGLRMRKITKEGFKYVHRLNGLAGAAEEYGVIPPRQRTYEPVPQFDQSRWLQRPFTDVQIEYAAEDVRYIMALYHIFSKRRYIADEESLKLQTRAYHAIYRAGRRDKGNIYTMTSLMPLEILDLPTSQDGATSSCHGCRRDLTKKSFALASADKCFVCVALDKEQGRFPQPVNRDSARKGAVRGRGRGQRGARSGGVQGGTHHGLGVTNAVAPLAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.11
5 0.16
6 0.17
7 0.16
8 0.2
9 0.21
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.26
14 0.27
15 0.24
16 0.21
17 0.23
18 0.19
19 0.2
20 0.17
21 0.15
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.07
26 0.06
27 0.04
28 0.03
29 0.03
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.03
34 0.04
35 0.05
36 0.06
37 0.08
38 0.17
39 0.21
40 0.24
41 0.27
42 0.3
43 0.3
44 0.36
45 0.37
46 0.3
47 0.28
48 0.27
49 0.25
50 0.26
51 0.24
52 0.18
53 0.22
54 0.2
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.23
60 0.24
61 0.18
62 0.18
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.11
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.06
102 0.11
103 0.15
104 0.18
105 0.21
106 0.22
107 0.25
108 0.34
109 0.42
110 0.49
111 0.55
112 0.62
113 0.69
114 0.75
115 0.82
116 0.84
117 0.84
118 0.83
119 0.82
120 0.82
121 0.84
122 0.88
123 0.88
124 0.89
125 0.87
126 0.83
127 0.8
128 0.75
129 0.71
130 0.65
131 0.6
132 0.53
133 0.47
134 0.47
135 0.42
136 0.41
137 0.34
138 0.29
139 0.25
140 0.24
141 0.21
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.16
158 0.23
159 0.32
160 0.34
161 0.36
162 0.36
163 0.36
164 0.37
165 0.32
166 0.31
167 0.23
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.28
172 0.27
173 0.32
174 0.27
175 0.29
176 0.24
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.14
182 0.14
183 0.1
184 0.07
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.12
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.21
199 0.23
200 0.25
201 0.27
202 0.25
203 0.27
204 0.33
205 0.36
206 0.33
207 0.32
208 0.32
209 0.3
210 0.25
211 0.22
212 0.17
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.23
217 0.23
218 0.3
219 0.33
220 0.36
221 0.4
222 0.41
223 0.42
224 0.4
225 0.45
226 0.42
227 0.43
228 0.44
229 0.38
230 0.37
231 0.34
232 0.32
233 0.27
234 0.23
235 0.18
236 0.12
237 0.11
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.13
254 0.17
255 0.22
256 0.23
257 0.24
258 0.29
259 0.36
260 0.43
261 0.5
262 0.53
263 0.57
264 0.58
265 0.58
266 0.54
267 0.46
268 0.42
269 0.39
270 0.36
271 0.32
272 0.32
273 0.3
274 0.29
275 0.28
276 0.21
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.21
281 0.28
282 0.29
283 0.31
284 0.35
285 0.36
286 0.36
287 0.35
288 0.3
289 0.32
290 0.36
291 0.38
292 0.41
293 0.44
294 0.46
295 0.45
296 0.51
297 0.48
298 0.45
299 0.46
300 0.46
301 0.5
302 0.52
303 0.55
304 0.56
305 0.6
306 0.62
307 0.65
308 0.64
309 0.64
310 0.61
311 0.61
312 0.54
313 0.48
314 0.45
315 0.41
316 0.36
317 0.27
318 0.24
319 0.25
320 0.25
321 0.22
322 0.21
323 0.16
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.1
328 0.09
329 0.09