Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C0R3

Protein Details
Accession A0A550C0R3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-57DTAAEEGRPKPSKRRKTSRSDKRTRGTRSRKRLTALFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-52RPKPSKRRKTSRSDKRTRGTRSRKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd09917  F-box_SF  
Amino Acid Sequences MARKSRQPRDDDQEFIDSEDDTAAEEGRPKPSKRRKTSRSDKRTRGTRSRKRLTALFDFPLDVVYEIFSHLHPAHLLNISRTNKALRGTLMQKSARGVWRLSFEGVEDLPPVPDDLNEPQYARLLFDKSCMVLLPGTQHVYCRLGARLRCCKRCLESQFLSEGQIPNIAALSRYNRHFTDVLPTFKVTDRRGDEFSIKCGDPERSVEFIENTMRCAFRKEEVTREALEEWDAMRQEMRSAELIDICRNRKEAIYAKLRDLGWDEEIKKSIFELEYHPLISKRQPLTERGWKKIQHDVVGYITTLRDERLRLERLAKNKMRYKGFSDAYDDYLASQPPEAVFPTVGNLVTLDHVRIAIEETPIDVEITEETYRKLVHEIPKSFYTEWREKADAQLLAKMTKALGGPINKSDLYLASTFFKNHMTPSINPRHTRPYPDILADPLVGVGDPYGAEVHLRTGYWPWLATWISFGPALQATARDFIVRADADPDTATHKDMLLKDPWFIHKKPAREKSILMRWPNVVNHVTMSASDLFERWPEERAAVTRRDLTTLSWQPYIADELVLCTHCPAHFRRSDKLYEHLTDVHDKVRITCKDFAFRCGGTMYPQRITMPSHGVVTKGMLRIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.37
4 0.27
5 0.22
6 0.18
7 0.13
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.14
13 0.16
14 0.25
15 0.32
16 0.34
17 0.45
18 0.55
19 0.66
20 0.72
21 0.81
22 0.81
23 0.85
24 0.93
25 0.93
26 0.94
27 0.94
28 0.93
29 0.92
30 0.92
31 0.9
32 0.9
33 0.9
34 0.9
35 0.9
36 0.9
37 0.86
38 0.82
39 0.78
40 0.75
41 0.72
42 0.68
43 0.6
44 0.51
45 0.45
46 0.39
47 0.34
48 0.27
49 0.18
50 0.12
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.22
63 0.23
64 0.22
65 0.31
66 0.33
67 0.34
68 0.35
69 0.34
70 0.32
71 0.33
72 0.32
73 0.26
74 0.31
75 0.34
76 0.38
77 0.43
78 0.41
79 0.4
80 0.39
81 0.43
82 0.41
83 0.39
84 0.35
85 0.3
86 0.33
87 0.34
88 0.33
89 0.27
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.18
94 0.15
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.08
100 0.08
101 0.11
102 0.14
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.23
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.24
132 0.27
133 0.35
134 0.44
135 0.51
136 0.56
137 0.56
138 0.57
139 0.56
140 0.62
141 0.6
142 0.58
143 0.53
144 0.5
145 0.52
146 0.46
147 0.43
148 0.37
149 0.31
150 0.22
151 0.2
152 0.17
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.08
157 0.09
158 0.14
159 0.17
160 0.2
161 0.23
162 0.23
163 0.27
164 0.27
165 0.26
166 0.31
167 0.32
168 0.33
169 0.31
170 0.31
171 0.29
172 0.32
173 0.37
174 0.29
175 0.31
176 0.33
177 0.34
178 0.37
179 0.37
180 0.4
181 0.35
182 0.36
183 0.32
184 0.28
185 0.24
186 0.24
187 0.24
188 0.2
189 0.22
190 0.23
191 0.21
192 0.21
193 0.22
194 0.2
195 0.2
196 0.23
197 0.2
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.2
203 0.2
204 0.18
205 0.26
206 0.27
207 0.32
208 0.34
209 0.36
210 0.34
211 0.34
212 0.31
213 0.22
214 0.2
215 0.14
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.16
231 0.2
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.21
236 0.19
237 0.24
238 0.26
239 0.29
240 0.36
241 0.37
242 0.37
243 0.41
244 0.41
245 0.36
246 0.32
247 0.26
248 0.19
249 0.22
250 0.22
251 0.18
252 0.2
253 0.19
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.22
268 0.2
269 0.24
270 0.25
271 0.29
272 0.35
273 0.44
274 0.46
275 0.44
276 0.49
277 0.47
278 0.48
279 0.51
280 0.46
281 0.39
282 0.35
283 0.32
284 0.27
285 0.24
286 0.21
287 0.14
288 0.11
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.15
296 0.18
297 0.19
298 0.26
299 0.28
300 0.33
301 0.42
302 0.43
303 0.44
304 0.48
305 0.53
306 0.5
307 0.49
308 0.49
309 0.48
310 0.45
311 0.39
312 0.38
313 0.33
314 0.31
315 0.29
316 0.23
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.14
362 0.21
363 0.29
364 0.31
365 0.34
366 0.37
367 0.4
368 0.38
369 0.37
370 0.37
371 0.35
372 0.35
373 0.36
374 0.36
375 0.33
376 0.35
377 0.36
378 0.31
379 0.25
380 0.25
381 0.22
382 0.2
383 0.2
384 0.17
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.09
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.2
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.13
403 0.14
404 0.14
405 0.16
406 0.14
407 0.14
408 0.19
409 0.2
410 0.22
411 0.31
412 0.4
413 0.44
414 0.45
415 0.47
416 0.51
417 0.5
418 0.54
419 0.5
420 0.46
421 0.43
422 0.44
423 0.41
424 0.34
425 0.32
426 0.26
427 0.2
428 0.13
429 0.1
430 0.08
431 0.06
432 0.05
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.11
449 0.15
450 0.16
451 0.15
452 0.16
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.14
469 0.13
470 0.12
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.16
479 0.13
480 0.14
481 0.18
482 0.2
483 0.24
484 0.25
485 0.25
486 0.26
487 0.28
488 0.35
489 0.36
490 0.35
491 0.41
492 0.41
493 0.49
494 0.58
495 0.64
496 0.64
497 0.61
498 0.65
499 0.64
500 0.69
501 0.68
502 0.61
503 0.55
504 0.51
505 0.52
506 0.49
507 0.44
508 0.35
509 0.29
510 0.26
511 0.23
512 0.21
513 0.16
514 0.18
515 0.14
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.16
522 0.13
523 0.15
524 0.15
525 0.16
526 0.18
527 0.23
528 0.26
529 0.27
530 0.3
531 0.33
532 0.33
533 0.35
534 0.33
535 0.31
536 0.36
537 0.39
538 0.4
539 0.35
540 0.34
541 0.32
542 0.32
543 0.33
544 0.23
545 0.16
546 0.12
547 0.13
548 0.16
549 0.16
550 0.15
551 0.12
552 0.14
553 0.14
554 0.18
555 0.2
556 0.27
557 0.33
558 0.38
559 0.45
560 0.49
561 0.56
562 0.55
563 0.58
564 0.56
565 0.51
566 0.5
567 0.45
568 0.43
569 0.42
570 0.4
571 0.36
572 0.33
573 0.3
574 0.32
575 0.38
576 0.4
577 0.39
578 0.45
579 0.46
580 0.53
581 0.54
582 0.54
583 0.51
584 0.45
585 0.42
586 0.36
587 0.32
588 0.29
589 0.36
590 0.36
591 0.32
592 0.34
593 0.34
594 0.35
595 0.38
596 0.37
597 0.35
598 0.31
599 0.33
600 0.32
601 0.31
602 0.29
603 0.29
604 0.29