Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CYP1

Protein Details
Accession A0A550CYP1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1115-1138ERDKSEPEKKTMKRKDREDEEMVEAcidic
1184-1223EKNGSRSTTRSSPRKERQASSSQKPSPRTDRPNPPTRTTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1109-1130RSGKEAERDKSEPEKKTMKRKD
1170-1216RPKATAPAVKEKEKEKNGSRSTTRSSPRKERQASSSQKPSPRTDRPN
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MDAVLNKRSALAGLKFKRNNPSNKLATPSATPPSTSAPLPAADNNGPPPQSRDGAAPSRYFGPDKVSPAFGNILVPSSSPIAPSPLHNAHNASTSADDVAAGHHDGRPRPPSSIISAPSPPSLARSPSDSTGQRRPRDIAGAGEVGEEPPRKRINRGPLDDALSGASPESPAIRGPGHRRRMAPPGSPASSEESLVDPRKVLASNVPHAAPAREASSSSSTTPAPVDPAFTRFKITQPLHPEPLVRAAWMQGKQDVRAASYLLNDPQWIDKQNRPPPQARPAPTTAKPVSVTVSAKANKQSAIYSHRPPAKVLASPAVPSTSTPATKATPKPTPKPVADTSIEITSSPILPLPKKRKMVIEDSDESDFNDSDEEEDESVDEAEVRALSFFNDASPEDLQEMIGCTPVQADKIVELRPFDTVDVLTKKLNQGARRAGPAGLSPKVFSDTVAVYQGYGSFDTVLDSIEKIGDALKAVINSWALESDGHADSADTQDDGALNLQTFDASKAKDEHFIARQPPLVADNIQLKDYQLLGINWLNLMHRKQHGCILADEMGLGKTCQVISFLAHLKEQGNSGPHLIIVPSSTLENWCREFNRFAPTIQWVTYYDDQKTREQLRMDLRDDEGKPNDWEVMITTYDLACGNSKDSKFLRKFDWECFVCDEGHSLKNFKSRRYGELMKINPRWRLLLTGTPLQNNLQELASIMNFIIPEKIGPVLDKMRAIFKTTTTVTLLSQERITRAHRMVTPFVLRRKKKEVLKDLPDKHERVEWCEMVQSQQEIYSEAVRRSRKTVRQAEELAEVQEDDAKTKGKKKPATASKVTSAHVLMDLRKAASHPMLFRKRFTDDMLRPIAVQLMQDPWYAKRYKGNVGHLAEDCALWSDSELQHNCRSAASRKSAQFCQDDDCYMDSGKVQTLLRLLDQYIGEKRKVLIFSQFTQVLDILTAVLTLKKIAYRMLTGSTRVDERQDMVDEFNESDDITVFLLSTKAGGMGINLTSASVVILFDQDFNPHNDRQAQDRAYRIGQTRDVDVIKLITRGTIEEDMLRLAQTKLALDEAVAGDVDDEKGESAIAKEIKTSLLSMLRKQCSPEPSTSTTSSAPSPAVDTPPKERSGKEAERDKSEPEKKTMKRKDREDEEMVEEKVKPSRSTLSAAKRKRIVDDEDDEEERPATRPKATAPAVKEKEKEKNGSRSTTRSSPRKERQASSSQKPSPRTDRPNPPTRTTSARSSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.59
4 0.68
5 0.7
6 0.73
7 0.71
8 0.73
9 0.71
10 0.7
11 0.71
12 0.63
13 0.57
14 0.52
15 0.49
16 0.46
17 0.39
18 0.36
19 0.32
20 0.35
21 0.35
22 0.31
23 0.28
24 0.23
25 0.24
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.25
30 0.27
31 0.29
32 0.32
33 0.32
34 0.3
35 0.33
36 0.32
37 0.32
38 0.3
39 0.3
40 0.32
41 0.39
42 0.42
43 0.39
44 0.36
45 0.38
46 0.4
47 0.38
48 0.32
49 0.31
50 0.32
51 0.36
52 0.36
53 0.36
54 0.33
55 0.34
56 0.35
57 0.28
58 0.25
59 0.2
60 0.19
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.26
72 0.29
73 0.31
74 0.32
75 0.35
76 0.32
77 0.36
78 0.34
79 0.27
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.16
84 0.14
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.17
92 0.2
93 0.27
94 0.32
95 0.32
96 0.34
97 0.37
98 0.38
99 0.4
100 0.45
101 0.41
102 0.39
103 0.41
104 0.4
105 0.37
106 0.35
107 0.28
108 0.26
109 0.27
110 0.25
111 0.23
112 0.26
113 0.29
114 0.3
115 0.37
116 0.38
117 0.41
118 0.48
119 0.56
120 0.55
121 0.56
122 0.56
123 0.53
124 0.53
125 0.48
126 0.41
127 0.37
128 0.33
129 0.29
130 0.26
131 0.23
132 0.17
133 0.2
134 0.19
135 0.16
136 0.22
137 0.29
138 0.3
139 0.36
140 0.44
141 0.51
142 0.58
143 0.64
144 0.63
145 0.61
146 0.64
147 0.58
148 0.5
149 0.4
150 0.3
151 0.23
152 0.17
153 0.12
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.11
160 0.13
161 0.19
162 0.29
163 0.38
164 0.46
165 0.5
166 0.54
167 0.56
168 0.63
169 0.63
170 0.59
171 0.57
172 0.57
173 0.54
174 0.51
175 0.48
176 0.44
177 0.39
178 0.34
179 0.27
180 0.21
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.19
185 0.19
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.21
190 0.24
191 0.28
192 0.31
193 0.3
194 0.29
195 0.3
196 0.29
197 0.23
198 0.19
199 0.16
200 0.14
201 0.14
202 0.17
203 0.2
204 0.2
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.15
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.24
217 0.23
218 0.27
219 0.24
220 0.27
221 0.33
222 0.34
223 0.37
224 0.42
225 0.48
226 0.48
227 0.49
228 0.47
229 0.39
230 0.43
231 0.36
232 0.27
233 0.21
234 0.2
235 0.25
236 0.26
237 0.26
238 0.25
239 0.26
240 0.27
241 0.3
242 0.28
243 0.23
244 0.21
245 0.2
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.17
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.28
258 0.38
259 0.47
260 0.55
261 0.57
262 0.59
263 0.62
264 0.68
265 0.7
266 0.64
267 0.61
268 0.59
269 0.6
270 0.57
271 0.59
272 0.5
273 0.45
274 0.41
275 0.36
276 0.33
277 0.3
278 0.28
279 0.22
280 0.28
281 0.27
282 0.28
283 0.32
284 0.31
285 0.27
286 0.27
287 0.27
288 0.24
289 0.3
290 0.33
291 0.33
292 0.39
293 0.44
294 0.43
295 0.43
296 0.44
297 0.39
298 0.36
299 0.34
300 0.31
301 0.26
302 0.26
303 0.26
304 0.21
305 0.18
306 0.15
307 0.17
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.18
312 0.19
313 0.26
314 0.31
315 0.34
316 0.4
317 0.46
318 0.51
319 0.58
320 0.62
321 0.58
322 0.59
323 0.55
324 0.52
325 0.47
326 0.43
327 0.37
328 0.31
329 0.29
330 0.22
331 0.19
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.14
338 0.24
339 0.32
340 0.4
341 0.44
342 0.46
343 0.51
344 0.54
345 0.59
346 0.56
347 0.54
348 0.49
349 0.47
350 0.47
351 0.39
352 0.35
353 0.28
354 0.21
355 0.14
356 0.11
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.14
406 0.12
407 0.1
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.15
412 0.16
413 0.17
414 0.21
415 0.25
416 0.23
417 0.27
418 0.33
419 0.35
420 0.36
421 0.36
422 0.32
423 0.28
424 0.28
425 0.26
426 0.21
427 0.19
428 0.16
429 0.16
430 0.18
431 0.17
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.1
494 0.13
495 0.14
496 0.18
497 0.19
498 0.21
499 0.22
500 0.25
501 0.26
502 0.25
503 0.26
504 0.22
505 0.21
506 0.18
507 0.16
508 0.13
509 0.14
510 0.18
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.13
518 0.09
519 0.08
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.11
527 0.12
528 0.13
529 0.17
530 0.18
531 0.19
532 0.24
533 0.27
534 0.25
535 0.25
536 0.24
537 0.21
538 0.19
539 0.18
540 0.14
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.09
552 0.12
553 0.12
554 0.13
555 0.14
556 0.13
557 0.14
558 0.13
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.11
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.07
574 0.08
575 0.1
576 0.12
577 0.13
578 0.14
579 0.16
580 0.18
581 0.19
582 0.23
583 0.21
584 0.2
585 0.2
586 0.22
587 0.21
588 0.19
589 0.18
590 0.14
591 0.18
592 0.21
593 0.21
594 0.2
595 0.23
596 0.25
597 0.25
598 0.3
599 0.27
600 0.27
601 0.26
602 0.3
603 0.33
604 0.36
605 0.36
606 0.32
607 0.31
608 0.32
609 0.32
610 0.3
611 0.24
612 0.21
613 0.19
614 0.18
615 0.18
616 0.12
617 0.11
618 0.09
619 0.09
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.08
630 0.12
631 0.12
632 0.16
633 0.17
634 0.26
635 0.28
636 0.31
637 0.32
638 0.37
639 0.39
640 0.38
641 0.45
642 0.37
643 0.36
644 0.36
645 0.33
646 0.25
647 0.22
648 0.21
649 0.15
650 0.16
651 0.15
652 0.14
653 0.14
654 0.22
655 0.24
656 0.24
657 0.31
658 0.31
659 0.34
660 0.4
661 0.43
662 0.41
663 0.48
664 0.51
665 0.49
666 0.53
667 0.52
668 0.47
669 0.44
670 0.4
671 0.31
672 0.3
673 0.24
674 0.22
675 0.22
676 0.25
677 0.25
678 0.24
679 0.25
680 0.22
681 0.21
682 0.17
683 0.15
684 0.09
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.06
699 0.05
700 0.06
701 0.08
702 0.1
703 0.12
704 0.13
705 0.13
706 0.17
707 0.17
708 0.2
709 0.18
710 0.17
711 0.2
712 0.2
713 0.21
714 0.18
715 0.18
716 0.15
717 0.19
718 0.2
719 0.16
720 0.17
721 0.16
722 0.16
723 0.18
724 0.2
725 0.19
726 0.19
727 0.22
728 0.24
729 0.27
730 0.27
731 0.28
732 0.32
733 0.31
734 0.39
735 0.44
736 0.44
737 0.46
738 0.52
739 0.56
740 0.57
741 0.62
742 0.64
743 0.64
744 0.71
745 0.75
746 0.72
747 0.72
748 0.71
749 0.62
750 0.53
751 0.49
752 0.4
753 0.36
754 0.36
755 0.29
756 0.24
757 0.25
758 0.24
759 0.21
760 0.21
761 0.16
762 0.11
763 0.12
764 0.11
765 0.11
766 0.11
767 0.14
768 0.15
769 0.16
770 0.22
771 0.24
772 0.25
773 0.3
774 0.38
775 0.4
776 0.48
777 0.56
778 0.55
779 0.59
780 0.6
781 0.56
782 0.51
783 0.45
784 0.35
785 0.25
786 0.2
787 0.13
788 0.14
789 0.11
790 0.09
791 0.09
792 0.12
793 0.14
794 0.22
795 0.28
796 0.34
797 0.39
798 0.45
799 0.55
800 0.62
801 0.68
802 0.66
803 0.65
804 0.64
805 0.61
806 0.55
807 0.46
808 0.36
809 0.28
810 0.24
811 0.21
812 0.15
813 0.14
814 0.14
815 0.13
816 0.13
817 0.12
818 0.13
819 0.15
820 0.16
821 0.18
822 0.27
823 0.36
824 0.38
825 0.39
826 0.41
827 0.41
828 0.41
829 0.41
830 0.41
831 0.35
832 0.4
833 0.41
834 0.38
835 0.34
836 0.32
837 0.3
838 0.2
839 0.17
840 0.11
841 0.1
842 0.11
843 0.12
844 0.13
845 0.13
846 0.19
847 0.2
848 0.2
849 0.25
850 0.27
851 0.35
852 0.4
853 0.46
854 0.49
855 0.49
856 0.52
857 0.45
858 0.43
859 0.35
860 0.28
861 0.21
862 0.14
863 0.13
864 0.08
865 0.09
866 0.1
867 0.11
868 0.18
869 0.2
870 0.22
871 0.25
872 0.26
873 0.26
874 0.24
875 0.27
876 0.26
877 0.31
878 0.34
879 0.38
880 0.42
881 0.47
882 0.49
883 0.51
884 0.48
885 0.43
886 0.41
887 0.35
888 0.31
889 0.27
890 0.25
891 0.21
892 0.17
893 0.16
894 0.12
895 0.12
896 0.12
897 0.14
898 0.13
899 0.13
900 0.14
901 0.15
902 0.15
903 0.15
904 0.15
905 0.14
906 0.15
907 0.17
908 0.22
909 0.24
910 0.23
911 0.23
912 0.24
913 0.25
914 0.27
915 0.25
916 0.26
917 0.28
918 0.3
919 0.33
920 0.34
921 0.29
922 0.29
923 0.28
924 0.19
925 0.15
926 0.13
927 0.08
928 0.06
929 0.06
930 0.05
931 0.05
932 0.05
933 0.06
934 0.07
935 0.08
936 0.09
937 0.11
938 0.13
939 0.14
940 0.16
941 0.21
942 0.22
943 0.23
944 0.24
945 0.24
946 0.24
947 0.23
948 0.24
949 0.19
950 0.2
951 0.2
952 0.21
953 0.2
954 0.19
955 0.19
956 0.18
957 0.17
958 0.15
959 0.13
960 0.1
961 0.09
962 0.08
963 0.07
964 0.06
965 0.06
966 0.05
967 0.05
968 0.06
969 0.05
970 0.05
971 0.05
972 0.05
973 0.05
974 0.05
975 0.05
976 0.07
977 0.07
978 0.07
979 0.07
980 0.06
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.04
985 0.04
986 0.04
987 0.05
988 0.06
989 0.07
990 0.08
991 0.1
992 0.11
993 0.16
994 0.2
995 0.2
996 0.23
997 0.27
998 0.28
999 0.32
1000 0.39
1001 0.39
1002 0.38
1003 0.41
1004 0.42
1005 0.39
1006 0.43
1007 0.4
1008 0.37
1009 0.38
1010 0.35
1011 0.34
1012 0.35
1013 0.33
1014 0.29
1015 0.26
1016 0.23
1017 0.19
1018 0.19
1019 0.16
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.12
1023 0.16
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.15
1027 0.15
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.12
1032 0.1
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.1
1040 0.12
1041 0.11
1042 0.1
1043 0.09
1044 0.08
1045 0.07
1046 0.08
1047 0.08
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.05
1051 0.05
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.12
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.15
1059 0.16
1060 0.17
1061 0.18
1062 0.18
1063 0.16
1064 0.22
1065 0.24
1066 0.3
1067 0.39
1068 0.41
1069 0.41
1070 0.45
1071 0.47
1072 0.46
1073 0.48
1074 0.47
1075 0.44
1076 0.46
1077 0.5
1078 0.49
1079 0.46
1080 0.41
1081 0.38
1082 0.33
1083 0.28
1084 0.24
1085 0.19
1086 0.2
1087 0.18
1088 0.23
1089 0.26
1090 0.28
1091 0.33
1092 0.38
1093 0.43
1094 0.42
1095 0.4
1096 0.41
1097 0.46
1098 0.51
1099 0.53
1100 0.57
1101 0.57
1102 0.62
1103 0.64
1104 0.62
1105 0.63
1106 0.63
1107 0.59
1108 0.57
1109 0.62
1110 0.62
1111 0.71
1112 0.77
1113 0.77
1114 0.78
1115 0.83
1116 0.86
1117 0.85
1118 0.85
1119 0.8
1120 0.74
1121 0.7
1122 0.65
1123 0.56
1124 0.48
1125 0.4
1126 0.34
1127 0.34
1128 0.33
1129 0.27
1130 0.26
1131 0.32
1132 0.32
1133 0.37
1134 0.44
1135 0.5
1136 0.56
1137 0.62
1138 0.67
1139 0.67
1140 0.66
1141 0.67
1142 0.65
1143 0.61
1144 0.59
1145 0.58
1146 0.55
1147 0.53
1148 0.53
1149 0.47
1150 0.41
1151 0.35
1152 0.27
1153 0.24
1154 0.24
1155 0.22
1156 0.23
1157 0.25
1158 0.28
1159 0.37
1160 0.41
1161 0.46
1162 0.46
1163 0.55
1164 0.58
1165 0.62
1166 0.63
1167 0.61
1168 0.66
1169 0.66
1170 0.69
1171 0.67
1172 0.71
1173 0.71
1174 0.76
1175 0.74
1176 0.71
1177 0.71
1178 0.71
1179 0.72
1180 0.71
1181 0.74
1182 0.75
1183 0.8
1184 0.84
1185 0.84
1186 0.81
1187 0.8
1188 0.81
1189 0.81
1190 0.79
1191 0.79
1192 0.76
1193 0.75
1194 0.75
1195 0.76
1196 0.75
1197 0.76
1198 0.77
1199 0.76
1200 0.79
1201 0.82
1202 0.86
1203 0.84
1204 0.81
1205 0.76
1206 0.71
1207 0.7
1208 0.63
1209 0.64