Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DM04

Protein Details
Accession C5DM04    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-136DENARPRKRKIEEESTGRKKSGKKSKKRASAEPARAKKQEBasic
145-165LVNKLRSKSPSKKSPLKPLAIHydrophilic
636-657KTVTFKLRSHFKRQQRTEALTQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-138RPRKRKIEEESTGRKKSGKKSKKRASAEPARAKKQESK
148-157KLRSKSPSKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
KEGG lth:KLTH0G04928g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MEEDYLGESFEPKSLRVAQLRRVLVEHGVRVQSHLKKAELCELFEKHIKAKREQLLRERESGQVVKIEKATDSSFSHEASSEKSGSPFSDVNDFQNDENARPRKRKIEEESTGRKKSGKKSKKRASAEPARAKKQESKDNTSSPLVNKLRSKSPSKKSPLKPLAIEAFESSSSSSSDAASSSSDDLDFSLRRKAASPDLSKLKVSPEFAKKLAKASSSQGSNRSQSSRGASRESEMETTPQRLSASADKSSVRESSEPKDRSFKDLPSFAPEGKVKGESKEEEPSGASTPTRGPSAQSSHQSSPHLSVPDFKEVAGDAGSEGPSSPDKKFSAEEDETVESSEAEEDEESISVENLSEQQDESNTSKSRSSIKTNIKEAKESAKEFLLEKAKEHPVPQRAWLRALGKGIWNLSVFLMVMIPILFGLWYREERIQIGYCGHEINLPTFENTNDSPLLIALENFLDNHRPQCLPCPENAICYPYMKIKCRPDYVVTQSKWSLQGIFPVSDYCAKDTKRQKLIAEVVRKSLELLRTKNANVKCGEGANDFESGITEEDLYEIFFESRAPSISDEDDIPAESHDLSQQEEHIQPLRKDRLFRSTSKKYIGLKCKFEKEVHQTYQRFKYVIWIAFALTVIIKTVTFKLRSHFKRQQRTEALTQQVVAKLQKSAKESSESRPPYMSTVQLRDVLLSDVVDLKLKNKLWNSVIKKLEHNNTNVKSRLMELHGEIMKCWEWVGPLQEEDQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.3
3 0.38
4 0.43
5 0.47
6 0.55
7 0.57
8 0.54
9 0.5
10 0.45
11 0.43
12 0.42
13 0.36
14 0.33
15 0.34
16 0.32
17 0.34
18 0.4
19 0.4
20 0.43
21 0.44
22 0.41
23 0.43
24 0.45
25 0.52
26 0.46
27 0.43
28 0.42
29 0.41
30 0.43
31 0.44
32 0.44
33 0.41
34 0.45
35 0.47
36 0.46
37 0.53
38 0.56
39 0.6
40 0.66
41 0.69
42 0.73
43 0.71
44 0.71
45 0.63
46 0.58
47 0.55
48 0.48
49 0.4
50 0.35
51 0.33
52 0.31
53 0.3
54 0.29
55 0.23
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.23
60 0.25
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.23
65 0.22
66 0.22
67 0.24
68 0.21
69 0.2
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.25
74 0.22
75 0.2
76 0.25
77 0.25
78 0.27
79 0.31
80 0.31
81 0.26
82 0.32
83 0.31
84 0.26
85 0.35
86 0.39
87 0.42
88 0.47
89 0.53
90 0.56
91 0.61
92 0.69
93 0.68
94 0.71
95 0.72
96 0.75
97 0.81
98 0.8
99 0.77
100 0.68
101 0.64
102 0.61
103 0.62
104 0.64
105 0.64
106 0.66
107 0.74
108 0.83
109 0.88
110 0.89
111 0.88
112 0.87
113 0.87
114 0.87
115 0.86
116 0.84
117 0.81
118 0.77
119 0.71
120 0.69
121 0.67
122 0.66
123 0.63
124 0.64
125 0.64
126 0.65
127 0.65
128 0.6
129 0.55
130 0.47
131 0.49
132 0.42
133 0.41
134 0.42
135 0.42
136 0.47
137 0.5
138 0.57
139 0.57
140 0.64
141 0.68
142 0.72
143 0.78
144 0.77
145 0.83
146 0.82
147 0.78
148 0.7
149 0.66
150 0.62
151 0.53
152 0.47
153 0.36
154 0.3
155 0.24
156 0.22
157 0.17
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.23
181 0.28
182 0.36
183 0.38
184 0.4
185 0.46
186 0.47
187 0.45
188 0.42
189 0.39
190 0.34
191 0.34
192 0.34
193 0.35
194 0.37
195 0.39
196 0.45
197 0.4
198 0.42
199 0.42
200 0.36
201 0.3
202 0.31
203 0.34
204 0.33
205 0.35
206 0.35
207 0.36
208 0.37
209 0.38
210 0.36
211 0.32
212 0.3
213 0.34
214 0.35
215 0.33
216 0.34
217 0.32
218 0.3
219 0.31
220 0.3
221 0.26
222 0.2
223 0.21
224 0.19
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.17
229 0.15
230 0.18
231 0.21
232 0.23
233 0.22
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.26
238 0.24
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.25
243 0.34
244 0.35
245 0.35
246 0.43
247 0.41
248 0.46
249 0.46
250 0.44
251 0.4
252 0.41
253 0.4
254 0.37
255 0.38
256 0.31
257 0.32
258 0.28
259 0.24
260 0.22
261 0.25
262 0.2
263 0.2
264 0.24
265 0.22
266 0.24
267 0.27
268 0.26
269 0.22
270 0.22
271 0.21
272 0.19
273 0.17
274 0.14
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.12
280 0.12
281 0.16
282 0.22
283 0.25
284 0.28
285 0.32
286 0.33
287 0.36
288 0.36
289 0.33
290 0.3
291 0.29
292 0.25
293 0.2
294 0.23
295 0.23
296 0.26
297 0.25
298 0.22
299 0.19
300 0.17
301 0.18
302 0.13
303 0.1
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.14
314 0.14
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.24
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.23
323 0.21
324 0.2
325 0.18
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.1
348 0.11
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.17
354 0.23
355 0.24
356 0.28
357 0.33
358 0.42
359 0.46
360 0.53
361 0.58
362 0.53
363 0.51
364 0.47
365 0.45
366 0.4
367 0.35
368 0.29
369 0.23
370 0.23
371 0.22
372 0.25
373 0.24
374 0.2
375 0.2
376 0.24
377 0.26
378 0.27
379 0.28
380 0.29
381 0.28
382 0.29
383 0.35
384 0.36
385 0.34
386 0.34
387 0.36
388 0.32
389 0.29
390 0.29
391 0.24
392 0.19
393 0.19
394 0.18
395 0.15
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.04
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.02
410 0.03
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.15
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.13
435 0.12
436 0.14
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.21
456 0.28
457 0.27
458 0.27
459 0.34
460 0.32
461 0.35
462 0.36
463 0.3
464 0.23
465 0.23
466 0.23
467 0.22
468 0.28
469 0.28
470 0.35
471 0.41
472 0.47
473 0.49
474 0.52
475 0.48
476 0.5
477 0.54
478 0.55
479 0.47
480 0.45
481 0.42
482 0.4
483 0.38
484 0.32
485 0.25
486 0.16
487 0.21
488 0.2
489 0.19
490 0.17
491 0.16
492 0.17
493 0.2
494 0.2
495 0.17
496 0.21
497 0.22
498 0.3
499 0.38
500 0.46
501 0.49
502 0.53
503 0.51
504 0.53
505 0.6
506 0.6
507 0.59
508 0.52
509 0.48
510 0.44
511 0.43
512 0.36
513 0.32
514 0.3
515 0.28
516 0.29
517 0.31
518 0.33
519 0.35
520 0.41
521 0.39
522 0.37
523 0.32
524 0.32
525 0.29
526 0.27
527 0.28
528 0.22
529 0.23
530 0.19
531 0.19
532 0.16
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.11
537 0.08
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.14
560 0.12
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.15
571 0.16
572 0.18
573 0.22
574 0.27
575 0.28
576 0.36
577 0.43
578 0.43
579 0.47
580 0.48
581 0.52
582 0.51
583 0.56
584 0.57
585 0.58
586 0.61
587 0.61
588 0.64
589 0.62
590 0.67
591 0.7
592 0.69
593 0.68
594 0.69
595 0.71
596 0.69
597 0.64
598 0.63
599 0.61
600 0.63
601 0.61
602 0.64
603 0.61
604 0.64
605 0.7
606 0.64
607 0.56
608 0.46
609 0.47
610 0.45
611 0.44
612 0.39
613 0.31
614 0.28
615 0.28
616 0.28
617 0.2
618 0.12
619 0.09
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.12
625 0.18
626 0.21
627 0.22
628 0.28
629 0.38
630 0.45
631 0.53
632 0.59
633 0.63
634 0.71
635 0.77
636 0.81
637 0.79
638 0.8
639 0.78
640 0.77
641 0.73
642 0.62
643 0.56
644 0.49
645 0.42
646 0.38
647 0.32
648 0.25
649 0.25
650 0.28
651 0.32
652 0.32
653 0.34
654 0.35
655 0.4
656 0.42
657 0.43
658 0.5
659 0.49
660 0.47
661 0.45
662 0.43
663 0.41
664 0.41
665 0.41
666 0.37
667 0.38
668 0.39
669 0.4
670 0.39
671 0.35
672 0.33
673 0.27
674 0.21
675 0.16
676 0.14
677 0.13
678 0.13
679 0.15
680 0.14
681 0.14
682 0.21
683 0.23
684 0.29
685 0.3
686 0.37
687 0.4
688 0.5
689 0.55
690 0.57
691 0.61
692 0.58
693 0.61
694 0.63
695 0.67
696 0.63
697 0.62
698 0.63
699 0.63
700 0.67
701 0.62
702 0.55
703 0.47
704 0.44
705 0.43
706 0.37
707 0.35
708 0.29
709 0.35
710 0.37
711 0.36
712 0.33
713 0.31
714 0.28
715 0.24
716 0.23
717 0.16
718 0.14
719 0.18
720 0.23
721 0.22
722 0.23