FuNGI

A0A550C9F6

Protein Details

Accession

A0A550C9F6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
769-796	LDLGTAQPRVRRKRRRESRGGAKQEKAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
777-793	RVRRKRRRESRGGAKQE

Subcellular Location(s)

cyto 10, nucl 7, mito 5, cyto_pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40

Amino Acid Sequences

MADPVHLKVHRCRFVDYTPSAVTALAFPPLPLPNPKGKKAAKQPTNFGALVVGHSNGNIDICEWTGRDQQTQSPQAWVVRKTIAGTYPSKVDALALVIRYPDLLEDDQVSSITDLRLFSSGGGNELVEWDMNRGCIRRTINSQGGAIWSIAANPSSSQLALACEDGTVRILSLANDTLTHHRRFDRVKSRILSIAWGPPIPRKQTAPRKPATAPSSDESSDEEDMEDLWSDSWLVTGCSDSSLRKWDAKTGRVVDRMGVDKLRGERTLVWTVGVLGDGTILSGDSLGMVKFWDPRTCTQLQSFRAHGADVLCHAIGPDGATVFTSGVDQKVAQFTRVRASAPGADAADVQSQWVQTRARRLHSHDVRALAMWPSHVCLPTALRRPAPSGIAPVLASGGLDMNVVLTPAAPASATVSKVVNPLATSVDVTFEEAYQRRLAYPASGAVRVAPHARLVACMRDAALTLWRILKQEVPVDEAPADDSESWEKVLEMDLNVNTNMVAHAISGDGRWLAVSDLYETKLFRLDTSEKGAISPRRVRDFANTLAAHLPPSHGSTGGLAFTFTPDSSKLVMSSALGSYVLVIDLGGVDGVPRVLRRFDHHLSRTYALRDVLKRQGAEETGDVDMADGDNDSGIDLPSSSSSRIPAVQRLAVSPDGQWLATSDDHAQTHIFNLDSIQHHCTLPSFGRPAQAIAFDSTQSGLLLLAFPDNALEFYDVEARAFPAWAQELAAHLPKRLAGAHDPVLGVSFPPQTAGSHYAFLWGSTWLAKLDLGTAQPRVRRKRRRESRGGAKQEKAEDEKEVKEGEGVEGEEEDERRERDFRMVTHYRPVLHVDYLESGELVVVERPLVDVLALLPPAYFKHRYGAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.55
4	0.5
5	0.43
6	0.43
7	0.38
8	0.33
9	0.27
10	0.2
11	0.18
12	0.14
13	0.12
14	0.11
15	0.14
16	0.16
17	0.19
18	0.22
19	0.27
20	0.35
21	0.42
22	0.47
23	0.53
24	0.57
25	0.64
26	0.7
27	0.76
28	0.75
29	0.75
30	0.77
31	0.73
32	0.74
33	0.64
34	0.53
35	0.44
36	0.35
37	0.3
38	0.24
39	0.19
40	0.13
41	0.13
42	0.13
43	0.11
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.11
50	0.11
51	0.15
52	0.21
53	0.23
54	0.27
55	0.28
56	0.34
57	0.42
58	0.46
59	0.43
60	0.4
61	0.4
62	0.42
63	0.46
64	0.41
65	0.36
66	0.33
67	0.33
68	0.32
69	0.32
70	0.3
71	0.29
72	0.3
73	0.29
74	0.29
75	0.29
76	0.27
77	0.24
78	0.2
79	0.15
80	0.16
81	0.16
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.12
88	0.09
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.13
93	0.15
94	0.15
95	0.15
96	0.15
97	0.11
98	0.12
99	0.11
100	0.11
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.15
107	0.15
108	0.15
109	0.15
110	0.13
111	0.12
112	0.13
113	0.12
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.09
118	0.11
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.2
123	0.24
124	0.27
125	0.34
126	0.41
127	0.45
128	0.46
129	0.45
130	0.39
131	0.37
132	0.33
133	0.26
134	0.17
135	0.11
136	0.09
137	0.1
138	0.09
139	0.08
140	0.07
141	0.09
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.1
160	0.11
161	0.1
162	0.11
163	0.13
164	0.2
165	0.25
166	0.27
167	0.28
168	0.3
169	0.36
170	0.41
171	0.49
172	0.51
173	0.51
174	0.58
175	0.57
176	0.58
177	0.56
178	0.51
179	0.43
180	0.35
181	0.35
182	0.28
183	0.27
184	0.24
185	0.27
186	0.32
187	0.34
188	0.34
189	0.34
190	0.43
191	0.53
192	0.62
193	0.65
194	0.63
195	0.64
196	0.63
197	0.67
198	0.6
199	0.53
200	0.47
201	0.41
202	0.41
203	0.36
204	0.34
205	0.27
206	0.27
207	0.23
208	0.19
209	0.16
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.1
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.08
226	0.09
227	0.1
228	0.12
229	0.17
230	0.2
231	0.23
232	0.24
233	0.31
234	0.36
235	0.39
236	0.44
237	0.44
238	0.47
239	0.46
240	0.46
241	0.39
242	0.36
243	0.35
244	0.3
245	0.25
246	0.19
247	0.19
248	0.22
249	0.24
250	0.21
251	0.2
252	0.2
253	0.25
254	0.29
255	0.26
256	0.23
257	0.2
258	0.19
259	0.18
260	0.15
261	0.09
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.09
278	0.12
279	0.15
280	0.17
281	0.2
282	0.27
283	0.29
284	0.3
285	0.32
286	0.37
287	0.39
288	0.4
289	0.39
290	0.35
291	0.33
292	0.3
293	0.26
294	0.19
295	0.14
296	0.11
297	0.12
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.13
318	0.13
319	0.14
320	0.16
321	0.17
322	0.21
323	0.22
324	0.21
325	0.16
326	0.18
327	0.18
328	0.17
329	0.17
330	0.13
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.11
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.11
341	0.11
342	0.12
343	0.22
344	0.25
345	0.3
346	0.34
347	0.4
348	0.48
349	0.52
350	0.56
351	0.49
352	0.47
353	0.42
354	0.38
355	0.33
356	0.23
357	0.17
358	0.12
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.17
367	0.24
368	0.26
369	0.26
370	0.26
371	0.29
372	0.29
373	0.28
374	0.22
375	0.18
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.11
380	0.1
381	0.08
382	0.07
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.02
397	0.03
398	0.05
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.11
405	0.11
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.07
417	0.06
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.08
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.12
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.1
441	0.11
442	0.11
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.08
451	0.09
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.13
458	0.16
459	0.15
460	0.19
461	0.18
462	0.18
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.11
467	0.11
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.08
480	0.08
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.06
503	0.07
504	0.09
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.13
509	0.13
510	0.11
511	0.15
512	0.17
513	0.19
514	0.25
515	0.26
516	0.22
517	0.23
518	0.28
519	0.26
520	0.3
521	0.33
522	0.32
523	0.36
524	0.37
525	0.38
526	0.38
527	0.4
528	0.36
529	0.38
530	0.33
531	0.29
532	0.3
533	0.28
534	0.23
535	0.18
536	0.16
537	0.09
538	0.11
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.07
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.02
574	0.02
575	0.02
576	0.02
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.06
581	0.08
582	0.09
583	0.14
584	0.22
585	0.27
586	0.36
587	0.39
588	0.43
589	0.46
590	0.47
591	0.45
592	0.39
593	0.37
594	0.29
595	0.31
596	0.29
597	0.3
598	0.35
599	0.35
600	0.33
601	0.31
602	0.32
603	0.28
604	0.27
605	0.22
606	0.18
607	0.14
608	0.14
609	0.13
610	0.1
611	0.09
612	0.07
613	0.06
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.05
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.1
628	0.11
629	0.12
630	0.17
631	0.18
632	0.22
633	0.24
634	0.26
635	0.26
636	0.25
637	0.27
638	0.24
639	0.23
640	0.18
641	0.18
642	0.16
643	0.15
644	0.14
645	0.11
646	0.13
647	0.13
648	0.14
649	0.13
650	0.16
651	0.16
652	0.17
653	0.16
654	0.13
655	0.15
656	0.15
657	0.13
658	0.09
659	0.1
660	0.14
661	0.16
662	0.19
663	0.2
664	0.2
665	0.2
666	0.2
667	0.2
668	0.19
669	0.19
670	0.21
671	0.23
672	0.22
673	0.26
674	0.26
675	0.27
676	0.24
677	0.24
678	0.2
679	0.19
680	0.19
681	0.15
682	0.15
683	0.14
684	0.13
685	0.11
686	0.09
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.09
701	0.13
702	0.13
703	0.13
704	0.13
705	0.13
706	0.12
707	0.12
708	0.11
709	0.1
710	0.11
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.12
715	0.15
716	0.22
717	0.19
718	0.18
719	0.19
720	0.19
721	0.2
722	0.2
723	0.2
724	0.18
725	0.23
726	0.26
727	0.28
728	0.27
729	0.25
730	0.25
731	0.21
732	0.17
733	0.14
734	0.12
735	0.1
736	0.11
737	0.12
738	0.12
739	0.16
740	0.21
741	0.2
742	0.2
743	0.2
744	0.22
745	0.21
746	0.21
747	0.17
748	0.13
749	0.12
750	0.12
751	0.13
752	0.09
753	0.1
754	0.1
755	0.09
756	0.1
757	0.12
758	0.13
759	0.15
760	0.2
761	0.23
762	0.29
763	0.38
764	0.47
765	0.55
766	0.64
767	0.72
768	0.78
769	0.86
770	0.91
771	0.93
772	0.93
773	0.93
774	0.93
775	0.93
776	0.9
777	0.84
778	0.79
779	0.73
780	0.69
781	0.62
782	0.53
783	0.49
784	0.46
785	0.42
786	0.4
787	0.35
788	0.29
789	0.26
790	0.24
791	0.19
792	0.17
793	0.15
794	0.13
795	0.12
796	0.13
797	0.13
798	0.13
799	0.14
800	0.16
801	0.16
802	0.18
803	0.2
804	0.21
805	0.27
806	0.32
807	0.31
808	0.37
809	0.43
810	0.43
811	0.51
812	0.52
813	0.46
814	0.43
815	0.46
816	0.4
817	0.35
818	0.33
819	0.26
820	0.26
821	0.26
822	0.24
823	0.18
824	0.14
825	0.12
826	0.12
827	0.1
828	0.08
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.08
833	0.08
834	0.08
835	0.07
836	0.06
837	0.07
838	0.1
839	0.1
840	0.09
841	0.09
842	0.1
843	0.12
844	0.18
845	0.21
846	0.19

A0A550C9F6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer