Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DKU3

Protein Details
Accession C5DKU3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-304NELPHEPRKRGRPKKQRIVGEGDBasic
317-358EKEVVVKRKRGRPKKIIDESSAEIKPKRPRGRPKKDAPIPITBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-298RGRPRSSHINELPHEPRKRGRPKKQR
323-351KRKRGRPKKIIDESSAEIKPKRPRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001370  BIR_rpt  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lth:KLTH0F07568g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
Amino Acid Sequences MSSAFHRYRDRHESFCRVFNVQGKRCTWPYRVIPAKAMAQLGFEYQPTFIGEALCRDYVSCCYCGLNTYNFHECRAKALTLTLSKVLEKHLKLSPGCLNSALKLVLMRSYYKAKPIDWSMEAPFSDPHSEDMISLRQWTFNEGWSHSEQPGLSAESMAKAGLLRYDLGLPSSELQEDHNDTTYCVYCSKIIGSWEVGDDPIWEHFVCCNGGNCHFFETMPNQLLLESLKAKLMNSSLSTDVNTPPSLDYYEMFGSLLKRFEEQTTVEESVIKRGRPRSSHINELPHEPRKRGRPKKQRIVGEGDHENSTEGAPQSTEKEVVVKRKRGRPKKIIDESSAEIKPKRPRGRPKKDAPIPITQSIELPKVSEDLLSQGDPEGTNILEPFADKEQSNLSENLPKGSSSLNSDFAQREISAPPFAGKESSTSPRRRIKLRTNSKTPMLAEDELNESDTNSTKSIIVNFKSRSPQKEDTARNPIIDDSFDAFSFSAHGNSEFIIPENAFQLHLNKKGSSAEKFPSTPVKQALISEGSVEMKNPSGSHGKSSSGILDKIDMDVEISDSSDDSPGRNSSKSEGSSPIHTPVHRTEESPGKSSFKGGKFSSAGLLSENASLPTVKPSSVSVNDGEHPFFGVGLLENYASNTKGTNKVLQSPKATTVSSEQHFVNDRVPEKKTATFPIEQAPGSQPFSIGSGSAALPIPNEESTTIFKETLGPEVTTTGEEHSLSKPTERDSGQTGNPSCLEKSLNSIDEDRRVLSHYFHNLLRYINLNDASLANEADGDLSFFVKHMPEDEKRLSFAAWLDEKVVALKEEFNRDYKLKIVKLEEQFQSAQTFVRNLDSEEALLGIAKEYNIDLLSPSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.69
3 0.64
4 0.56
5 0.56
6 0.55
7 0.58
8 0.55
9 0.58
10 0.54
11 0.57
12 0.6
13 0.62
14 0.58
15 0.57
16 0.57
17 0.6
18 0.66
19 0.62
20 0.6
21 0.58
22 0.59
23 0.53
24 0.48
25 0.37
26 0.3
27 0.27
28 0.25
29 0.22
30 0.18
31 0.15
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.11
37 0.13
38 0.13
39 0.16
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.22
46 0.25
47 0.22
48 0.19
49 0.2
50 0.2
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.26
55 0.31
56 0.39
57 0.38
58 0.41
59 0.43
60 0.39
61 0.39
62 0.4
63 0.35
64 0.27
65 0.3
66 0.33
67 0.32
68 0.34
69 0.32
70 0.29
71 0.29
72 0.29
73 0.32
74 0.33
75 0.3
76 0.32
77 0.33
78 0.39
79 0.38
80 0.43
81 0.44
82 0.39
83 0.39
84 0.38
85 0.34
86 0.28
87 0.31
88 0.26
89 0.19
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.26
97 0.27
98 0.33
99 0.35
100 0.32
101 0.37
102 0.4
103 0.43
104 0.39
105 0.41
106 0.36
107 0.37
108 0.36
109 0.31
110 0.27
111 0.24
112 0.24
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.2
119 0.2
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.23
126 0.21
127 0.23
128 0.26
129 0.25
130 0.29
131 0.3
132 0.33
133 0.28
134 0.3
135 0.24
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.12
162 0.16
163 0.18
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.23
169 0.23
170 0.19
171 0.16
172 0.16
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.16
196 0.17
197 0.21
198 0.22
199 0.23
200 0.24
201 0.23
202 0.22
203 0.21
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.21
208 0.18
209 0.17
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.17
249 0.16
250 0.17
251 0.2
252 0.21
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.26
257 0.28
258 0.26
259 0.26
260 0.31
261 0.38
262 0.38
263 0.44
264 0.47
265 0.48
266 0.57
267 0.57
268 0.58
269 0.53
270 0.57
271 0.57
272 0.55
273 0.52
274 0.45
275 0.46
276 0.49
277 0.59
278 0.63
279 0.68
280 0.71
281 0.79
282 0.87
283 0.9
284 0.87
285 0.81
286 0.78
287 0.7
288 0.64
289 0.57
290 0.48
291 0.4
292 0.32
293 0.28
294 0.2
295 0.17
296 0.13
297 0.1
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.1
305 0.15
306 0.18
307 0.27
308 0.34
309 0.4
310 0.46
311 0.54
312 0.65
313 0.7
314 0.77
315 0.77
316 0.79
317 0.82
318 0.84
319 0.8
320 0.73
321 0.67
322 0.59
323 0.55
324 0.46
325 0.37
326 0.29
327 0.3
328 0.34
329 0.39
330 0.46
331 0.49
332 0.59
333 0.69
334 0.79
335 0.83
336 0.85
337 0.87
338 0.85
339 0.84
340 0.77
341 0.75
342 0.68
343 0.61
344 0.53
345 0.42
346 0.36
347 0.29
348 0.27
349 0.18
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.11
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.18
382 0.18
383 0.19
384 0.17
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.19
394 0.19
395 0.18
396 0.19
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.12
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.07
408 0.08
409 0.11
410 0.18
411 0.24
412 0.27
413 0.34
414 0.41
415 0.44
416 0.48
417 0.52
418 0.56
419 0.61
420 0.69
421 0.69
422 0.7
423 0.7
424 0.67
425 0.62
426 0.51
427 0.43
428 0.36
429 0.29
430 0.21
431 0.19
432 0.19
433 0.15
434 0.16
435 0.13
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.13
445 0.17
446 0.18
447 0.23
448 0.23
449 0.26
450 0.33
451 0.36
452 0.36
453 0.4
454 0.43
455 0.42
456 0.5
457 0.52
458 0.51
459 0.56
460 0.53
461 0.45
462 0.41
463 0.36
464 0.27
465 0.22
466 0.17
467 0.11
468 0.11
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.09
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.09
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.12
491 0.15
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.21
496 0.25
497 0.28
498 0.26
499 0.26
500 0.25
501 0.27
502 0.27
503 0.28
504 0.32
505 0.31
506 0.31
507 0.3
508 0.28
509 0.26
510 0.25
511 0.26
512 0.19
513 0.17
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.11
524 0.15
525 0.15
526 0.19
527 0.2
528 0.2
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.19
533 0.19
534 0.15
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.12
539 0.09
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.12
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.17
557 0.23
558 0.24
559 0.24
560 0.27
561 0.27
562 0.3
563 0.3
564 0.32
565 0.3
566 0.28
567 0.29
568 0.28
569 0.34
570 0.3
571 0.3
572 0.29
573 0.35
574 0.37
575 0.37
576 0.35
577 0.31
578 0.3
579 0.33
580 0.37
581 0.31
582 0.35
583 0.32
584 0.35
585 0.33
586 0.33
587 0.32
588 0.26
589 0.22
590 0.17
591 0.18
592 0.13
593 0.12
594 0.12
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.11
603 0.13
604 0.18
605 0.2
606 0.22
607 0.19
608 0.21
609 0.24
610 0.25
611 0.23
612 0.18
613 0.16
614 0.14
615 0.12
616 0.09
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.06
622 0.06
623 0.07
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.09
628 0.12
629 0.18
630 0.2
631 0.26
632 0.27
633 0.35
634 0.42
635 0.46
636 0.47
637 0.44
638 0.46
639 0.43
640 0.41
641 0.33
642 0.32
643 0.33
644 0.3
645 0.3
646 0.25
647 0.26
648 0.29
649 0.28
650 0.27
651 0.26
652 0.28
653 0.3
654 0.32
655 0.33
656 0.33
657 0.37
658 0.37
659 0.38
660 0.39
661 0.37
662 0.36
663 0.38
664 0.38
665 0.33
666 0.31
667 0.29
668 0.27
669 0.27
670 0.25
671 0.2
672 0.17
673 0.18
674 0.16
675 0.12
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.12
685 0.1
686 0.11
687 0.1
688 0.12
689 0.16
690 0.19
691 0.2
692 0.18
693 0.18
694 0.21
695 0.21
696 0.24
697 0.23
698 0.2
699 0.18
700 0.19
701 0.2
702 0.16
703 0.16
704 0.13
705 0.12
706 0.12
707 0.14
708 0.15
709 0.18
710 0.18
711 0.21
712 0.21
713 0.23
714 0.29
715 0.28
716 0.29
717 0.3
718 0.35
719 0.34
720 0.4
721 0.39
722 0.35
723 0.36
724 0.35
725 0.3
726 0.27
727 0.26
728 0.19
729 0.24
730 0.26
731 0.27
732 0.27
733 0.31
734 0.32
735 0.35
736 0.36
737 0.31
738 0.26
739 0.27
740 0.26
741 0.24
742 0.28
743 0.29
744 0.31
745 0.32
746 0.34
747 0.32
748 0.32
749 0.32
750 0.29
751 0.25
752 0.26
753 0.25
754 0.23
755 0.22
756 0.21
757 0.21
758 0.17
759 0.15
760 0.1
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.08
765 0.07
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.08
771 0.09
772 0.09
773 0.12
774 0.19
775 0.23
776 0.3
777 0.37
778 0.37
779 0.38
780 0.39
781 0.35
782 0.3
783 0.28
784 0.28
785 0.24
786 0.23
787 0.23
788 0.22
789 0.22
790 0.22
791 0.21
792 0.15
793 0.13
794 0.18
795 0.21
796 0.29
797 0.31
798 0.33
799 0.37
800 0.37
801 0.38
802 0.39
803 0.43
804 0.38
805 0.42
806 0.45
807 0.48
808 0.54
809 0.6
810 0.55
811 0.51
812 0.49
813 0.44
814 0.4
815 0.32
816 0.27
817 0.21
818 0.21
819 0.18
820 0.22
821 0.21
822 0.21
823 0.24
824 0.24
825 0.22
826 0.2
827 0.19
828 0.13
829 0.13
830 0.11
831 0.08
832 0.08
833 0.07
834 0.08
835 0.08
836 0.1
837 0.09
838 0.1