Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1A6

Protein Details
Accession A0A550C1A6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-408IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-175VKKPAAKA
285-297KKLKAKAPAAKKA
389-399FRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MADTDLAATYALVLDFLKKRSHAKTVKALEKEAGDLLKAPSAEAGRGPPQDISASSDSDSDLDSSSDSEAEDAPKKAVATKAAKAPSSVSSDSSDSDSESEEEKSTPKPAVQPPKEERDSSKTLSSAAASPSSSSSESSDDSSDSDSDGDDAKMDVDKPTKKTKGDTVKKPAAKAKAASVEAKAAESSSDSSDSSDSDSDSDVEPATKKVPKKAASSSSSSDSSDSDSDDEKPSKPTAAAKSTAPVKTTPAKMIGKRKTASSSSSSSSSSSSDSSDSDSDAESSKKLKAKAPAAKKAKVEQASSSSASTSEQPTPTPEESIPSEQSGSANDATKVAKGKRTTNTPFQRIDPTKISGLVADNRFEARNAVTNDYGARAHQDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMQSHSIKFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.19
4 0.22
5 0.25
6 0.32
7 0.37
8 0.48
9 0.5
10 0.54
11 0.62
12 0.68
13 0.73
14 0.7
15 0.66
16 0.59
17 0.53
18 0.47
19 0.39
20 0.3
21 0.22
22 0.2
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.15
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.22
36 0.22
37 0.23
38 0.22
39 0.24
40 0.2
41 0.21
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.17
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.12
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.2
64 0.22
65 0.26
66 0.28
67 0.31
68 0.38
69 0.4
70 0.41
71 0.38
72 0.38
73 0.33
74 0.34
75 0.31
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.26
80 0.25
81 0.22
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.23
96 0.31
97 0.41
98 0.44
99 0.52
100 0.55
101 0.63
102 0.64
103 0.59
104 0.55
105 0.52
106 0.52
107 0.46
108 0.43
109 0.34
110 0.31
111 0.3
112 0.27
113 0.21
114 0.18
115 0.16
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.14
144 0.18
145 0.22
146 0.31
147 0.35
148 0.36
149 0.38
150 0.45
151 0.5
152 0.56
153 0.61
154 0.62
155 0.66
156 0.66
157 0.67
158 0.64
159 0.58
160 0.51
161 0.43
162 0.39
163 0.36
164 0.35
165 0.33
166 0.28
167 0.25
168 0.22
169 0.21
170 0.16
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.11
194 0.14
195 0.15
196 0.2
197 0.27
198 0.31
199 0.35
200 0.4
201 0.44
202 0.44
203 0.47
204 0.44
205 0.4
206 0.36
207 0.32
208 0.27
209 0.2
210 0.19
211 0.15
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.26
227 0.24
228 0.27
229 0.32
230 0.32
231 0.27
232 0.22
233 0.22
234 0.26
235 0.28
236 0.26
237 0.27
238 0.31
239 0.35
240 0.45
241 0.48
242 0.5
243 0.49
244 0.49
245 0.47
246 0.45
247 0.42
248 0.37
249 0.33
250 0.29
251 0.3
252 0.28
253 0.24
254 0.23
255 0.2
256 0.18
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.12
271 0.16
272 0.2
273 0.22
274 0.26
275 0.32
276 0.41
277 0.49
278 0.56
279 0.62
280 0.65
281 0.68
282 0.66
283 0.64
284 0.62
285 0.58
286 0.5
287 0.43
288 0.41
289 0.4
290 0.38
291 0.33
292 0.25
293 0.21
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.26
302 0.26
303 0.27
304 0.23
305 0.23
306 0.26
307 0.3
308 0.29
309 0.24
310 0.24
311 0.21
312 0.22
313 0.19
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.17
319 0.17
320 0.19
321 0.24
322 0.24
323 0.28
324 0.3
325 0.38
326 0.42
327 0.51
328 0.56
329 0.6
330 0.67
331 0.67
332 0.66
333 0.62
334 0.66
335 0.6
336 0.6
337 0.54
338 0.48
339 0.43
340 0.41
341 0.38
342 0.29
343 0.29
344 0.3
345 0.28
346 0.25
347 0.25
348 0.25
349 0.26
350 0.24
351 0.22
352 0.17
353 0.22
354 0.24
355 0.27
356 0.25
357 0.26
358 0.26
359 0.27
360 0.25
361 0.18
362 0.18
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.18
368 0.2
369 0.21
370 0.18
371 0.17
372 0.21
373 0.2
374 0.23
375 0.27
376 0.32
377 0.42
378 0.52
379 0.62
380 0.69
381 0.78
382 0.82
383 0.89
384 0.91
385 0.91
386 0.91
387 0.88
388 0.87
389 0.86
390 0.8
391 0.71
392 0.62
393 0.54
394 0.45
395 0.4
396 0.31