FuNGI

A0A550CP36

Protein Details

Accession

A0A550CP36

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-106	PHTAKRIMKAIKKNNIRFDP	Hydrophilic
121-142	HHLFVPKKTRPRYNTARCKCLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5, pero 6, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding

Amino Acid Sequences

MIKKSTIHDTEDNGGRGLMDLHERNKSIDIGWAKRYLTSAGEAPTWTHALEAICKAKLVSGDAKKCDDASLVNHMTQDLEISSRSLPHTAKRIMKAIKKNNIRFDPVNPTTELKEGMPFWHHLFVPKKTRPRYNTARCKCLRENHAVRTVSDAIRVAEDITHHDGHSGTHACKCTACGDARAIGCQSPQGCAGAALKILEKIPAKWDPRIHFKADYELTDREKEKNKQAKTEGGAVIFDPQLKQESTLQECFRIFGYKNSQDVPPRADNPLADPDTEYTVTHLSEASKADARTGRTTALGHHENPRTRTAGRREKLRTTRLTEGAALLTAMLEVVRGAEDEENIELVIPRRGVMDALTTKLQKHEDNGWVDYPNRQLMMTLTAKMRNRPGRTAIRMPEGAEQGHKGASTLAREAAEMDTCTHRNMTSDPGEVRGASLATISQREVYATLMEAKKPDVRKQTRPNLEKVRKAIKTTRRGNVTDRQIWLSLRSKDMRRNVRQFMYKSMHDAHRCGRHWKDIPECGDRVFCKHCSADGQDIEESIEHILTECTAPGRQAIWDEAKSLCEARNIPWSKPSMGAVLGNALMRFKDAEGKSRLGDNRFYRILISEGAYMVWLVRNERVVQNENDKTKYAAPAALKERLRAQLRRRHTIDKTMTDKRQFGVKAILQATVDDTWHHTDLERTAHPPNDVPQQARVLSGLLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.28
3	0.25
4	0.22
5	0.16
6	0.17
7	0.21
8	0.24
9	0.3
10	0.31
11	0.32
12	0.34
13	0.33
14	0.26
15	0.29
16	0.33
17	0.33
18	0.37
19	0.39
20	0.37
21	0.38
22	0.39
23	0.33
24	0.27
25	0.26
26	0.25
27	0.22
28	0.23
29	0.22
30	0.22
31	0.23
32	0.22
33	0.18
34	0.15
35	0.15
36	0.15
37	0.18
38	0.23
39	0.24
40	0.23
41	0.24
42	0.23
43	0.23
44	0.23
45	0.24
46	0.27
47	0.33
48	0.4
49	0.43
50	0.47
51	0.46
52	0.44
53	0.41
54	0.33
55	0.26
56	0.23
57	0.28
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.26
62	0.25
63	0.22
64	0.19
65	0.11
66	0.1
67	0.09
68	0.11
69	0.11
70	0.13
71	0.15
72	0.18
73	0.2
74	0.24
75	0.32
76	0.38
77	0.45
78	0.47
79	0.54
80	0.57
81	0.64
82	0.69
83	0.71
84	0.73
85	0.76
86	0.79
87	0.81
88	0.78
89	0.76
90	0.68
91	0.64
92	0.64
93	0.57
94	0.52
95	0.44
96	0.41
97	0.36
98	0.35
99	0.31
100	0.22
101	0.22
102	0.19
103	0.2
104	0.2
105	0.21
106	0.22
107	0.25
108	0.24
109	0.28
110	0.33
111	0.39
112	0.46
113	0.52
114	0.59
115	0.62
116	0.72
117	0.71
118	0.74
119	0.77
120	0.78
121	0.81
122	0.79
123	0.82
124	0.76
125	0.79
126	0.76
127	0.74
128	0.7
129	0.69
130	0.69
131	0.66
132	0.71
133	0.64
134	0.57
135	0.54
136	0.51
137	0.41
138	0.35
139	0.29
140	0.21
141	0.2
142	0.2
143	0.14
144	0.11
145	0.11
146	0.13
147	0.17
148	0.17
149	0.16
150	0.17
151	0.17
152	0.16
153	0.21
154	0.2
155	0.17
156	0.21
157	0.23
158	0.22
159	0.23
160	0.24
161	0.2
162	0.22
163	0.22
164	0.2
165	0.21
166	0.25
167	0.25
168	0.25
169	0.23
170	0.19
171	0.18
172	0.18
173	0.16
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.11
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.18
190	0.25
191	0.28
192	0.32
193	0.38
194	0.39
195	0.48
196	0.51
197	0.5
198	0.46
199	0.44
200	0.46
201	0.41
202	0.39
203	0.34
204	0.33
205	0.32
206	0.33
207	0.33
208	0.32
209	0.38
210	0.4
211	0.46
212	0.52
213	0.52
214	0.55
215	0.57
216	0.58
217	0.53
218	0.55
219	0.46
220	0.38
221	0.35
222	0.27
223	0.25
224	0.19
225	0.17
226	0.1
227	0.09
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.19
233	0.23
234	0.28
235	0.28
236	0.29
237	0.28
238	0.27
239	0.24
240	0.23
241	0.19
242	0.19
243	0.28
244	0.29
245	0.31
246	0.32
247	0.34
248	0.35
249	0.36
250	0.36
251	0.32
252	0.29
253	0.3
254	0.29
255	0.26
256	0.25
257	0.3
258	0.24
259	0.2
260	0.19
261	0.18
262	0.19
263	0.2
264	0.16
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.08
271	0.09
272	0.1
273	0.11
274	0.13
275	0.13
276	0.16
277	0.18
278	0.2
279	0.21
280	0.21
281	0.2
282	0.18
283	0.18
284	0.17
285	0.21
286	0.21
287	0.2
288	0.26
289	0.31
290	0.33
291	0.35
292	0.35
293	0.32
294	0.3
295	0.36
296	0.38
297	0.43
298	0.43
299	0.5
300	0.52
301	0.59
302	0.65
303	0.65
304	0.61
305	0.56
306	0.58
307	0.51
308	0.48
309	0.39
310	0.32
311	0.25
312	0.19
313	0.13
314	0.08
315	0.05
316	0.04
317	0.03
318	0.02
319	0.02
320	0.02
321	0.02
322	0.02
323	0.02
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.1
342	0.1
343	0.11
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.16
348	0.18
349	0.14
350	0.16
351	0.2
352	0.23
353	0.26
354	0.27
355	0.25
356	0.24
357	0.24
358	0.23
359	0.2
360	0.15
361	0.13
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.15
366	0.14
367	0.14
368	0.15
369	0.19
370	0.21
371	0.23
372	0.3
373	0.32
374	0.33
375	0.35
376	0.4
377	0.43
378	0.48
379	0.52
380	0.47
381	0.44
382	0.42
383	0.4
384	0.36
385	0.3
386	0.25
387	0.19
388	0.17
389	0.13
390	0.13
391	0.11
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.09
404	0.1
405	0.11
406	0.12
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.12
411	0.13
412	0.16
413	0.16
414	0.18
415	0.18
416	0.2
417	0.2
418	0.18
419	0.17
420	0.13
421	0.1
422	0.07
423	0.07
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.14
439	0.15
440	0.2
441	0.22
442	0.28
443	0.33
444	0.39
445	0.49
446	0.58
447	0.67
448	0.72
449	0.73
450	0.76
451	0.76
452	0.77
453	0.73
454	0.69
455	0.68
456	0.61
457	0.62
458	0.62
459	0.6
460	0.63
461	0.65
462	0.66
463	0.62
464	0.62
465	0.62
466	0.62
467	0.61
468	0.56
469	0.5
470	0.45
471	0.41
472	0.39
473	0.38
474	0.37
475	0.31
476	0.31
477	0.34
478	0.36
479	0.42
480	0.51
481	0.56
482	0.59
483	0.64
484	0.66
485	0.67
486	0.7
487	0.64
488	0.64
489	0.59
490	0.5
491	0.47
492	0.46
493	0.46
494	0.41
495	0.42
496	0.4
497	0.44
498	0.46
499	0.49
500	0.47
501	0.49
502	0.52
503	0.56
504	0.57
505	0.55
506	0.58
507	0.56
508	0.53
509	0.45
510	0.44
511	0.38
512	0.35
513	0.32
514	0.28
515	0.27
516	0.27
517	0.27
518	0.27
519	0.31
520	0.33
521	0.31
522	0.32
523	0.28
524	0.28
525	0.27
526	0.22
527	0.18
528	0.11
529	0.09
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.08
538	0.08
539	0.09
540	0.1
541	0.1
542	0.12
543	0.16
544	0.19
545	0.19
546	0.21
547	0.2
548	0.2
549	0.21
550	0.21
551	0.18
552	0.17
553	0.18
554	0.19
555	0.29
556	0.31
557	0.31
558	0.35
559	0.37
560	0.34
561	0.35
562	0.33
563	0.25
564	0.24
565	0.23
566	0.18
567	0.16
568	0.16
569	0.14
570	0.13
571	0.11
572	0.1
573	0.09
574	0.1
575	0.09
576	0.17
577	0.17
578	0.25
579	0.29
580	0.32
581	0.32
582	0.39
583	0.43
584	0.38
585	0.45
586	0.41
587	0.44
588	0.43
589	0.42
590	0.36
591	0.32
592	0.31
593	0.24
594	0.22
595	0.16
596	0.15
597	0.14
598	0.13
599	0.11
600	0.1
601	0.11
602	0.1
603	0.11
604	0.13
605	0.16
606	0.19
607	0.23
608	0.28
609	0.3
610	0.34
611	0.41
612	0.47
613	0.49
614	0.48
615	0.46
616	0.43
617	0.41
618	0.41
619	0.33
620	0.31
621	0.29
622	0.35
623	0.39
624	0.44
625	0.42
626	0.4
627	0.43
628	0.47
629	0.51
630	0.52
631	0.56
632	0.57
633	0.65
634	0.72
635	0.73
636	0.73
637	0.71
638	0.73
639	0.73
640	0.72
641	0.72
642	0.72
643	0.74
644	0.71
645	0.69
646	0.6
647	0.59
648	0.51
649	0.46
650	0.46
651	0.4
652	0.42
653	0.4
654	0.41
655	0.33
656	0.32
657	0.32
658	0.24
659	0.21
660	0.15
661	0.17
662	0.2
663	0.21
664	0.21
665	0.18
666	0.21
667	0.24
668	0.29
669	0.29
670	0.27
671	0.32
672	0.35
673	0.36
674	0.36
675	0.37
676	0.41
677	0.43
678	0.42
679	0.41
680	0.44
681	0.42
682	0.4
683	0.36

A0A550CP36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer