FuNGI

A0A550CD06

Protein Details

Accession

A0A550CD06

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-77	WSSVTGAMNKRKRRRVTARAPVTFFP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-66	KRKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like

Amino Acid Sequences

MMNAWPADSRAEGSNAKGKKKQDNFIGDYAHLTPGLLSSATLIEQPNGRLEWSSVTGAMNKRKRRRVTARAPVTFFPATRTPELPLPHTTIQQRAEEGANFLRTYLPDVDVTAELIREEITHDGELARETQTFDPLAGNVIAPVVCFDSSAKAFAHLAFPAGELGNELNISPYTVSGDVRAVFSPRARSTRTFNTPVQQIVAHSPTAGVGNPISLLAVRTFGATHAFQVQASHSTPPPPPSPDLLTLKRAHTGGKYVVDMAFHPTPLTLVVVNEVGAVFSADMNAGQSSITKLVDPLDTSAQNDSFWRLKVDPSTTTALLASSSAVRRIDSRENTTPTTIFSLTRPPERLTAIEDDPSEHLVRLCTTTQLLWLDPRFLARPLLAYAHGRQYDPALQIHTARMCDTPLTFLSSPNNGLITVYDVSRADGELVYAHRPPYTLPSSAVRFVGQALFRHPSITGDDSTLSCVRISGRGQLSCVALCFGDDDVIDSQGAAQAASVQWDDEVKELAVTAENFEPDAGPLGAQDKVEMNLRMAYDRVFRQYDEERRAAEEANTESVYDVLDNAPRYWQQAEEYPDHMLTSYDILFRTGDEPKNPSRADFLTQSAINSHRGYRALVQDRIPLNDVQKGAKWHCDLQPSLAKLDVDFSAGSDIHERLRRFDLAPDDTPADEGPEAPSAVHPRTAASIRLENEARQQLALDLSLSRHIFSARPFTSPPDMTDDLETMTEALSLANDPPPVHFSYLQPIARDHYTRDQPVVEEAGSAEPVEQALNLPPGVRLLLSEWDLGADPAEYAYHDPYDADAMNVSPPIARRKKAPTAILDSAISQSQSQFRVPPSIQPPTSSWPASSVLICEDLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.35
3	0.41
4	0.44
5	0.49
6	0.55
7	0.62
8	0.66
9	0.68
10	0.72
11	0.71
12	0.7
13	0.67
14	0.57
15	0.51
16	0.45
17	0.36
18	0.26
19	0.2
20	0.15
21	0.12
22	0.13
23	0.1
24	0.08
25	0.08
26	0.09
27	0.09
28	0.11
29	0.12
30	0.12
31	0.15
32	0.17
33	0.19
34	0.19
35	0.19
36	0.18
37	0.18
38	0.2
39	0.21
40	0.21
41	0.18
42	0.19
43	0.24
44	0.3
45	0.39
46	0.44
47	0.5
48	0.59
49	0.67
50	0.74
51	0.8
52	0.84
53	0.85
54	0.87
55	0.88
56	0.89
57	0.87
58	0.83
59	0.73
60	0.68
61	0.6
62	0.49
63	0.43
64	0.38
65	0.36
66	0.35
67	0.36
68	0.32
69	0.35
70	0.38
71	0.37
72	0.35
73	0.37
74	0.35
75	0.39
76	0.39
77	0.41
78	0.41
79	0.4
80	0.37
81	0.33
82	0.33
83	0.29
84	0.29
85	0.26
86	0.25
87	0.22
88	0.21
89	0.21
90	0.18
91	0.22
92	0.21
93	0.19
94	0.16
95	0.17
96	0.19
97	0.17
98	0.18
99	0.14
100	0.12
101	0.1
102	0.1
103	0.09
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.1
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.16
120	0.16
121	0.15
122	0.14
123	0.15
124	0.12
125	0.11
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.07
130	0.08
131	0.07
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.12
136	0.13
137	0.15
138	0.15
139	0.15
140	0.16
141	0.16
142	0.18
143	0.13
144	0.14
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.18
171	0.23
172	0.26
173	0.3
174	0.32
175	0.35
176	0.4
177	0.48
178	0.53
179	0.52
180	0.5
181	0.51
182	0.5
183	0.48
184	0.42
185	0.33
186	0.27
187	0.26
188	0.25
189	0.19
190	0.16
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.12
195	0.09
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.14
217	0.14
218	0.15
219	0.17
220	0.15
221	0.18
222	0.2
223	0.24
224	0.26
225	0.26
226	0.27
227	0.28
228	0.32
229	0.35
230	0.39
231	0.38
232	0.41
233	0.4
234	0.39
235	0.38
236	0.35
237	0.3
238	0.25
239	0.25
240	0.23
241	0.23
242	0.22
243	0.2
244	0.2
245	0.19
246	0.18
247	0.19
248	0.16
249	0.14
250	0.13
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.04
266	0.03
267	0.04
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.08
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.14
287	0.16
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.15
292	0.14
293	0.14
294	0.16
295	0.15
296	0.17
297	0.2
298	0.23
299	0.21
300	0.22
301	0.25
302	0.22
303	0.22
304	0.2
305	0.16
306	0.13
307	0.12
308	0.09
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.12
315	0.16
316	0.24
317	0.26
318	0.32
319	0.36
320	0.39
321	0.41
322	0.4
323	0.36
324	0.29
325	0.28
326	0.22
327	0.17
328	0.14
329	0.2
330	0.21
331	0.25
332	0.27
333	0.25
334	0.26
335	0.27
336	0.27
337	0.22
338	0.24
339	0.21
340	0.2
341	0.19
342	0.18
343	0.17
344	0.18
345	0.15
346	0.11
347	0.11
348	0.09
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.13
361	0.12
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.13
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.12
370	0.11
371	0.12
372	0.13
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.19
380	0.18
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.12
387	0.12
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.14
395	0.13
396	0.14
397	0.15
398	0.16
399	0.17
400	0.15
401	0.15
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.08
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.13
425	0.15
426	0.15
427	0.16
428	0.19
429	0.21
430	0.22
431	0.22
432	0.17
433	0.14
434	0.13
435	0.15
436	0.13
437	0.11
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.12
444	0.13
445	0.15
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.14
451	0.14
452	0.12
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.12
457	0.12
458	0.16
459	0.19
460	0.19
461	0.2
462	0.21
463	0.21
464	0.18
465	0.17
466	0.11
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.05
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.08
507	0.06
508	0.05
509	0.05
510	0.07
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.07
515	0.08
516	0.12
517	0.12
518	0.11
519	0.12
520	0.13
521	0.13
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.14
526	0.17
527	0.16
528	0.16
529	0.2
530	0.28
531	0.34
532	0.36
533	0.37
534	0.33
535	0.34
536	0.35
537	0.31
538	0.25
539	0.2
540	0.16
541	0.16
542	0.16
543	0.14
544	0.13
545	0.12
546	0.11
547	0.08
548	0.07
549	0.05
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.11
554	0.11
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.13
559	0.18
560	0.22
561	0.23
562	0.24
563	0.23
564	0.22
565	0.21
566	0.19
567	0.14
568	0.1
569	0.1
570	0.09
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.13
577	0.16
578	0.18
579	0.19
580	0.24
581	0.26
582	0.33
583	0.33
584	0.31
585	0.29
586	0.29
587	0.3
588	0.28
589	0.27
590	0.24
591	0.24
592	0.23
593	0.22
594	0.21
595	0.21
596	0.2
597	0.19
598	0.18
599	0.19
600	0.2
601	0.22
602	0.29
603	0.32
604	0.34
605	0.34
606	0.38
607	0.39
608	0.39
609	0.37
610	0.3
611	0.25
612	0.26
613	0.26
614	0.21
615	0.22
616	0.26
617	0.26
618	0.3
619	0.31
620	0.31
621	0.34
622	0.38
623	0.35
624	0.36
625	0.4
626	0.36
627	0.34
628	0.31
629	0.27
630	0.22
631	0.23
632	0.18
633	0.12
634	0.11
635	0.1
636	0.1
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.15
642	0.21
643	0.21
644	0.22
645	0.26
646	0.28
647	0.27
648	0.31
649	0.33
650	0.34
651	0.35
652	0.34
653	0.32
654	0.29
655	0.29
656	0.24
657	0.19
658	0.13
659	0.12
660	0.11
661	0.11
662	0.11
663	0.1
664	0.13
665	0.15
666	0.16
667	0.18
668	0.16
669	0.16
670	0.2
671	0.22
672	0.22
673	0.22
674	0.26
675	0.26
676	0.31
677	0.32
678	0.29
679	0.34
680	0.34
681	0.31
682	0.25
683	0.24
684	0.2
685	0.19
686	0.18
687	0.12
688	0.09
689	0.09
690	0.14
691	0.14
692	0.14
693	0.13
694	0.14
695	0.15
696	0.17
697	0.26
698	0.23
699	0.26
700	0.26
701	0.31
702	0.37
703	0.36
704	0.35
705	0.33
706	0.34
707	0.32
708	0.33
709	0.28
710	0.22
711	0.21
712	0.19
713	0.11
714	0.09
715	0.08
716	0.06
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.07
721	0.09
722	0.11
723	0.11
724	0.12
725	0.16
726	0.18
727	0.21
728	0.21
729	0.2
730	0.26
731	0.34
732	0.35
733	0.33
734	0.32
735	0.33
736	0.36
737	0.36
738	0.33
739	0.35
740	0.4
741	0.42
742	0.43
743	0.4
744	0.36
745	0.38
746	0.35
747	0.26
748	0.19
749	0.17
750	0.15
751	0.14
752	0.13
753	0.1
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.07
758	0.07
759	0.09
760	0.11
761	0.11
762	0.11
763	0.11
764	0.12
765	0.13
766	0.11
767	0.09
768	0.1
769	0.14
770	0.15
771	0.15
772	0.14
773	0.15
774	0.15
775	0.14
776	0.12
777	0.08
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.09
783	0.11
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.12
788	0.15
789	0.14
790	0.13
791	0.11
792	0.11
793	0.12
794	0.13
795	0.12
796	0.1
797	0.14
798	0.24
799	0.3
800	0.32
801	0.38
802	0.47
803	0.57
804	0.63
805	0.67
806	0.64
807	0.66
808	0.68
809	0.64
810	0.55
811	0.46
812	0.4
813	0.34
814	0.27
815	0.19
816	0.18
817	0.2
818	0.22
819	0.23
820	0.25
821	0.26
822	0.34
823	0.34
824	0.4
825	0.42
826	0.49
827	0.48
828	0.48
829	0.5
830	0.48
831	0.53
832	0.46
833	0.39
834	0.33
835	0.35
836	0.33
837	0.3
838	0.24
839	0.2

A0A550CD06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer