FuNGI

A0A550CMB1

Protein Details

Accession

A0A550CMB1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
579-604	LRDCNPPRSPWKQRRGRQPYMSPRPY	Hydrophilic
940-959	QGPARRPGRKDQQQYARGGH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MPQKPVQKPRSWGSRFDALPPSSPPSTIEHDFASSPTSESVIAATTKKKEDKMPHDASVFVGSLPTKQHLSEHAEVQNVKVVRDAKGGVCAFVQCEDATAATNLINTLHSTPPKPFLGRILRYEPARAFRTLLVSYRAPKQLLPSVQGRECADDHVSREQLVDLEVPFAMRIWKSRSSKFYNVQYNADAVEGEARSKAIQQQVEGYMDNSLYIDPVAFNSETISTMASYFGQLESFGPYKGSERGVSESSEQQSYPAPHDAERAANMDTGCYEIKWAHRDDCVTALMTLRRVPHLTVTWAHQPQSASDRTPYGTPRQPQMMNTASYPLHVMSPSRDSQTTPRTTHGIGCASPMREHSSFYSPATAAAGDAHDHSFQSNLGQRPKVELTDIDFPPLSEGKEHVRAHRAWDEIVAADPKLPISPFSPSREVERDVSQGPDRDEEYDEHEQILDMPSPPMPSLGMSPITPKTPGSQFPITPTSSTMGIEGMPLCFENGERELDPTTLFVGGLEMHGPAAWDEGRVTNVFAKYGGLQSVKVVRPANSRAAFAFVKFDNMDSPARAIAEEHNRVYDGRAIRVQLRDCNPPRSPWKQRRGRQPYMSPRPYLEDVDNAGANKLPFGDYIGSQSRDSTVDVLVKDFAETTIHADDAFHHVPARAHQRTASDVLDGSVVSRRTESVARSEGPPPSAHAPTVSWADDTPASAVTPPPSSLGSAGSSAAPHPAAPYMMPSGAYYPPVGPWMAPYPPPMQYAMPYYAPYPPPQVGQAPTPAFVSPVGSDASGPAANTPQTLAWGPAPMYGPCVPYPAYQRPHTEHASAQSQTVNGSGQAPLAPTGFVQDNQGTLIPVYQPEALDQYMASQPPGARQAPFHPASSQSWYPQLVPYGNQMPHAAATAGRMPQAPAQAVAWPASAYYPGAVQPAGHMHASPPAPSARMGYDMSAQGPARRPGRKDQQQYARGGHRQFNGHRLARGGHQSPVNGPFYQFPAVEGGQVQGGFAHPRRSPQGEWGQWNRPAVRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.59
3	0.59
4	0.59
5	0.5
6	0.49
7	0.46
8	0.46
9	0.38
10	0.37
11	0.33
12	0.29
13	0.34
14	0.34
15	0.32
16	0.28
17	0.29
18	0.29
19	0.28
20	0.25
21	0.19
22	0.17
23	0.16
24	0.15
25	0.13
26	0.12
27	0.13
28	0.12
29	0.14
30	0.16
31	0.2
32	0.24
33	0.31
34	0.37
35	0.4
36	0.46
37	0.54
38	0.61
39	0.66
40	0.68
41	0.66
42	0.62
43	0.59
44	0.51
45	0.44
46	0.35
47	0.25
48	0.2
49	0.15
50	0.16
51	0.18
52	0.19
53	0.17
54	0.17
55	0.2
56	0.24
57	0.32
58	0.33
59	0.37
60	0.37
61	0.41
62	0.41
63	0.39
64	0.39
65	0.32
66	0.28
67	0.26
68	0.25
69	0.23
70	0.26
71	0.28
72	0.22
73	0.3
74	0.3
75	0.26
76	0.25
77	0.23
78	0.21
79	0.19
80	0.2
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.1
93	0.1
94	0.12
95	0.17
96	0.21
97	0.23
98	0.25
99	0.31
100	0.35
101	0.35
102	0.33
103	0.37
104	0.44
105	0.47
106	0.5
107	0.5
108	0.51
109	0.5
110	0.54
111	0.49
112	0.46
113	0.44
114	0.39
115	0.35
116	0.32
117	0.35
118	0.32
119	0.31
120	0.29
121	0.29
122	0.31
123	0.36
124	0.38
125	0.34
126	0.33
127	0.36
128	0.39
129	0.38
130	0.39
131	0.38
132	0.41
133	0.41
134	0.45
135	0.4
136	0.36
137	0.33
138	0.32
139	0.3
140	0.26
141	0.27
142	0.29
143	0.28
144	0.25
145	0.25
146	0.22
147	0.19
148	0.18
149	0.16
150	0.1
151	0.11
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.1
158	0.14
159	0.18
160	0.27
161	0.33
162	0.4
163	0.48
164	0.53
165	0.61
166	0.65
167	0.69
168	0.7
169	0.68
170	0.64
171	0.57
172	0.5
173	0.41
174	0.34
175	0.24
176	0.14
177	0.15
178	0.12
179	0.11
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.12
184	0.17
185	0.19
186	0.2
187	0.2
188	0.24
189	0.27
190	0.28
191	0.27
192	0.23
193	0.18
194	0.16
195	0.15
196	0.11
197	0.08
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.06
203	0.09
204	0.08
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.14
227	0.17
228	0.18
229	0.16
230	0.18
231	0.22
232	0.22
233	0.24
234	0.24
235	0.26
236	0.26
237	0.26
238	0.23
239	0.2
240	0.23
241	0.23
242	0.23
243	0.23
244	0.22
245	0.21
246	0.24
247	0.25
248	0.22
249	0.22
250	0.21
251	0.17
252	0.18
253	0.17
254	0.14
255	0.13
256	0.13
257	0.12
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.14
262	0.18
263	0.21
264	0.21
265	0.23
266	0.25
267	0.25
268	0.25
269	0.22
270	0.19
271	0.17
272	0.17
273	0.16
274	0.16
275	0.17
276	0.16
277	0.17
278	0.17
279	0.17
280	0.19
281	0.19
282	0.22
283	0.21
284	0.23
285	0.29
286	0.3
287	0.3
288	0.29
289	0.27
290	0.26
291	0.3
292	0.28
293	0.22
294	0.21
295	0.22
296	0.21
297	0.23
298	0.24
299	0.25
300	0.3
301	0.31
302	0.33
303	0.38
304	0.38
305	0.36
306	0.4
307	0.37
308	0.31
309	0.29
310	0.28
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.14
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.1
319	0.15
320	0.16
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.25
325	0.33
326	0.37
327	0.34
328	0.35
329	0.35
330	0.35
331	0.36
332	0.33
333	0.27
334	0.21
335	0.22
336	0.23
337	0.21
338	0.21
339	0.2
340	0.22
341	0.2
342	0.22
343	0.22
344	0.23
345	0.24
346	0.24
347	0.25
348	0.19
349	0.19
350	0.18
351	0.14
352	0.1
353	0.09
354	0.08
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.1
364	0.15
365	0.18
366	0.22
367	0.24
368	0.24
369	0.28
370	0.3
371	0.27
372	0.22
373	0.19
374	0.18
375	0.24
376	0.24
377	0.21
378	0.2
379	0.19
380	0.2
381	0.2
382	0.16
383	0.09
384	0.11
385	0.13
386	0.22
387	0.23
388	0.24
389	0.28
390	0.29
391	0.33
392	0.36
393	0.33
394	0.25
395	0.24
396	0.22
397	0.17
398	0.18
399	0.13
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.12
409	0.16
410	0.2
411	0.24
412	0.24
413	0.29
414	0.31
415	0.32
416	0.29
417	0.28
418	0.26
419	0.23
420	0.25
421	0.22
422	0.21
423	0.2
424	0.19
425	0.17
426	0.16
427	0.17
428	0.15
429	0.2
430	0.21
431	0.2
432	0.18
433	0.17
434	0.16
435	0.15
436	0.15
437	0.1
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.06
446	0.07
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.15
457	0.17
458	0.21
459	0.23
460	0.22
461	0.25
462	0.28
463	0.26
464	0.24
465	0.22
466	0.17
467	0.15
468	0.15
469	0.11
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.07
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.11
487	0.11
488	0.09
489	0.08
490	0.07
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.03
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.05
506	0.05
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.15
522	0.16
523	0.19
524	0.19
525	0.19
526	0.23
527	0.26
528	0.32
529	0.27
530	0.28
531	0.24
532	0.27
533	0.25
534	0.21
535	0.21
536	0.13
537	0.14
538	0.14
539	0.14
540	0.1
541	0.13
542	0.13
543	0.1
544	0.11
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.11
550	0.17
551	0.2
552	0.19
553	0.19
554	0.2
555	0.2
556	0.2
557	0.21
558	0.15
559	0.14
560	0.15
561	0.16
562	0.19
563	0.23
564	0.23
565	0.24
566	0.26
567	0.34
568	0.35
569	0.41
570	0.39
571	0.41
572	0.46
573	0.49
574	0.57
575	0.58
576	0.65
577	0.68
578	0.74
579	0.8
580	0.83
581	0.83
582	0.8
583	0.8
584	0.8
585	0.81
586	0.78
587	0.68
588	0.59
589	0.55
590	0.49
591	0.41
592	0.31
593	0.22
594	0.2
595	0.2
596	0.19
597	0.15
598	0.13
599	0.12
600	0.11
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.07
606	0.08
607	0.07
608	0.12
609	0.16
610	0.17
611	0.17
612	0.17
613	0.17
614	0.17
615	0.17
616	0.13
617	0.11
618	0.12
619	0.12
620	0.13
621	0.12
622	0.11
623	0.11
624	0.1
625	0.09
626	0.07
627	0.07
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.09
634	0.15
635	0.16
636	0.13
637	0.13
638	0.14
639	0.15
640	0.2
641	0.28
642	0.23
643	0.23
644	0.25
645	0.26
646	0.28
647	0.31
648	0.26
649	0.17
650	0.16
651	0.15
652	0.14
653	0.12
654	0.1
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.1
660	0.12
661	0.15
662	0.16
663	0.17
664	0.2
665	0.21
666	0.23
667	0.26
668	0.26
669	0.25
670	0.24
671	0.21
672	0.22
673	0.22
674	0.19
675	0.17
676	0.16
677	0.17
678	0.19
679	0.17
680	0.13
681	0.12
682	0.14
683	0.13
684	0.13
685	0.11
686	0.09
687	0.08
688	0.08
689	0.09
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.11
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.12
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.1
702	0.1
703	0.09
704	0.1
705	0.09
706	0.07
707	0.07
708	0.08
709	0.08
710	0.07
711	0.09
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.12
717	0.12
718	0.13
719	0.12
720	0.11
721	0.11
722	0.12
723	0.12
724	0.09
725	0.11
726	0.13
727	0.14
728	0.15
729	0.18
730	0.19
731	0.22
732	0.23
733	0.22
734	0.2
735	0.2
736	0.23
737	0.23
738	0.21
739	0.19
740	0.19
741	0.22
742	0.23
743	0.23
744	0.23
745	0.21
746	0.21
747	0.22
748	0.25
749	0.22
750	0.22
751	0.28
752	0.24
753	0.24
754	0.24
755	0.22
756	0.19
757	0.17
758	0.17
759	0.1
760	0.1
761	0.1
762	0.09
763	0.09
764	0.09
765	0.11
766	0.1
767	0.09
768	0.09
769	0.1
770	0.1
771	0.1
772	0.11
773	0.08
774	0.1
775	0.11
776	0.12
777	0.11
778	0.13
779	0.13
780	0.15
781	0.17
782	0.14
783	0.18
784	0.18
785	0.2
786	0.18
787	0.2
788	0.19
789	0.2
790	0.27
791	0.32
792	0.36
793	0.38
794	0.44
795	0.46
796	0.51
797	0.52
798	0.47
799	0.41
800	0.4
801	0.42
802	0.36
803	0.32
804	0.27
805	0.24
806	0.22
807	0.2
808	0.16
809	0.1
810	0.11
811	0.1
812	0.09
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.09
818	0.08
819	0.11
820	0.12
821	0.11
822	0.14
823	0.14
824	0.14
825	0.15
826	0.15
827	0.13
828	0.11
829	0.12
830	0.09
831	0.09
832	0.11
833	0.11
834	0.11
835	0.12
836	0.14
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.12
841	0.14
842	0.15
843	0.14
844	0.14
845	0.14
846	0.18
847	0.24
848	0.23
849	0.21
850	0.23
851	0.27
852	0.33
853	0.35
854	0.33
855	0.29
856	0.31
857	0.34
858	0.39
859	0.36
860	0.3
861	0.32
862	0.32
863	0.31
864	0.3
865	0.31
866	0.25
867	0.24
868	0.27
869	0.31
870	0.3
871	0.3
872	0.28
873	0.25
874	0.24
875	0.24
876	0.18
877	0.11
878	0.13
879	0.15
880	0.16
881	0.16
882	0.16
883	0.16
884	0.19
885	0.23
886	0.21
887	0.18
888	0.18
889	0.19
890	0.19
891	0.19
892	0.16
893	0.12
894	0.12
895	0.11
896	0.11
897	0.09
898	0.08
899	0.08
900	0.09
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.11
905	0.14
906	0.16
907	0.15
908	0.15
909	0.14
910	0.2
911	0.21
912	0.2
913	0.19
914	0.18
915	0.19
916	0.2
917	0.22
918	0.17
919	0.2
920	0.2
921	0.19
922	0.21
923	0.21
924	0.22
925	0.24
926	0.22
927	0.23
928	0.28
929	0.34
930	0.38
931	0.43
932	0.46
933	0.51
934	0.62
935	0.68
936	0.72
937	0.75
938	0.78
939	0.79
940	0.81
941	0.78
942	0.75
943	0.72
944	0.67
945	0.64
946	0.58
947	0.6
948	0.58
949	0.58
950	0.59
951	0.56
952	0.53
953	0.49
954	0.46
955	0.44
956	0.48
957	0.43
958	0.39
959	0.38
960	0.38
961	0.39
962	0.43
963	0.4
964	0.32
965	0.31
966	0.29
967	0.3
968	0.31
969	0.27
970	0.22
971	0.24
972	0.23
973	0.23
974	0.21
975	0.18
976	0.16
977	0.16
978	0.15
979	0.1
980	0.11
981	0.16
982	0.18
983	0.24
984	0.24
985	0.3
986	0.37
987	0.42
988	0.43
989	0.47
990	0.55
991	0.55
992	0.63
993	0.65
994	0.66
995	0.65
996	0.69

A0A550CMB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer