Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DGJ1

Protein Details
Accession C5DGJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-263APAAIPQKIRSKKKAKSNALGVIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-270KIRSKKKAKSNALGVIVKKKNRAR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0D05720g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKAINKYYPPNFNPLEAEEAARKLSKKLKTMNRDVITIRLMTPFSMRCLKCSEFIPKSRKFNGKKELLPEKYLDTIKQYRLSIKCPRCNNMIAFRTDPKSGDYVMEIGGVKNFVEEKPEEKLPGDETLDETLERLERQQQQDNNQTKNDDHEDKLEKIEKRLAKLQKEQQDYEELEALRRENISKMKKAEALQEKSHLSAQEESQGDEEKAELAFRLFNAQKADGETSGPAVHITAAPAAIPQKIRSKKKAKSNALGVIVKKKNRARQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.56
3 0.49
4 0.43
5 0.4
6 0.32
7 0.32
8 0.27
9 0.26
10 0.26
11 0.26
12 0.24
13 0.24
14 0.31
15 0.35
16 0.4
17 0.49
18 0.57
19 0.64
20 0.73
21 0.77
22 0.72
23 0.69
24 0.63
25 0.56
26 0.48
27 0.4
28 0.31
29 0.23
30 0.21
31 0.17
32 0.2
33 0.17
34 0.19
35 0.27
36 0.27
37 0.26
38 0.32
39 0.34
40 0.33
41 0.36
42 0.41
43 0.39
44 0.48
45 0.54
46 0.55
47 0.61
48 0.66
49 0.72
50 0.69
51 0.71
52 0.72
53 0.72
54 0.68
55 0.7
56 0.72
57 0.65
58 0.61
59 0.53
60 0.46
61 0.42
62 0.39
63 0.31
64 0.28
65 0.29
66 0.31
67 0.34
68 0.33
69 0.35
70 0.37
71 0.42
72 0.46
73 0.5
74 0.54
75 0.55
76 0.57
77 0.53
78 0.55
79 0.53
80 0.52
81 0.47
82 0.42
83 0.4
84 0.4
85 0.38
86 0.35
87 0.32
88 0.24
89 0.21
90 0.19
91 0.16
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.05
104 0.08
105 0.08
106 0.1
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.16
112 0.14
113 0.16
114 0.14
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.12
126 0.17
127 0.2
128 0.26
129 0.29
130 0.35
131 0.44
132 0.49
133 0.46
134 0.42
135 0.4
136 0.34
137 0.35
138 0.34
139 0.28
140 0.23
141 0.25
142 0.28
143 0.27
144 0.3
145 0.33
146 0.28
147 0.28
148 0.34
149 0.3
150 0.3
151 0.37
152 0.41
153 0.41
154 0.48
155 0.53
156 0.55
157 0.58
158 0.55
159 0.49
160 0.47
161 0.42
162 0.36
163 0.32
164 0.23
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.22
173 0.26
174 0.31
175 0.33
176 0.36
177 0.4
178 0.41
179 0.46
180 0.47
181 0.47
182 0.44
183 0.46
184 0.43
185 0.4
186 0.41
187 0.33
188 0.26
189 0.23
190 0.21
191 0.23
192 0.23
193 0.22
194 0.21
195 0.22
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.15
207 0.15
208 0.18
209 0.21
210 0.22
211 0.23
212 0.26
213 0.28
214 0.21
215 0.21
216 0.19
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.1
230 0.12
231 0.14
232 0.17
233 0.26
234 0.36
235 0.45
236 0.54
237 0.63
238 0.68
239 0.77
240 0.84
241 0.84
242 0.84
243 0.84
244 0.82
245 0.8
246 0.77
247 0.69
248 0.68
249 0.66
250 0.61
251 0.61
252 0.61