FuNGI

A0A550CFC2

Protein Details

Accession

A0A550CFC2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
163-188	AKQMEGKKKKRAKAAPTRARRRRIDM	Basic
520-546	GKLELTRDWKKRWREAARLRRRRGGGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
107-114	PRKRRRRA
151-186	RPGKPLPPPIGEAKQMEGKKKKRAKAAPTRARRRRI
527-545	DWKKRWREAARLRRRRGGG

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034138 NOP8_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12226 RRM_NOL8

Amino Acid Sequences

MSETTTKRIHISGLTPNITYDDLKQRLSTFGTVRALDGIGATDDLGGSRPFAYATLEGAPAQLTRCVALLSGATWKGAKLRVGDARPDFRERIKRENEAVAAEGEVPRKRRRRAGAVHAEDMTPLDPEHAAGKAGWTVTPLGRVYFSARIRPGKPLPPPIGEAKQMEGKKKKRAKAAPTRARRRRIDMGKWGSTQLKGMYVDTSALPTPDVILGRRTTVTDVGESSEDDTGSEDEKDDEEVFDNAGTMPIEEEHLPIEEDENGSLPNPPANSTHVVDNAVSTSDLAHEQEKNISFLHSLFGDADNWGGREEVDAAALREAEARERLRPAREVEQDDDIEIAPVESAVNPPAPSSAREASSETRSTSPAPSSADVSEASRSPSPPPPAAAVASGPAKLKDLFAPRDEEPGFSLLGALDLDLELDEDAPFPIGPAIQSTSNQYTSTQYPSAHLAFTAQQPTSSVVGPFTLDASKPLFFPRRGRGQDVRDVARANGWDWRGAAFHQPTEGSVEEVARARWEAGKLELTRDWKKRWREAARLRRRRGGGAEGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.37
4	0.36
5	0.34
6	0.31
7	0.27
8	0.29
9	0.3
10	0.31
11	0.33
12	0.32
13	0.34
14	0.36
15	0.35
16	0.28
17	0.31
18	0.35
19	0.33
20	0.32
21	0.3
22	0.27
23	0.21
24	0.19
25	0.13
26	0.09
27	0.09
28	0.08
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.08
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.09
39	0.12
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.11
51	0.1
52	0.11
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.14
63	0.17
64	0.2
65	0.22
66	0.2
67	0.26
68	0.34
69	0.36
70	0.43
71	0.46
72	0.49
73	0.5
74	0.53
75	0.48
76	0.48
77	0.56
78	0.53
79	0.57
80	0.57
81	0.59
82	0.58
83	0.61
84	0.55
85	0.47
86	0.43
87	0.33
88	0.27
89	0.22
90	0.19
91	0.18
92	0.2
93	0.23
94	0.3
95	0.38
96	0.44
97	0.51
98	0.57
99	0.63
100	0.69
101	0.75
102	0.78
103	0.75
104	0.73
105	0.65
106	0.56
107	0.46
108	0.38
109	0.27
110	0.16
111	0.1
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.09
116	0.08
117	0.09
118	0.08
119	0.09
120	0.09
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.11
125	0.1
126	0.14
127	0.14
128	0.13
129	0.13
130	0.14
131	0.17
132	0.22
133	0.24
134	0.26
135	0.31
136	0.36
137	0.37
138	0.43
139	0.45
140	0.45
141	0.49
142	0.52
143	0.51
144	0.48
145	0.49
146	0.48
147	0.46
148	0.42
149	0.37
150	0.31
151	0.33
152	0.33
153	0.39
154	0.42
155	0.46
156	0.53
157	0.6
158	0.63
159	0.66
160	0.72
161	0.74
162	0.77
163	0.82
164	0.81
165	0.84
166	0.89
167	0.88
168	0.88
169	0.82
170	0.78
171	0.76
172	0.75
173	0.72
174	0.71
175	0.7
176	0.66
177	0.63
178	0.58
179	0.5
180	0.41
181	0.35
182	0.25
183	0.21
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.13
188	0.13
189	0.11
190	0.12
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.13
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.09
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.11
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.15
262	0.16
263	0.14
264	0.13
265	0.11
266	0.08
267	0.07
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.12
309	0.12
310	0.14
311	0.18
312	0.21
313	0.22
314	0.25
315	0.28
316	0.31
317	0.36
318	0.38
319	0.36
320	0.37
321	0.34
322	0.31
323	0.28
324	0.2
325	0.14
326	0.1
327	0.08
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.15
341	0.17
342	0.17
343	0.18
344	0.21
345	0.23
346	0.26
347	0.27
348	0.23
349	0.23
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.2
354	0.18
355	0.19
356	0.18
357	0.19
358	0.18
359	0.18
360	0.16
361	0.16
362	0.15
363	0.13
364	0.15
365	0.14
366	0.15
367	0.18
368	0.23
369	0.27
370	0.26
371	0.28
372	0.27
373	0.27
374	0.27
375	0.24
376	0.18
377	0.16
378	0.16
379	0.15
380	0.13
381	0.12
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.16
386	0.22
387	0.24
388	0.25
389	0.3
390	0.29
391	0.35
392	0.35
393	0.3
394	0.25
395	0.22
396	0.2
397	0.15
398	0.15
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.03
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.1
421	0.11
422	0.12
423	0.17
424	0.21
425	0.22
426	0.23
427	0.22
428	0.23
429	0.24
430	0.29
431	0.26
432	0.23
433	0.23
434	0.27
435	0.27
436	0.23
437	0.21
438	0.18
439	0.17
440	0.21
441	0.24
442	0.19
443	0.18
444	0.19
445	0.22
446	0.22
447	0.21
448	0.17
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.13
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.12
457	0.14
458	0.14
459	0.15
460	0.22
461	0.27
462	0.3
463	0.37
464	0.43
465	0.51
466	0.55
467	0.62
468	0.63
469	0.63
470	0.68
471	0.67
472	0.63
473	0.56
474	0.53
475	0.46
476	0.41
477	0.36
478	0.28
479	0.27
480	0.24
481	0.22
482	0.21
483	0.22
484	0.19
485	0.2
486	0.27
487	0.24
488	0.24
489	0.24
490	0.24
491	0.24
492	0.27
493	0.26
494	0.18
495	0.16
496	0.16
497	0.16
498	0.18
499	0.17
500	0.15
501	0.15
502	0.15
503	0.18
504	0.19
505	0.19
506	0.21
507	0.29
508	0.28
509	0.32
510	0.35
511	0.39
512	0.47
513	0.51
514	0.56
515	0.57
516	0.66
517	0.71
518	0.77
519	0.79
520	0.81
521	0.85
522	0.88
523	0.9
524	0.92
525	0.89
526	0.88
527	0.82
528	0.77
529	0.72

A0A550CFC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer