Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1A8

Protein Details
Accession A0A550C1A8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-529SSGSRLRAPPPPPRPKPKLILSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
515-525APPPPPRPKPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR000261  EH_dom  
Amino Acid Sequences MPSTSLQSRISAFENISKSPPNGHSRKEPSGVDSPHEPSFSGSLATPVASPPLQRSRSGSPPTIVKKTSLIDLKDWVVDDGHSPPRDPPPLKSYKVYESKKTPQPGLLINLESPTKTPNGKAPPLPPRKPSYTSLRSVSSAASTPTHTYPPGKLDVPQKTAGHAPASSISSFHSVSLSEDTDPSSASPSSSSQFIATYPIDLERTSEADSASLGGESFEDVSSASYGSPTSAALIARDWDRARAMQKSAPPKLPQRPTAAANAAAAAVAAASASTPRLPSLKMPPPPPVRLSHSQSPATSSPSSPYLIHSPASSSTMITPTARRAPPVPPSRSSTSDRSSILSTTTSQSATSNSTHNPRSKLALSRPTPVPPAARSRYEKLFNGNVVQSRKAAQKKPALLSPSAARKTRQAAGWRGLSVDLIVGDESHPLNEDDIQVDAAVTGEDRLDGRVVRLVWQRSRLEKHKLVEIWNECDTAQKGSLDRDAFVRGMWRIDEELRRAQLRSSTLSSGSRLRAPPPPPRPKPKLILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.33
4 0.34
5 0.32
6 0.35
7 0.41
8 0.44
9 0.47
10 0.5
11 0.57
12 0.62
13 0.68
14 0.67
15 0.61
16 0.57
17 0.6
18 0.56
19 0.5
20 0.47
21 0.44
22 0.41
23 0.4
24 0.34
25 0.27
26 0.26
27 0.23
28 0.19
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.12
34 0.1
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.19
39 0.28
40 0.3
41 0.32
42 0.37
43 0.41
44 0.49
45 0.54
46 0.51
47 0.45
48 0.52
49 0.57
50 0.58
51 0.52
52 0.45
53 0.43
54 0.41
55 0.44
56 0.42
57 0.37
58 0.33
59 0.35
60 0.35
61 0.32
62 0.31
63 0.24
64 0.18
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.23
69 0.22
70 0.23
71 0.26
72 0.32
73 0.41
74 0.41
75 0.41
76 0.43
77 0.51
78 0.54
79 0.55
80 0.53
81 0.53
82 0.61
83 0.61
84 0.6
85 0.6
86 0.66
87 0.69
88 0.69
89 0.62
90 0.56
91 0.55
92 0.51
93 0.47
94 0.41
95 0.35
96 0.3
97 0.29
98 0.26
99 0.22
100 0.18
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.22
106 0.3
107 0.35
108 0.39
109 0.45
110 0.52
111 0.61
112 0.65
113 0.63
114 0.62
115 0.63
116 0.63
117 0.6
118 0.6
119 0.56
120 0.56
121 0.54
122 0.5
123 0.45
124 0.41
125 0.36
126 0.28
127 0.22
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.18
135 0.2
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.23
140 0.26
141 0.32
142 0.37
143 0.39
144 0.42
145 0.39
146 0.37
147 0.39
148 0.36
149 0.29
150 0.22
151 0.19
152 0.16
153 0.18
154 0.16
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.24
234 0.31
235 0.35
236 0.37
237 0.38
238 0.42
239 0.48
240 0.51
241 0.5
242 0.48
243 0.47
244 0.44
245 0.44
246 0.38
247 0.3
248 0.24
249 0.2
250 0.14
251 0.11
252 0.09
253 0.05
254 0.03
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.09
267 0.17
268 0.24
269 0.28
270 0.31
271 0.38
272 0.42
273 0.45
274 0.44
275 0.4
276 0.39
277 0.42
278 0.45
279 0.44
280 0.44
281 0.43
282 0.4
283 0.41
284 0.36
285 0.33
286 0.28
287 0.22
288 0.19
289 0.19
290 0.2
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.16
300 0.14
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.21
309 0.21
310 0.21
311 0.22
312 0.25
313 0.34
314 0.42
315 0.43
316 0.38
317 0.44
318 0.47
319 0.5
320 0.5
321 0.47
322 0.41
323 0.4
324 0.38
325 0.34
326 0.31
327 0.26
328 0.23
329 0.18
330 0.16
331 0.14
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.22
342 0.27
343 0.31
344 0.33
345 0.31
346 0.35
347 0.36
348 0.4
349 0.42
350 0.46
351 0.44
352 0.47
353 0.48
354 0.45
355 0.44
356 0.39
357 0.36
358 0.29
359 0.36
360 0.34
361 0.39
362 0.41
363 0.44
364 0.48
365 0.49
366 0.48
367 0.45
368 0.45
369 0.4
370 0.38
371 0.36
372 0.35
373 0.33
374 0.32
375 0.27
376 0.26
377 0.33
378 0.37
379 0.39
380 0.42
381 0.47
382 0.53
383 0.56
384 0.57
385 0.53
386 0.46
387 0.44
388 0.42
389 0.44
390 0.42
391 0.4
392 0.37
393 0.38
394 0.42
395 0.43
396 0.43
397 0.41
398 0.42
399 0.46
400 0.48
401 0.44
402 0.39
403 0.35
404 0.29
405 0.22
406 0.16
407 0.1
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.14
438 0.14
439 0.2
440 0.27
441 0.33
442 0.36
443 0.43
444 0.47
445 0.51
446 0.6
447 0.61
448 0.63
449 0.63
450 0.61
451 0.62
452 0.61
453 0.57
454 0.58
455 0.55
456 0.51
457 0.46
458 0.44
459 0.35
460 0.36
461 0.34
462 0.28
463 0.25
464 0.22
465 0.22
466 0.24
467 0.31
468 0.27
469 0.26
470 0.25
471 0.26
472 0.24
473 0.22
474 0.24
475 0.19
476 0.2
477 0.2
478 0.2
479 0.2
480 0.26
481 0.31
482 0.32
483 0.37
484 0.4
485 0.42
486 0.41
487 0.4
488 0.4
489 0.38
490 0.39
491 0.37
492 0.35
493 0.36
494 0.37
495 0.38
496 0.38
497 0.38
498 0.39
499 0.36
500 0.37
501 0.42
502 0.46
503 0.53
504 0.58
505 0.66
506 0.69
507 0.78
508 0.82
509 0.83