FuNGI

A0A550CL89

Protein Details

Accession

A0A550CL89

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-50	LDTERPRRVNCRARRSDKAKGGPIR	Basic
250-272	GEGTAPRKKKRKGKGKGKAAGEN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
240-268	KSLKRKWGEGGEGTAPRKKKRKGKGKGKA

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_nucl 11.5, nucl 5.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028884 Trm82 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0036265 P:RNA (guanine-N7)-methylation GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40

Amino Acid Sequences

MSFPHTHLLPGSSRTICVSGPHISVLDTERPRRVNCRARRSDKAKGGPIRVAAVDRSQKHLATSSDDKCLRVWELIKRGRELPKKATDVRFTQDGQTIIVADKFGDVFAYPLHPPAEKKDEGKKEKDGLASHENPSDGDLVLGHVSLLTACILTPDERYIITADRDEHIRVSWYPQAYQIESFCLGNEKFVSALHIPASAPDRLISGGGDPVLRVWDWMSGALVREIPVLDAVEPTIKVKSLKRKWGEGGEGTAPRKKKRKGKGKGKAAGENEVAEQATDKPSEEPQMEEEGKTVLVVHKIDSVGGEYGQPPYIVFSAVGATALYACPFAENAPAGVQAFDFGLPVLDFAVLADGRILVSLDFQWGDETLEARTATRCLQFTDGNVPHRSRHPPPVLATLNKACLHPATNAELDVLDLYSALASMPKFNLPVPEDEGDATPAPDTEQMTKRQMGRMKNKSAVLARKAAADGGVEEERESKRAKSDEGEGGADMMP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.25
4	0.24
5	0.25
6	0.23
7	0.23
8	0.24
9	0.22
10	0.21
11	0.22
12	0.24
13	0.29
14	0.3
15	0.34
16	0.39
17	0.44
18	0.47
19	0.52
20	0.58
21	0.6
22	0.64
23	0.7
24	0.74
25	0.78
26	0.85
27	0.85
28	0.85
29	0.85
30	0.84
31	0.82
32	0.79
33	0.75
34	0.69
35	0.63
36	0.55
37	0.47
38	0.4
39	0.32
40	0.32
41	0.35
42	0.32
43	0.37
44	0.37
45	0.36
46	0.36
47	0.39
48	0.33
49	0.32
50	0.39
51	0.35
52	0.41
53	0.42
54	0.42
55	0.37
56	0.39
57	0.33
58	0.3
59	0.32
60	0.31
61	0.4
62	0.46
63	0.49
64	0.49
65	0.53
66	0.58
67	0.62
68	0.61
69	0.59
70	0.61
71	0.65
72	0.69
73	0.7
74	0.66
75	0.62
76	0.59
77	0.55
78	0.48
79	0.44
80	0.4
81	0.34
82	0.28
83	0.24
84	0.2
85	0.16
86	0.16
87	0.12
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.09
97	0.09
98	0.11
99	0.13
100	0.14
101	0.15
102	0.21
103	0.28
104	0.28
105	0.32
106	0.4
107	0.49
108	0.54
109	0.59
110	0.58
111	0.56
112	0.57
113	0.57
114	0.49
115	0.45
116	0.46
117	0.45
118	0.4
119	0.37
120	0.33
121	0.28
122	0.28
123	0.23
124	0.14
125	0.1
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.05
135	0.04
136	0.03
137	0.03
138	0.04
139	0.05
140	0.06
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.12
148	0.12
149	0.13
150	0.14
151	0.14
152	0.16
153	0.16
154	0.15
155	0.14
156	0.15
157	0.13
158	0.16
159	0.19
160	0.18
161	0.18
162	0.22
163	0.24
164	0.22
165	0.23
166	0.2
167	0.18
168	0.18
169	0.17
170	0.13
171	0.15
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.13
179	0.1
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.14
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.08
226	0.13
227	0.23
228	0.29
229	0.38
230	0.41
231	0.44
232	0.46
233	0.48
234	0.47
235	0.37
236	0.33
237	0.28
238	0.28
239	0.26
240	0.26
241	0.25
242	0.27
243	0.35
244	0.4
245	0.45
246	0.52
247	0.62
248	0.7
249	0.78
250	0.83
251	0.86
252	0.86
253	0.81
254	0.77
255	0.68
256	0.61
257	0.5
258	0.4
259	0.3
260	0.23
261	0.18
262	0.11
263	0.1
264	0.07
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.1
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.13
274	0.19
275	0.19
276	0.18
277	0.17
278	0.15
279	0.14
280	0.13
281	0.11
282	0.07
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.04
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.03
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.07
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.12
362	0.14
363	0.18
364	0.18
365	0.18
366	0.22
367	0.22
368	0.23
369	0.32
370	0.33
371	0.35
372	0.38
373	0.37
374	0.37
375	0.41
376	0.46
377	0.42
378	0.47
379	0.49
380	0.49
381	0.52
382	0.58
383	0.57
384	0.52
385	0.53
386	0.46
387	0.45
388	0.41
389	0.38
390	0.3
391	0.26
392	0.26
393	0.23
394	0.23
395	0.21
396	0.21
397	0.21
398	0.2
399	0.18
400	0.16
401	0.14
402	0.11
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.06
410	0.06
411	0.08
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.21
417	0.21
418	0.24
419	0.28
420	0.27
421	0.27
422	0.27
423	0.27
424	0.23
425	0.21
426	0.18
427	0.13
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.15
432	0.19
433	0.24
434	0.29
435	0.34
436	0.39
437	0.41
438	0.46
439	0.49
440	0.53
441	0.59
442	0.63
443	0.66
444	0.68
445	0.67
446	0.67
447	0.69
448	0.67
449	0.62
450	0.58
451	0.5
452	0.47
453	0.45
454	0.39
455	0.31
456	0.23
457	0.18
458	0.17
459	0.18
460	0.15
461	0.15
462	0.19
463	0.2
464	0.22
465	0.24
466	0.21
467	0.27
468	0.3
469	0.34
470	0.33
471	0.39
472	0.44
473	0.45
474	0.44
475	0.37

A0A550CL89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer