Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C393

Protein Details
Accession A0A550C393    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MLRTVKPKNARSKRALEARAHydrophilic
266-286KLQTRKMKGLKEGREEKRQKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-228PK
235-243AKGQGKKRK
271-283KMKGLKEGREEKR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTVKPKNARSKRALEARAPKQQEDARTAVFVKGTHTGDVLNNAMKDLMALKRPDSISFSKKNVVHPFEAQGAQSLEFWAQKNDASVFVSPKSTPGHKPLMHFASELFDTHPRFVQLKSMLMDFFNGEEIDSICLKGLEHVISVSCGPTPAGLNTTASADPSTSSSSAVPEPLPKVHLRVYTTRLLNSGTRVPRVELVPMGPSLDLSLRRHTPPDAELMKQALKRPKLRQQDVAKGQGKKRKNMEVDEMGDLRGRLHVGKQDLEKLQTRKMKGLKEGREEKRQKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.76
4 0.76
5 0.75
6 0.77
7 0.73
8 0.64
9 0.62
10 0.6
11 0.56
12 0.51
13 0.47
14 0.39
15 0.37
16 0.37
17 0.31
18 0.28
19 0.23
20 0.2
21 0.23
22 0.22
23 0.21
24 0.2
25 0.2
26 0.19
27 0.22
28 0.22
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.16
38 0.18
39 0.18
40 0.24
41 0.25
42 0.26
43 0.29
44 0.32
45 0.34
46 0.39
47 0.41
48 0.43
49 0.45
50 0.52
51 0.55
52 0.53
53 0.49
54 0.45
55 0.45
56 0.41
57 0.39
58 0.31
59 0.25
60 0.22
61 0.19
62 0.16
63 0.14
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.14
79 0.16
80 0.18
81 0.2
82 0.22
83 0.25
84 0.33
85 0.34
86 0.36
87 0.4
88 0.4
89 0.37
90 0.34
91 0.29
92 0.23
93 0.21
94 0.19
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.18
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.11
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.1
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.15
162 0.13
163 0.16
164 0.18
165 0.22
166 0.22
167 0.25
168 0.28
169 0.32
170 0.33
171 0.31
172 0.28
173 0.27
174 0.25
175 0.24
176 0.27
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.19
196 0.22
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.26
201 0.24
202 0.3
203 0.27
204 0.26
205 0.26
206 0.27
207 0.31
208 0.3
209 0.35
210 0.35
211 0.4
212 0.47
213 0.53
214 0.6
215 0.66
216 0.69
217 0.73
218 0.73
219 0.76
220 0.75
221 0.77
222 0.74
223 0.7
224 0.71
225 0.7
226 0.67
227 0.65
228 0.66
229 0.65
230 0.65
231 0.64
232 0.66
233 0.64
234 0.62
235 0.58
236 0.51
237 0.42
238 0.37
239 0.31
240 0.23
241 0.17
242 0.15
243 0.11
244 0.14
245 0.2
246 0.22
247 0.27
248 0.3
249 0.36
250 0.38
251 0.42
252 0.46
253 0.44
254 0.49
255 0.51
256 0.51
257 0.53
258 0.56
259 0.58
260 0.6
261 0.67
262 0.67
263 0.7
264 0.77
265 0.76
266 0.81
267 0.81