Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CE17

Protein Details
Accession A0A550CE17    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-30KSSSLPSDRIKPRYNNRPAQNGTHydrophilic
222-243PSEPHYSRKKADPQRPWKNLMGHydrophilic
249-276VPPPKEREGGQGKRRRRKGKEAQGGDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-51GGRGSPKGKEPAGPPKSRAVR
245-269GARYVPPPKEREGGQGKRRRRKGKE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MQHTPWIKSSSLPSDRIKPRYNNRPAQNGTGGRGSPKGKEPAGPPKSRAVRKLENQIAALTSEAGTQDPAGGCFCMAREHALSSYAPACTRCGLILCVLNGPQHLCPHCASPLLSPDAAARLIERLESELAATRAREEAAVVRAEQEARARAGAFPTLSGAAPPMRTPSPAQNQAHKVLSLNSRTKKATVTTFTPAPPPPPPAQQQQEAPAEPEPVRVPPPPSEPHYSRKKADPQRPWKNLMGEGARYVPPPKEREGGQGKRRRRKGKEAQGGDGGPTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.6
3 0.65
4 0.67
5 0.66
6 0.71
7 0.76
8 0.81
9 0.81
10 0.79
11 0.81
12 0.77
13 0.74
14 0.72
15 0.64
16 0.57
17 0.52
18 0.45
19 0.38
20 0.39
21 0.34
22 0.29
23 0.33
24 0.36
25 0.33
26 0.37
27 0.41
28 0.46
29 0.53
30 0.54
31 0.5
32 0.54
33 0.62
34 0.63
35 0.63
36 0.6
37 0.61
38 0.63
39 0.71
40 0.68
41 0.62
42 0.57
43 0.52
44 0.44
45 0.35
46 0.28
47 0.18
48 0.11
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.08
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.09
153 0.11
154 0.13
155 0.2
156 0.27
157 0.35
158 0.37
159 0.41
160 0.45
161 0.47
162 0.46
163 0.39
164 0.31
165 0.27
166 0.3
167 0.3
168 0.34
169 0.33
170 0.36
171 0.37
172 0.37
173 0.35
174 0.34
175 0.34
176 0.3
177 0.31
178 0.32
179 0.33
180 0.33
181 0.34
182 0.32
183 0.29
184 0.27
185 0.28
186 0.26
187 0.29
188 0.33
189 0.37
190 0.41
191 0.42
192 0.42
193 0.43
194 0.45
195 0.4
196 0.38
197 0.3
198 0.29
199 0.25
200 0.25
201 0.2
202 0.18
203 0.2
204 0.21
205 0.23
206 0.23
207 0.29
208 0.31
209 0.35
210 0.41
211 0.43
212 0.49
213 0.56
214 0.58
215 0.56
216 0.6
217 0.66
218 0.68
219 0.74
220 0.76
221 0.77
222 0.82
223 0.84
224 0.81
225 0.77
226 0.71
227 0.64
228 0.6
229 0.53
230 0.44
231 0.4
232 0.38
233 0.33
234 0.3
235 0.29
236 0.27
237 0.29
238 0.31
239 0.33
240 0.34
241 0.35
242 0.43
243 0.51
244 0.56
245 0.6
246 0.66
247 0.72
248 0.78
249 0.87
250 0.88
251 0.86
252 0.87
253 0.88
254 0.9
255 0.9
256 0.86
257 0.82
258 0.78
259 0.7