Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E2X3

Protein Details
Accession C5E2X3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-333NDLTSMVKKRKSKPEKDTASKKQKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-333KKRKSKPEKDTASKKQKN
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG lth:KLTH0H08492g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MGGREEIKHLLAEAAKFYAARDYEKSTNLYSEVNALHDTLTGTSSADYLFLYGKSLFQLALSQSEVFGKDEETAGGESDSDEEESSKKHELYQFSETLAEGDEIEKGDDAEQDDEEVEGEHPGENEHEGAGDEGQEEEPSDFENAWEILELARSVYEKQPQEPETLRKLSETYDILGEISLETENFPQAKQDFEKCLELRQAVYGTVDATHRLIIESYYKLSLVLEFDPNDAKDCQENLSKAVELLEKRIKEKGAEGGDDGLLEELKLKLKELKTTEASLNAIKHQSMAQIKEALGLPSDSKSAPAAVNDLTSMVKKRKSKPEKDTASKKQKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.19
6 0.18
7 0.21
8 0.23
9 0.28
10 0.32
11 0.35
12 0.38
13 0.33
14 0.34
15 0.32
16 0.29
17 0.23
18 0.23
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.12
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.15
52 0.16
53 0.14
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.18
76 0.22
77 0.26
78 0.31
79 0.35
80 0.33
81 0.31
82 0.31
83 0.26
84 0.22
85 0.19
86 0.13
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.09
143 0.15
144 0.15
145 0.17
146 0.23
147 0.24
148 0.27
149 0.28
150 0.3
151 0.29
152 0.3
153 0.29
154 0.24
155 0.23
156 0.21
157 0.21
158 0.17
159 0.13
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.13
178 0.16
179 0.18
180 0.21
181 0.27
182 0.24
183 0.27
184 0.27
185 0.25
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.13
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.21
227 0.2
228 0.18
229 0.19
230 0.2
231 0.16
232 0.21
233 0.25
234 0.25
235 0.27
236 0.3
237 0.29
238 0.26
239 0.29
240 0.3
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.24
245 0.23
246 0.22
247 0.19
248 0.12
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.19
257 0.21
258 0.28
259 0.31
260 0.37
261 0.37
262 0.4
263 0.4
264 0.36
265 0.37
266 0.33
267 0.3
268 0.27
269 0.25
270 0.22
271 0.21
272 0.19
273 0.24
274 0.26
275 0.27
276 0.27
277 0.28
278 0.28
279 0.3
280 0.31
281 0.24
282 0.2
283 0.19
284 0.16
285 0.15
286 0.17
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.15
300 0.2
301 0.24
302 0.31
303 0.38
304 0.48
305 0.58
306 0.67
307 0.75
308 0.8
309 0.85
310 0.88
311 0.9
312 0.92
313 0.92