FuNGI

A0A550C3G6

Protein Details

Accession

A0A550C3G6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-112	SYVKGQPIKVEKRKINFWKRAPAPPH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 3, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MDIQIKGLPPFLNDYDVTKLIAQVLHSEAFVPTADESDDEELPSHSPIDKRINFKVKLNRSLAGSVRNDGTGILTVPSDKIGKRFLSYVKGQPIKVEKRKINFWKRAPAPPHIASLLGRTPFVDPEIEETHERIVESLNVGLRVDRVQFGVLFRTRYDKPVSREFSAEWSKEFTTRGVAWLRFEYDHKLIRITLGDSTTEMLGSSIALNFINIQRMALGYQGKPHVVFELLTPPVLERIQFHRHPDDDRKSKLRIGYLDEAHQLVSPYAWQLRIELTDKDFMDLGNVFCDLCKKAGIDNLLLRMVSRGPGNRPVWHKIEASGHKFFERRRIERLCREFAKFPWPVAFQLEALLRNGLITTGEIESSLPGISELCDTYPEHECSRVGDILRKFNIELGKRPATESPASCFSRVMRDFQFPELRITPGHFLCCHIIFTPTRTVLEGPYPVQSNRIIRRYPGYEHHFIRVEFRDEDRLSYRWDRTVDGSHFVRDRVGGILANGFELGGRSFQFLAYSTSALREHSVWFLNEFYHYEAEYPGWQPSKYAARLAQAFTATEPSDPYLFTDGVGTISRSLGDRIWAQLIRERGGDLTKRLRPDAYQIRFLGYKGMVAVDEEMDKDASGIHMRLRPSMRKFDSREEDMREADIEIARHFAYPNNMFTNRALVTILENLGVGSEEFEKLQQRAVASVERIHDGVDEWKEVLRSNSLGRQFRLPYVLDNLKEMGLSMQSRPGRRPRPGFDSPFFQKIREHNARFEIPDSFKLVGIADEGPAYRAAGKENVYCLKEKEIFACVQRNEGESPIWLEGNCVITRSPVTHPGDVQRVHAIGKPPEGMLCSFRNLKNLVVLPSVGERSLCSKLSGGDLDGDLYDIIMCEELLYSQQESPLSFAAGEPRTLGRATTVDDICNFIVEYINSDVVGLLSDRLLVIADQSKQGIFDVGCVKIAELCSQAVDYPKQGIPVDLENGNLPRPLMRQKPDWHAAEVISPRENDYYRSDKALGRLYRNIQIRDVAPLSNEEATSTPSGVNAITSAIERRGAEYIDETLGFDNDLVQLFKRYAEELRYICTTHTVSNTPGVELIEEEVIVGTILANCSQSRMNLHMSQLIHTVQLGIRRGDLRDPAAQLLTFNRAVQAWKLSVAQYKDWGAKSFGLITLAYVFECFSILETARDGAAMIST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.28
5	0.23
6	0.22
7	0.21
8	0.21
9	0.19
10	0.17
11	0.19
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.15
16	0.15
17	0.14
18	0.12
19	0.09
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.13
24	0.15
25	0.16
26	0.15
27	0.15
28	0.15
29	0.16
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.16
34	0.22
35	0.32
36	0.38
37	0.43
38	0.52
39	0.6
40	0.6
41	0.67
42	0.71
43	0.7
44	0.73
45	0.71
46	0.63
47	0.58
48	0.6
49	0.55
50	0.53
51	0.46
52	0.39
53	0.37
54	0.34
55	0.3
56	0.24
57	0.22
58	0.15
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.15
66	0.15
67	0.18
68	0.23
69	0.25
70	0.27
71	0.32
72	0.34
73	0.38
74	0.42
75	0.46
76	0.51
77	0.53
78	0.51
79	0.53
80	0.58
81	0.62
82	0.65
83	0.67
84	0.64
85	0.66
86	0.76
87	0.8
88	0.81
89	0.81
90	0.79
91	0.8
92	0.79
93	0.82
94	0.77
95	0.74
96	0.71
97	0.63
98	0.6
99	0.5
100	0.45
101	0.36
102	0.36
103	0.34
104	0.26
105	0.24
106	0.21
107	0.21
108	0.21
109	0.21
110	0.18
111	0.13
112	0.18
113	0.21
114	0.23
115	0.22
116	0.22
117	0.23
118	0.23
119	0.22
120	0.17
121	0.15
122	0.14
123	0.14
124	0.16
125	0.15
126	0.15
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.15
131	0.16
132	0.14
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.22
138	0.23
139	0.23
140	0.22
141	0.27
142	0.27
143	0.31
144	0.38
145	0.37
146	0.41
147	0.49
148	0.54
149	0.51
150	0.52
151	0.49
152	0.49
153	0.5
154	0.45
155	0.36
156	0.34
157	0.33
158	0.32
159	0.32
160	0.25
161	0.22
162	0.22
163	0.25
164	0.28
165	0.28
166	0.29
167	0.3
168	0.32
169	0.28
170	0.3
171	0.31
172	0.3
173	0.34
174	0.32
175	0.31
176	0.28
177	0.29
178	0.29
179	0.24
180	0.21
181	0.17
182	0.17
183	0.16
184	0.17
185	0.14
186	0.12
187	0.11
188	0.08
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.08
197	0.1
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.15
205	0.17
206	0.13
207	0.18
208	0.21
209	0.22
210	0.22
211	0.22
212	0.19
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.17
217	0.17
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.16
222	0.16
223	0.16
224	0.12
225	0.19
226	0.27
227	0.3
228	0.35
229	0.39
230	0.41
231	0.47
232	0.54
233	0.58
234	0.58
235	0.62
236	0.62
237	0.59
238	0.6
239	0.57
240	0.53
241	0.46
242	0.45
243	0.45
244	0.42
245	0.41
246	0.39
247	0.35
248	0.3
249	0.27
250	0.2
251	0.13
252	0.11
253	0.08
254	0.09
255	0.11
256	0.12
257	0.11
258	0.11
259	0.13
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.19
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.21
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.15
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.13
282	0.17
283	0.19
284	0.21
285	0.22
286	0.24
287	0.23
288	0.22
289	0.2
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.17
296	0.26
297	0.29
298	0.34
299	0.38
300	0.42
301	0.43
302	0.44
303	0.41
304	0.35
305	0.42
306	0.44
307	0.44
308	0.43
309	0.41
310	0.4
311	0.42
312	0.4
313	0.41
314	0.43
315	0.4
316	0.45
317	0.53
318	0.58
319	0.65
320	0.71
321	0.69
322	0.63
323	0.65
324	0.59
325	0.52
326	0.53
327	0.43
328	0.38
329	0.34
330	0.32
331	0.28
332	0.28
333	0.27
334	0.18
335	0.2
336	0.21
337	0.16
338	0.15
339	0.15
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.07
344	0.06
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.11
364	0.16
365	0.18
366	0.18
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.22
371	0.22
372	0.18
373	0.22
374	0.24
375	0.3
376	0.31
377	0.3
378	0.26
379	0.27
380	0.32
381	0.28
382	0.3
383	0.3
384	0.34
385	0.33
386	0.35
387	0.33
388	0.31
389	0.33
390	0.29
391	0.26
392	0.29
393	0.3
394	0.29
395	0.28
396	0.25
397	0.3
398	0.3
399	0.3
400	0.25
401	0.29
402	0.3
403	0.34
404	0.39
405	0.3
406	0.34
407	0.31
408	0.29
409	0.24
410	0.24
411	0.24
412	0.19
413	0.21
414	0.16
415	0.17
416	0.19
417	0.19
418	0.18
419	0.14
420	0.16
421	0.15
422	0.17
423	0.2
424	0.19
425	0.18
426	0.18
427	0.18
428	0.16
429	0.18
430	0.17
431	0.13
432	0.15
433	0.16
434	0.15
435	0.17
436	0.19
437	0.22
438	0.27
439	0.31
440	0.3
441	0.29
442	0.34
443	0.36
444	0.36
445	0.38
446	0.38
447	0.39
448	0.4
449	0.42
450	0.4
451	0.37
452	0.38
453	0.33
454	0.3
455	0.25
456	0.25
457	0.28
458	0.25
459	0.28
460	0.26
461	0.24
462	0.25
463	0.28
464	0.28
465	0.25
466	0.26
467	0.25
468	0.25
469	0.3
470	0.27
471	0.27
472	0.27
473	0.25
474	0.25
475	0.24
476	0.21
477	0.15
478	0.14
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.07
487	0.05
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.13
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.14
529	0.19
530	0.19
531	0.2
532	0.19
533	0.21
534	0.23
535	0.24
536	0.22
537	0.17
538	0.16
539	0.13
540	0.14
541	0.11
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.09
555	0.08
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.06
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.13
569	0.15
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.11
574	0.13
575	0.14
576	0.14
577	0.19
578	0.21
579	0.22
580	0.23
581	0.23
582	0.21
583	0.28
584	0.35
585	0.31
586	0.33
587	0.32
588	0.33
589	0.33
590	0.32
591	0.27
592	0.17
593	0.14
594	0.09
595	0.09
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.05
609	0.06
610	0.08
611	0.11
612	0.11
613	0.16
614	0.19
615	0.25
616	0.28
617	0.36
618	0.37
619	0.42
620	0.45
621	0.49
622	0.51
623	0.5
624	0.5
625	0.47
626	0.45
627	0.38
628	0.35
629	0.27
630	0.21
631	0.17
632	0.14
633	0.09
634	0.08
635	0.09
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.13
641	0.14
642	0.17
643	0.2
644	0.2
645	0.21
646	0.21
647	0.24
648	0.19
649	0.17
650	0.15
651	0.11
652	0.11
653	0.11
654	0.11
655	0.07
656	0.07
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.04
661	0.04
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.07
666	0.09
667	0.09
668	0.1
669	0.11
670	0.1
671	0.11
672	0.13
673	0.13
674	0.12
675	0.15
676	0.14
677	0.14
678	0.14
679	0.13
680	0.11
681	0.1
682	0.13
683	0.11
684	0.11
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.12
689	0.12
690	0.1
691	0.1
692	0.12
693	0.16
694	0.22
695	0.25
696	0.25
697	0.29
698	0.29
699	0.29
700	0.3
701	0.25
702	0.2
703	0.24
704	0.27
705	0.22
706	0.22
707	0.21
708	0.18
709	0.17
710	0.16
711	0.1
712	0.08
713	0.09
714	0.08
715	0.14
716	0.17
717	0.19
718	0.24
719	0.33
720	0.38
721	0.45
722	0.51
723	0.5
724	0.56
725	0.62
726	0.64
727	0.57
728	0.57
729	0.53
730	0.53
731	0.48
732	0.41
733	0.38
734	0.35
735	0.42
736	0.45
737	0.44
738	0.4
739	0.44
740	0.45
741	0.42
742	0.4
743	0.34
744	0.27
745	0.26
746	0.25
747	0.21
748	0.19
749	0.19
750	0.17
751	0.12
752	0.12
753	0.1
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.08
763	0.11
764	0.13
765	0.13
766	0.17
767	0.21
768	0.22
769	0.23
770	0.23
771	0.25
772	0.27
773	0.26
774	0.24
775	0.23
776	0.24
777	0.26
778	0.31
779	0.26
780	0.26
781	0.26
782	0.26
783	0.24
784	0.23
785	0.2
786	0.14
787	0.16
788	0.14
789	0.13
790	0.11
791	0.1
792	0.11
793	0.14
794	0.13
795	0.12
796	0.11
797	0.11
798	0.12
799	0.14
800	0.15
801	0.2
802	0.24
803	0.25
804	0.26
805	0.3
806	0.35
807	0.33
808	0.33
809	0.26
810	0.23
811	0.23
812	0.24
813	0.25
814	0.2
815	0.22
816	0.21
817	0.19
818	0.19
819	0.19
820	0.17
821	0.17
822	0.16
823	0.17
824	0.22
825	0.22
826	0.26
827	0.26
828	0.25
829	0.26
830	0.27
831	0.26
832	0.22
833	0.21
834	0.18
835	0.19
836	0.19
837	0.14
838	0.11
839	0.1
840	0.13
841	0.16
842	0.16
843	0.15
844	0.15
845	0.16
846	0.18
847	0.18
848	0.15
849	0.13
850	0.12
851	0.12
852	0.11
853	0.1
854	0.07
855	0.06
856	0.05
857	0.04
858	0.04
859	0.04
860	0.04
861	0.03
862	0.04
863	0.04
864	0.05
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.1
869	0.11
870	0.11
871	0.13
872	0.13
873	0.12
874	0.1
875	0.1
876	0.15
877	0.15
878	0.15
879	0.15
880	0.15
881	0.16
882	0.16
883	0.16
884	0.11
885	0.11
886	0.14
887	0.19
888	0.19
889	0.19
890	0.19
891	0.22
892	0.19
893	0.19
894	0.16
895	0.09
896	0.1
897	0.09
898	0.12
899	0.11
900	0.12
901	0.11
902	0.11
903	0.11
904	0.09
905	0.1
906	0.07
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.04
914	0.06
915	0.1
916	0.11
917	0.12
918	0.13
919	0.13
920	0.13
921	0.14
922	0.14
923	0.1
924	0.13
925	0.16
926	0.16
927	0.17
928	0.17
929	0.16
930	0.16
931	0.17
932	0.14
933	0.12
934	0.12
935	0.11
936	0.11
937	0.13
938	0.14
939	0.15
940	0.15
941	0.17
942	0.18
943	0.21
944	0.21
945	0.2
946	0.19
947	0.21
948	0.23
949	0.19
950	0.19
951	0.18
952	0.19
953	0.19
954	0.17
955	0.14
956	0.13
957	0.16
958	0.24
959	0.29
960	0.33
961	0.4
962	0.46
963	0.55
964	0.6
965	0.59
966	0.54
967	0.48
968	0.43
969	0.41
970	0.38
971	0.33
972	0.28
973	0.25
974	0.24
975	0.27
976	0.27
977	0.24
978	0.27
979	0.3
980	0.29
981	0.33
982	0.34
983	0.33
984	0.37
985	0.43
986	0.42
987	0.41
988	0.46
989	0.46
990	0.5
991	0.54
992	0.52
993	0.44
994	0.43
995	0.38
996	0.37
997	0.35
998	0.28
999	0.22
1000	0.22
1001	0.23
1002	0.21
1003	0.2
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.16
1007	0.17
1008	0.16
1009	0.13
1010	0.11
1011	0.12
1012	0.11
1013	0.11
1014	0.08
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.08
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.14
1021	0.14
1022	0.15
1023	0.17
1024	0.17
1025	0.17
1026	0.17
1027	0.18
1028	0.16
1029	0.16
1030	0.15
1031	0.14
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.1
1035	0.09
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.12
1041	0.12
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.16
1045	0.18
1046	0.21
1047	0.27
1048	0.26
1049	0.3
1050	0.31
1051	0.3
1052	0.28
1053	0.29
1054	0.27
1055	0.24
1056	0.27
1057	0.25
1058	0.25
1059	0.31
1060	0.31
1061	0.27
1062	0.26
1063	0.23
1064	0.19
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.1
1068	0.09
1069	0.09
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.06
1073	0.06
1074	0.04
1075	0.05
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.09
1079	0.09
1080	0.11
1081	0.13
1082	0.14
1083	0.17
1084	0.21
1085	0.26
1086	0.28
1087	0.3
1088	0.34
1089	0.33
1090	0.33
1091	0.32
1092	0.29
1093	0.23
1094	0.2
1095	0.2
1096	0.16
1097	0.21
1098	0.22
1099	0.2
1100	0.23
1101	0.25
1102	0.27
1103	0.29
1104	0.32
1105	0.31
1106	0.32
1107	0.34
1108	0.33
1109	0.32
1110	0.3
1111	0.27
1112	0.25
1113	0.27
1114	0.23
1115	0.2
1116	0.2
1117	0.19
1118	0.21
1119	0.23
1120	0.25
1121	0.21
1122	0.22
1123	0.24
1124	0.26
1125	0.31
1126	0.33
1127	0.32
1128	0.31
1129	0.35
1130	0.39
1131	0.39
1132	0.39
1133	0.36
1134	0.34
1135	0.33
1136	0.31
1137	0.28
1138	0.23
1139	0.21
1140	0.19
1141	0.18
1142	0.17
1143	0.14
1144	0.12
1145	0.11
1146	0.09
1147	0.09
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.11
1151	0.12
1152	0.13
1153	0.14
1154	0.15
1155	0.14
1156	0.14
1157	0.13

A0A550C3G6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer