Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CN06

Protein Details
Accession A0A550CN06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKASKRRKEKAADFSKAKLHydrophilic
161-180RDSCRRRQIYRPLPRVCPRCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-26KASKRRKEKAADFSKAKLKLGKGK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Amino Acid Sequences MPKASKRRKEKAADFSKAKLKLGKGKQAPTNAVDTSFKARSIALPNQSIAVEKDTDTPTTKRRHTFDDLLSHLKHYNAGTRRDALMGLRELLSDHPELLVPSLTNLVNGCVRVIADEDASVRKALISFMTWLIPLSLSICSPPRLHPHPICVFSSNTHLSRDSCRRRQIYRPLPRVCPRCHGAGWNQGTSQPGGRVLEGYLGILSAGTKFGDNEGPMKATSTASVVLTPGSRLIVLRSLSLFLKEALSATSADSASPDSSFPTWYLASAFPNEDAYRKFDTALTPTLDQHSRMRSWAPEADKENESFVHEYPFLDAGSAQSWSLQDLDEAMSSVKKLSAHASSAVDVSFVTRLARTLHSTLVATYLDCAPAVFAPTGTPSETELQLVVTVAEIARTLYGAIFQNQSASTSRHESAADELRTILGYMSPYFPFTPSSSKDIKLQKAFQDLNLLYCELTSLIALTGSDATSQLRRANKKRDALSIQTERVQSYIVQLLRGEPTVGQQLARPLSSSAFISLLPTIWSLLNAPEAATILAALLQHAISVPSKSTLKQSTVAFVGRLVLLECEHGPARLRGVEEMANEWIETLPKVLWEAGGNNSALSEIIARFLLRLAQRRPWVRSEPLLQSLRAKLAPFFVIAHPTRGRVPGPFAKLPVTHRKLVLEAVAALASCSSSSAGKGRQVQVHAPTADALALVAAVDEATAGSGDAVYWVQLKGGLRLYP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.76
4 0.69
5 0.63
6 0.58
7 0.54
8 0.55
9 0.6
10 0.63
11 0.63
12 0.68
13 0.7
14 0.72
15 0.7
16 0.63
17 0.59
18 0.5
19 0.45
20 0.39
21 0.35
22 0.34
23 0.31
24 0.29
25 0.24
26 0.24
27 0.26
28 0.32
29 0.37
30 0.36
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.34
36 0.28
37 0.24
38 0.19
39 0.17
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.27
44 0.3
45 0.34
46 0.42
47 0.49
48 0.51
49 0.53
50 0.58
51 0.62
52 0.66
53 0.65
54 0.65
55 0.62
56 0.6
57 0.57
58 0.52
59 0.45
60 0.38
61 0.34
62 0.27
63 0.31
64 0.31
65 0.36
66 0.38
67 0.39
68 0.4
69 0.38
70 0.37
71 0.3
72 0.29
73 0.25
74 0.23
75 0.2
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.2
80 0.15
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.09
88 0.09
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.2
130 0.27
131 0.32
132 0.41
133 0.42
134 0.48
135 0.52
136 0.54
137 0.52
138 0.46
139 0.43
140 0.35
141 0.39
142 0.35
143 0.29
144 0.28
145 0.28
146 0.27
147 0.34
148 0.43
149 0.47
150 0.49
151 0.57
152 0.61
153 0.65
154 0.72
155 0.75
156 0.75
157 0.76
158 0.78
159 0.75
160 0.78
161 0.81
162 0.8
163 0.72
164 0.68
165 0.6
166 0.55
167 0.5
168 0.47
169 0.43
170 0.45
171 0.45
172 0.4
173 0.37
174 0.34
175 0.34
176 0.3
177 0.26
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.2
269 0.22
270 0.2
271 0.18
272 0.18
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.2
279 0.2
280 0.21
281 0.19
282 0.22
283 0.25
284 0.24
285 0.26
286 0.28
287 0.31
288 0.31
289 0.3
290 0.27
291 0.23
292 0.22
293 0.18
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.14
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.09
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.05
386 0.06
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.17
400 0.16
401 0.18
402 0.24
403 0.22
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.11
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.17
421 0.18
422 0.23
423 0.24
424 0.25
425 0.32
426 0.37
427 0.41
428 0.41
429 0.43
430 0.41
431 0.46
432 0.45
433 0.39
434 0.4
435 0.33
436 0.3
437 0.27
438 0.23
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.09
457 0.14
458 0.2
459 0.28
460 0.36
461 0.46
462 0.52
463 0.58
464 0.6
465 0.63
466 0.62
467 0.59
468 0.6
469 0.56
470 0.5
471 0.47
472 0.44
473 0.36
474 0.31
475 0.27
476 0.18
477 0.15
478 0.18
479 0.15
480 0.14
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.09
487 0.1
488 0.13
489 0.14
490 0.12
491 0.12
492 0.17
493 0.18
494 0.18
495 0.17
496 0.14
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.08
533 0.11
534 0.12
535 0.14
536 0.2
537 0.23
538 0.25
539 0.3
540 0.3
541 0.3
542 0.31
543 0.31
544 0.25
545 0.21
546 0.19
547 0.14
548 0.13
549 0.1
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.14
559 0.16
560 0.17
561 0.18
562 0.16
563 0.18
564 0.2
565 0.18
566 0.19
567 0.18
568 0.16
569 0.15
570 0.14
571 0.12
572 0.11
573 0.1
574 0.09
575 0.07
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.1
581 0.12
582 0.14
583 0.16
584 0.16
585 0.14
586 0.14
587 0.13
588 0.11
589 0.1
590 0.09
591 0.06
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.14
598 0.16
599 0.24
600 0.27
601 0.35
602 0.43
603 0.49
604 0.53
605 0.55
606 0.57
607 0.54
608 0.56
609 0.55
610 0.53
611 0.55
612 0.54
613 0.48
614 0.46
615 0.44
616 0.41
617 0.37
618 0.32
619 0.24
620 0.25
621 0.25
622 0.21
623 0.21
624 0.19
625 0.25
626 0.25
627 0.3
628 0.28
629 0.29
630 0.3
631 0.31
632 0.31
633 0.26
634 0.33
635 0.34
636 0.4
637 0.41
638 0.4
639 0.41
640 0.43
641 0.48
642 0.51
643 0.49
644 0.45
645 0.45
646 0.45
647 0.42
648 0.41
649 0.36
650 0.27
651 0.21
652 0.18
653 0.17
654 0.14
655 0.12
656 0.1
657 0.08
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.09
663 0.15
664 0.19
665 0.25
666 0.33
667 0.38
668 0.43
669 0.47
670 0.5
671 0.51
672 0.54
673 0.48
674 0.41
675 0.35
676 0.3
677 0.26
678 0.2
679 0.14
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.03
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.12
702 0.13
703 0.16