FuNGI

A0A550C8S0

Protein Details

Accession

A0A550C8S0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
463-489	KRAARSTPPAPPPKKKRLSKDTANGGS	Hydrophilic
522-541	GLSPARKRPKSTRKDLWALE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
219-314	SKSAASKPAASKSAASKSAASKSAASKSAASKSAASKSAASKPAASKPAASKPAASKSAASKSAASKSAASKPATPKPSAPKVPAAKKPSTAKGIA
334-336	PKP
341-362	AVRSPPRSRSPGGPSFARGPPP
460-534	RWKKRAARSTPPAPPPKKKRLSKDTANGGSEGHSAAGVKALPKEKAAKADGSHKRAGSPTQTGLSPARKRPKSTR
581-608	KNTDGKGKGKGGKATGKAKQVVEKGRNA

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009970 HC2
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0030527 F:structural constituent of chromatin GO:0030261 P:chromosome condensation
Pfam	View protein in Pfam PF07382 HC2

Amino Acid Sequences

MPRCRMDAPATTANCYDAGLPNARGVYTWQKLTIELPDFLPPTSQGPMPPRKPMPPPPNTELVVRTRGQMEGESQGLPPATGNGEGGQNSGEAQMDTEPDLAPPAPARQTRYNTRRATSTSQPPPPTNTVPPRGRGRSRQTPVEDAMQVDEQPQLATAPSPQGTPPPTPQAQDQPARAGAAMEVDKQPLPDGAPSLPNSLPVKKSAAASNPAASKSSASKSAASKPAASKSAASKSAASKSAASKSAASKSAASKSAASKPAASKPAASKPAASKSAASKSAASKSAASKPATPKPSAPKVPAAKKPSTAKGIAAAGAPSQLAPQGPNAPPPPPKPSYAAAVRSPPRSRSPGGPSFARGPPPRRLASASQASQDQQGAKSDLGTLSDAPAAPEQAQDSGARSPTSTRRRSHTPYNPPPSSPPGSPSEDESGSEYALKPALAEDGGSDDSGGASTSTPTGRWKKRAARSTPPAPPPKKKRLSKDTANGGSEGHSAAGVKALPKEKAAKADGSHKRAGSPTQTGLSPARKRPKSTRKDLWALEIWSDDVGSEASAPPLPQGGREKGASGKEKSVAVKAASTVKNTDGKGKGKGGKATGKAKQVVEKGRNAGGKGVENEVYARTGKKSAPAPAANEDAEDADAERPSQEEGQGQGTTPFGRRGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.28
3	0.23
4	0.18
5	0.2
6	0.22
7	0.22
8	0.24
9	0.24
10	0.23
11	0.22
12	0.23
13	0.28
14	0.28
15	0.3
16	0.3
17	0.3
18	0.31
19	0.33
20	0.36
21	0.3
22	0.27
23	0.26
24	0.29
25	0.29
26	0.28
27	0.27
28	0.21
29	0.2
30	0.21
31	0.21
32	0.21
33	0.29
34	0.39
35	0.42
36	0.5
37	0.52
38	0.56
39	0.63
40	0.69
41	0.7
42	0.69
43	0.73
44	0.69
45	0.7
46	0.65
47	0.6
48	0.54
49	0.49
50	0.46
51	0.38
52	0.36
53	0.3
54	0.3
55	0.28
56	0.24
57	0.22
58	0.2
59	0.21
60	0.19
61	0.18
62	0.18
63	0.17
64	0.15
65	0.13
66	0.11
67	0.1
68	0.1
69	0.11
70	0.1
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.12
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.1
86	0.09
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.11
91	0.14
92	0.19
93	0.22
94	0.28
95	0.35
96	0.42
97	0.52
98	0.58
99	0.64
100	0.63
101	0.63
102	0.62
103	0.59
104	0.59
105	0.56
106	0.59
107	0.59
108	0.61
109	0.64
110	0.61
111	0.61
112	0.6
113	0.57
114	0.56
115	0.55
116	0.56
117	0.55
118	0.6
119	0.63
120	0.65
121	0.66
122	0.67
123	0.68
124	0.69
125	0.71
126	0.73
127	0.68
128	0.65
129	0.61
130	0.57
131	0.48
132	0.38
133	0.34
134	0.27
135	0.22
136	0.18
137	0.16
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.12
149	0.16
150	0.19
151	0.23
152	0.25
153	0.29
154	0.3
155	0.31
156	0.34
157	0.38
158	0.41
159	0.43
160	0.4
161	0.37
162	0.36
163	0.34
164	0.31
165	0.23
166	0.16
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.14
175	0.11
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.11
180	0.15
181	0.16
182	0.19
183	0.18
184	0.22
185	0.24
186	0.25
187	0.25
188	0.24
189	0.26
190	0.24
191	0.26
192	0.25
193	0.26
194	0.27
195	0.28
196	0.29
197	0.28
198	0.27
199	0.26
200	0.23
201	0.2
202	0.19
203	0.2
204	0.2
205	0.2
206	0.23
207	0.25
208	0.32
209	0.37
210	0.34
211	0.36
212	0.35
213	0.38
214	0.36
215	0.34
216	0.29
217	0.27
218	0.32
219	0.3
220	0.28
221	0.26
222	0.28
223	0.31
224	0.31
225	0.28
226	0.24
227	0.26
228	0.29
229	0.29
230	0.26
231	0.25
232	0.26
233	0.29
234	0.29
235	0.26
236	0.25
237	0.26
238	0.29
239	0.29
240	0.26
241	0.25
242	0.26
243	0.32
244	0.33
245	0.3
246	0.3
247	0.3
248	0.35
249	0.36
250	0.33
251	0.29
252	0.29
253	0.36
254	0.36
255	0.34
256	0.31
257	0.31
258	0.37
259	0.36
260	0.33
261	0.27
262	0.28
263	0.34
264	0.33
265	0.3
266	0.26
267	0.28
268	0.31
269	0.31
270	0.28
271	0.24
272	0.26
273	0.32
274	0.34
275	0.32
276	0.33
277	0.36
278	0.42
279	0.43
280	0.4
281	0.38
282	0.41
283	0.48
284	0.46
285	0.43
286	0.43
287	0.47
288	0.53
289	0.56
290	0.55
291	0.49
292	0.5
293	0.52
294	0.49
295	0.45
296	0.39
297	0.31
298	0.28
299	0.26
300	0.21
301	0.17
302	0.13
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.06
312	0.11
313	0.11
314	0.15
315	0.16
316	0.18
317	0.22
318	0.24
319	0.29
320	0.26
321	0.28
322	0.28
323	0.28
324	0.3
325	0.31
326	0.32
327	0.27
328	0.32
329	0.33
330	0.35
331	0.35
332	0.33
333	0.33
334	0.34
335	0.34
336	0.33
337	0.38
338	0.39
339	0.4
340	0.38
341	0.36
342	0.36
343	0.36
344	0.37
345	0.33
346	0.31
347	0.35
348	0.4
349	0.39
350	0.36
351	0.38
352	0.34
353	0.37
354	0.39
355	0.33
356	0.29
357	0.29
358	0.28
359	0.25
360	0.24
361	0.18
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.11
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.08
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.1
389	0.13
390	0.22
391	0.31
392	0.36
393	0.37
394	0.42
395	0.5
396	0.55
397	0.62
398	0.63
399	0.65
400	0.69
401	0.76
402	0.72
403	0.65
404	0.63
405	0.59
406	0.52
407	0.42
408	0.35
409	0.3
410	0.33
411	0.32
412	0.31
413	0.29
414	0.25
415	0.25
416	0.24
417	0.2
418	0.16
419	0.16
420	0.13
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.15
445	0.24
446	0.31
447	0.37
448	0.46
449	0.54
450	0.63
451	0.72
452	0.72
453	0.73
454	0.75
455	0.78
456	0.77
457	0.76
458	0.77
459	0.75
460	0.78
461	0.76
462	0.79
463	0.8
464	0.8
465	0.81
466	0.82
467	0.83
468	0.83
469	0.82
470	0.81
471	0.77
472	0.71
473	0.61
474	0.5
475	0.43
476	0.34
477	0.25
478	0.15
479	0.09
480	0.08
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.13
486	0.16
487	0.17
488	0.19
489	0.25
490	0.26
491	0.31
492	0.33
493	0.32
494	0.31
495	0.41
496	0.47
497	0.47
498	0.49
499	0.43
500	0.43
501	0.41
502	0.43
503	0.38
504	0.34
505	0.31
506	0.29
507	0.29
508	0.3
509	0.32
510	0.38
511	0.39
512	0.43
513	0.5
514	0.53
515	0.6
516	0.68
517	0.74
518	0.74
519	0.78
520	0.8
521	0.78
522	0.82
523	0.77
524	0.72
525	0.67
526	0.58
527	0.49
528	0.39
529	0.31
530	0.22
531	0.2
532	0.13
533	0.08
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.12
543	0.12
544	0.16
545	0.22
546	0.25
547	0.28
548	0.28
549	0.3
550	0.32
551	0.39
552	0.41
553	0.38
554	0.38
555	0.37
556	0.4
557	0.4
558	0.39
559	0.35
560	0.3
561	0.27
562	0.26
563	0.32
564	0.31
565	0.31
566	0.29
567	0.3
568	0.35
569	0.34
570	0.4
571	0.38
572	0.4
573	0.43
574	0.49
575	0.51
576	0.51
577	0.56
578	0.54
579	0.55
580	0.59
581	0.62
582	0.6
583	0.61
584	0.61
585	0.58
586	0.59
587	0.58
588	0.61
589	0.58
590	0.58
591	0.55
592	0.56
593	0.56
594	0.5
595	0.46
596	0.4
597	0.39
598	0.35
599	0.35
600	0.29
601	0.27
602	0.27
603	0.24
604	0.23
605	0.19
606	0.19
607	0.18
608	0.21
609	0.22
610	0.27
611	0.31
612	0.36
613	0.44
614	0.46
615	0.48
616	0.49
617	0.52
618	0.45
619	0.41
620	0.34
621	0.26
622	0.22
623	0.17
624	0.14
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.13
631	0.15
632	0.15
633	0.16
634	0.18
635	0.23
636	0.23
637	0.23
638	0.21
639	0.21
640	0.22
641	0.22

A0A550C8S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer