Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DFL6

Protein Details
Accession C5DFL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-386IEYSDTGRPKRKTTKRVEYRFKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-375KRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.333, cyto 10, cyto_mito 7.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR012904  OGG_N  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008534  F:oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG lth:KLTH0D16126g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
PF07934  OGG_N  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MLKFQKLLFKRGELYLDKVLQCGQAFRWIFHEGLGQYSTTMRIDDRFRIVVLRQLEDNYIEYASLGAEECSSLGSFLKRYFRLEVPLSELYENQWLPRDSRFEKKRPHGIRILSQDPWETLLSYICSSNNNISRITKMCHALCIEFGNPVGQYDKVDYYSFPTSKELVERASEEKLRALGFGYRAKFLMKTADKMLKERLDMSDTQYLESWKDHLEYEQVRERVMGFDGVGPKVADCVCLSGLEMDEVVPVDVHIARIAQRDYRFVPRRQDIEELQIRYKNLPITRKKVNYELDLIRAMFKEKWGDFAGWAQGIVFAQEVGKTIGATSEGTTSRRKLEFEVKVELPSQGNSVKRELDEMVEEEIEYSDTGRPKRKTTKRVEYRFKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.46
4 0.42
5 0.39
6 0.37
7 0.34
8 0.31
9 0.28
10 0.22
11 0.26
12 0.26
13 0.26
14 0.29
15 0.27
16 0.27
17 0.25
18 0.29
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.18
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.13
27 0.14
28 0.12
29 0.16
30 0.2
31 0.24
32 0.28
33 0.27
34 0.27
35 0.29
36 0.29
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.23
41 0.24
42 0.24
43 0.23
44 0.23
45 0.19
46 0.16
47 0.13
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.09
62 0.11
63 0.15
64 0.23
65 0.24
66 0.27
67 0.31
68 0.32
69 0.37
70 0.38
71 0.35
72 0.34
73 0.35
74 0.33
75 0.29
76 0.27
77 0.23
78 0.25
79 0.23
80 0.17
81 0.2
82 0.19
83 0.21
84 0.24
85 0.3
86 0.28
87 0.39
88 0.46
89 0.49
90 0.58
91 0.65
92 0.72
93 0.7
94 0.73
95 0.7
96 0.67
97 0.67
98 0.64
99 0.6
100 0.51
101 0.46
102 0.4
103 0.33
104 0.31
105 0.23
106 0.16
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.18
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.23
120 0.26
121 0.27
122 0.28
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.25
127 0.26
128 0.23
129 0.22
130 0.22
131 0.18
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.14
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.21
153 0.18
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.12
168 0.16
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.16
174 0.15
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.21
179 0.27
180 0.27
181 0.28
182 0.33
183 0.26
184 0.25
185 0.24
186 0.22
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.22
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.13
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.14
203 0.14
204 0.18
205 0.23
206 0.23
207 0.22
208 0.22
209 0.22
210 0.18
211 0.17
212 0.13
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.11
245 0.12
246 0.16
247 0.17
248 0.2
249 0.23
250 0.33
251 0.38
252 0.4
253 0.48
254 0.49
255 0.51
256 0.51
257 0.53
258 0.44
259 0.46
260 0.47
261 0.42
262 0.39
263 0.38
264 0.36
265 0.32
266 0.33
267 0.3
268 0.29
269 0.35
270 0.4
271 0.43
272 0.52
273 0.57
274 0.58
275 0.61
276 0.61
277 0.55
278 0.53
279 0.49
280 0.43
281 0.39
282 0.36
283 0.29
284 0.25
285 0.24
286 0.18
287 0.18
288 0.22
289 0.2
290 0.24
291 0.24
292 0.24
293 0.23
294 0.25
295 0.26
296 0.19
297 0.18
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.09
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.13
316 0.14
317 0.17
318 0.21
319 0.23
320 0.28
321 0.3
322 0.31
323 0.31
324 0.4
325 0.45
326 0.46
327 0.51
328 0.46
329 0.45
330 0.45
331 0.42
332 0.33
333 0.26
334 0.25
335 0.22
336 0.25
337 0.26
338 0.28
339 0.29
340 0.28
341 0.3
342 0.28
343 0.26
344 0.25
345 0.24
346 0.23
347 0.2
348 0.19
349 0.17
350 0.16
351 0.14
352 0.11
353 0.1
354 0.12
355 0.18
356 0.24
357 0.32
358 0.36
359 0.45
360 0.56
361 0.65
362 0.71
363 0.77
364 0.82
365 0.84
366 0.91