FuNGI

A0A550C6Z5

Protein Details

Accession

A0A550C6Z5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-65	TDEPTPKRTKQAKAPHKHAASKS	Hydrophilic
749-769	GKMEGKERVRVRKEKDTRGED	Basic
781-811	GKNKAKYAKSTGKDKKHSSGKDKKRARVAAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-168	EKKP
177-186	KGKKGNPHPH
670-698	KDARKAAKAADAARVARRAAKKMAKGKGM
722-763	PNAKDRFGDKPNAKERFDKRKARMAMGGKMEGKERVRVRKEK
782-817	KNKAKYAKSTGKDKKHSSGKDKKRARVAAEGKRGGK

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 13, nucl 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSLASFLVPAGSKAVDSELDALFKDAEPVKPPTNKRKAAVQETDEPTPKRTKQAKAPHKHAASKSDADPEDDPMENTPYTPPAHISTSNSASKHPKNPNAKWAPEDETPAQRDARTLFVGNVPVEVMTRKPLIKALQRHLLSAYPNARAESIRFRNVPVPVKEKEKKPEEEKDDDTKGKKGNPHPHAKTGAGPTKPTHNERTAAWRMAAKETDPDDPTPSAKTYLTAAEKKRIAAITGEVGMGGAGSITAYLLLAHPTPQRRANLPPLPTADPYAAAVGIASKLDGVIWIPEVNGERVEGVEGRRLRVDVANPNVGVVPNVGVVPSAAAPRDAIAAIPAPADATATPVDAGEAQAVDATDAAVNSAPAAAVAIPSTLTTDLTALLPDPKRTLFVGNLDYGAKEDDVRAFFEAEVERLMAEGDGGSEGDGEESEVDEGEESDGEVEGEESEESEGEGDSEVEGEDSDGDEEEGESEEEGEEDSDGESEGEEEQEGDAPTTPPTAATTTTTTTAATTTTHVARVRIVRDPATGVGKGFAYVQFVDRTPVDELLALPLGALRFAKRKLRVQRCKTVPGGGRSSTAAGTDSKSATAAAKPGTRQGRTLDTRQGRTLDTRQGRTPGTRQGRTPDAGWGARPGSSSTRPSSTRTRTTLPIPSGDPTLGLRLAGLPKDARKAAKAADAARVARRAAKKMAKGKGMGAREECAGAGGTDAGANNRSGDKPNAKDRFGDKPNAKERFDKRKARMAMGGKMEGKERVRVRKEKDTRGEDVELDAWRCEEGGKNKAKYAKSTGKDKKHSSGKDKKRARVAAEGKRGGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.11
3	0.12
4	0.15
5	0.14
6	0.14
7	0.15
8	0.15
9	0.14
10	0.14
11	0.17
12	0.17
13	0.19
14	0.23
15	0.28
16	0.35
17	0.42
18	0.51
19	0.57
20	0.65
21	0.69
22	0.68
23	0.72
24	0.74
25	0.75
26	0.75
27	0.7
28	0.69
29	0.67
30	0.7
31	0.67
32	0.59
33	0.53
34	0.53
35	0.5
36	0.51
37	0.54
38	0.56
39	0.6
40	0.7
41	0.77
42	0.78
43	0.84
44	0.83
45	0.83
46	0.83
47	0.78
48	0.74
49	0.7
50	0.64
51	0.59
52	0.57
53	0.5
54	0.46
55	0.42
56	0.39
57	0.36
58	0.31
59	0.29
60	0.22
61	0.25
62	0.21
63	0.2
64	0.18
65	0.18
66	0.19
67	0.19
68	0.2
69	0.2
70	0.24
71	0.26
72	0.3
73	0.33
74	0.37
75	0.41
76	0.39
77	0.4
78	0.45
79	0.49
80	0.54
81	0.57
82	0.6
83	0.66
84	0.71
85	0.77
86	0.77
87	0.74
88	0.68
89	0.63
90	0.6
91	0.52
92	0.52
93	0.45
94	0.44
95	0.42
96	0.42
97	0.38
98	0.33
99	0.33
100	0.28
101	0.28
102	0.23
103	0.22
104	0.21
105	0.22
106	0.25
107	0.23
108	0.21
109	0.17
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.12
114	0.11
115	0.15
116	0.15
117	0.16
118	0.21
119	0.27
120	0.34
121	0.42
122	0.45
123	0.52
124	0.51
125	0.52
126	0.49
127	0.44
128	0.38
129	0.37
130	0.34
131	0.29
132	0.29
133	0.29
134	0.28
135	0.26
136	0.28
137	0.31
138	0.33
139	0.35
140	0.35
141	0.36
142	0.4
143	0.46
144	0.51
145	0.46
146	0.46
147	0.43
148	0.52
149	0.56
150	0.58
151	0.61
152	0.61
153	0.63
154	0.65
155	0.71
156	0.69
157	0.69
158	0.68
159	0.66
160	0.64
161	0.62
162	0.56
163	0.52
164	0.48
165	0.46
166	0.48
167	0.51
168	0.55
169	0.58
170	0.66
171	0.66
172	0.69
173	0.68
174	0.62
175	0.57
176	0.55
177	0.54
178	0.45
179	0.42
180	0.37
181	0.42
182	0.47
183	0.46
184	0.44
185	0.41
186	0.41
187	0.4
188	0.48
189	0.45
190	0.41
191	0.37
192	0.34
193	0.32
194	0.34
195	0.33
196	0.24
197	0.24
198	0.24
199	0.27
200	0.26
201	0.25
202	0.25
203	0.25
204	0.25
205	0.23
206	0.21
207	0.19
208	0.17
209	0.17
210	0.15
211	0.2
212	0.25
213	0.29
214	0.31
215	0.36
216	0.37
217	0.37
218	0.39
219	0.33
220	0.28
221	0.23
222	0.22
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.07
230	0.05
231	0.03
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.02
238	0.03
239	0.03
240	0.05
241	0.05
242	0.08
243	0.12
244	0.15
245	0.19
246	0.24
247	0.26
248	0.28
249	0.34
250	0.41
251	0.43
252	0.42
253	0.43
254	0.42
255	0.42
256	0.4
257	0.36
258	0.27
259	0.21
260	0.19
261	0.15
262	0.11
263	0.08
264	0.07
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.13
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.16
294	0.17
295	0.2
296	0.21
297	0.24
298	0.26
299	0.25
300	0.25
301	0.24
302	0.22
303	0.18
304	0.11
305	0.08
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.04
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.12
375	0.11
376	0.13
377	0.13
378	0.15
379	0.12
380	0.14
381	0.16
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.11
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.03
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.06
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.1
492	0.12
493	0.13
494	0.15
495	0.15
496	0.13
497	0.12
498	0.12
499	0.1
500	0.09
501	0.09
502	0.1
503	0.1
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.18
508	0.21
509	0.22
510	0.24
511	0.25
512	0.23
513	0.23
514	0.24
515	0.23
516	0.22
517	0.2
518	0.15
519	0.14
520	0.13
521	0.12
522	0.11
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.13
530	0.12
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.12
535	0.11
536	0.11
537	0.11
538	0.11
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.11
547	0.15
548	0.23
549	0.27
550	0.36
551	0.47
552	0.58
553	0.67
554	0.71
555	0.78
556	0.76
557	0.78
558	0.71
559	0.68
560	0.63
561	0.58
562	0.54
563	0.45
564	0.4
565	0.35
566	0.34
567	0.26
568	0.2
569	0.16
570	0.12
571	0.12
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.12
579	0.13
580	0.14
581	0.16
582	0.17
583	0.24
584	0.3
585	0.3
586	0.31
587	0.32
588	0.38
589	0.4
590	0.43
591	0.46
592	0.46
593	0.48
594	0.49
595	0.48
596	0.4
597	0.41
598	0.42
599	0.42
600	0.42
601	0.42
602	0.42
603	0.44
604	0.45
605	0.44
606	0.43
607	0.44
608	0.46
609	0.46
610	0.45
611	0.47
612	0.5
613	0.47
614	0.44
615	0.38
616	0.34
617	0.32
618	0.3
619	0.28
620	0.23
621	0.22
622	0.22
623	0.19
624	0.2
625	0.24
626	0.28
627	0.28
628	0.33
629	0.34
630	0.38
631	0.45
632	0.48
633	0.51
634	0.51
635	0.52
636	0.5
637	0.53
638	0.56
639	0.49
640	0.45
641	0.39
642	0.36
643	0.33
644	0.29
645	0.25
646	0.18
647	0.18
648	0.15
649	0.13
650	0.11
651	0.12
652	0.15
653	0.14
654	0.16
655	0.16
656	0.19
657	0.24
658	0.27
659	0.26
660	0.26
661	0.28
662	0.29
663	0.32
664	0.34
665	0.31
666	0.34
667	0.37
668	0.37
669	0.38
670	0.37
671	0.32
672	0.34
673	0.37
674	0.35
675	0.4
676	0.45
677	0.5
678	0.57
679	0.63
680	0.62
681	0.59
682	0.61
683	0.6
684	0.56
685	0.52
686	0.45
687	0.39
688	0.34
689	0.33
690	0.26
691	0.19
692	0.16
693	0.1
694	0.09
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.07
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.13
704	0.14
705	0.17
706	0.25
707	0.32
708	0.37
709	0.47
710	0.53
711	0.52
712	0.55
713	0.56
714	0.59
715	0.56
716	0.59
717	0.54
718	0.58
719	0.66
720	0.68
721	0.66
722	0.65
723	0.7
724	0.71
725	0.75
726	0.75
727	0.72
728	0.75
729	0.77
730	0.72
731	0.72
732	0.67
733	0.65
734	0.6
735	0.6
736	0.53
737	0.49
738	0.46
739	0.44
740	0.39
741	0.4
742	0.42
743	0.46
744	0.53
745	0.6
746	0.66
747	0.71
748	0.78
749	0.8
750	0.83
751	0.79
752	0.75
753	0.73
754	0.68
755	0.57
756	0.51
757	0.44
758	0.37
759	0.31
760	0.26
761	0.2
762	0.17
763	0.17
764	0.15
765	0.19
766	0.22
767	0.3
768	0.39
769	0.42
770	0.47
771	0.54
772	0.56
773	0.55
774	0.59
775	0.6
776	0.57
777	0.65
778	0.71
779	0.74
780	0.8
781	0.8
782	0.8
783	0.8
784	0.84
785	0.83
786	0.84
787	0.85
788	0.86
789	0.89
790	0.87
791	0.87
792	0.85
793	0.8
794	0.8
795	0.79
796	0.78
797	0.79

A0A550C6Z5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer