Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550C734

Protein Details
Accession A0A550C734    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53LKTCTSCRRVRYCSVQCQKDHydrophilic
353-380EMETCPRCRRAGRKRRQRLYSRTYHEYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-367RKR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046824  Mss51-like_C  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF20179  MSS51_C  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
PS01360  ZF_MYND_1  
PS50865  ZF_MYND_2  
Amino Acid Sequences MAEGGRMQRIPPHTAYVGQACFKCHKSVEESASLKTCTSCRRVRYCSVQCQKDDWKAHKAFCKALRLVESDPATYDTLSRFVLNYAEHHPYHADRVNKLGEGMGVNEANLLIRRLGRPMTTVERNVVGWQARCMTCARTDSLIRMEAARNNSDITPLSSCSDCHLSFYCKPEHWQDAQRIHADEPSEDGHHTLTQCAIQRQMRLDQLFRRSIEEIPEGPSTFQWAPDRQKDQWTSLADANWESEFGVVLSESLQLDTPEAVASSRSLGPMLHCASDGLSMPMTILYGLENLNSDDTWTTKATLTIHVLGPAVEPELMKAQLFEEIMHQLPKVQTLQIIFCGPDIPPNSENWMEMETCPRCRRAGRKRRQRLYSRTYHEYALRLGSAYEVPDLAVAFNSGCSQEARDSWVGTIKHLVQRKVPTIFTAFNREEGEAEGKLFANAGATLVPALGPRKNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.39
4 0.38
5 0.37
6 0.36
7 0.34
8 0.38
9 0.38
10 0.39
11 0.35
12 0.35
13 0.37
14 0.44
15 0.46
16 0.5
17 0.49
18 0.48
19 0.49
20 0.45
21 0.39
22 0.33
23 0.32
24 0.3
25 0.36
26 0.39
27 0.45
28 0.53
29 0.6
30 0.65
31 0.72
32 0.74
33 0.77
34 0.8
35 0.78
36 0.71
37 0.72
38 0.71
39 0.7
40 0.69
41 0.64
42 0.64
43 0.62
44 0.66
45 0.66
46 0.62
47 0.61
48 0.59
49 0.62
50 0.54
51 0.53
52 0.51
53 0.48
54 0.46
55 0.45
56 0.4
57 0.32
58 0.31
59 0.29
60 0.25
61 0.21
62 0.2
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.14
71 0.16
72 0.19
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.25
77 0.24
78 0.29
79 0.31
80 0.3
81 0.26
82 0.31
83 0.32
84 0.3
85 0.29
86 0.23
87 0.2
88 0.16
89 0.16
90 0.14
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.07
99 0.09
100 0.1
101 0.13
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.2
106 0.26
107 0.29
108 0.3
109 0.29
110 0.29
111 0.28
112 0.27
113 0.26
114 0.22
115 0.18
116 0.18
117 0.22
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.21
126 0.22
127 0.23
128 0.25
129 0.24
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.23
135 0.22
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.19
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.23
153 0.25
154 0.29
155 0.3
156 0.26
157 0.29
158 0.32
159 0.35
160 0.34
161 0.37
162 0.4
163 0.41
164 0.43
165 0.43
166 0.39
167 0.34
168 0.32
169 0.26
170 0.19
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.22
188 0.25
189 0.26
190 0.26
191 0.28
192 0.28
193 0.31
194 0.33
195 0.31
196 0.3
197 0.27
198 0.27
199 0.27
200 0.24
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.23
213 0.29
214 0.33
215 0.31
216 0.37
217 0.37
218 0.36
219 0.37
220 0.34
221 0.31
222 0.28
223 0.27
224 0.21
225 0.19
226 0.18
227 0.12
228 0.1
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.13
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.03
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.14
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.11
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.16
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.17
325 0.14
326 0.13
327 0.14
328 0.11
329 0.15
330 0.16
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.25
335 0.25
336 0.25
337 0.21
338 0.21
339 0.17
340 0.16
341 0.24
342 0.22
343 0.29
344 0.31
345 0.32
346 0.34
347 0.39
348 0.5
349 0.53
350 0.61
351 0.65
352 0.74
353 0.83
354 0.89
355 0.92
356 0.92
357 0.91
358 0.89
359 0.88
360 0.84
361 0.8
362 0.73
363 0.66
364 0.59
365 0.51
366 0.44
367 0.35
368 0.28
369 0.21
370 0.19
371 0.17
372 0.15
373 0.13
374 0.12
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.14
390 0.14
391 0.2
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.28
396 0.26
397 0.24
398 0.29
399 0.28
400 0.33
401 0.38
402 0.4
403 0.4
404 0.48
405 0.53
406 0.53
407 0.48
408 0.45
409 0.44
410 0.46
411 0.43
412 0.45
413 0.39
414 0.38
415 0.39
416 0.36
417 0.32
418 0.3
419 0.3
420 0.21
421 0.21
422 0.19
423 0.17
424 0.16
425 0.16
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.12