Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBQ1

Protein Details
Accession C5DBQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-111VTAAVQSVRRNRKRSSKSKPSNPQAQESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-100RNRKRSSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
KEGG lth:KLTH0A04444g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MIKPPRVQKPSSSGTTHKIRKQLNFTDERRWKQFSSRRLELIEKFGLGERKASEQDKSIRQIATILRTEFGYPLSSSSEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSSKSKPSNPQAQESVLEPFPVMTTTRESSGTDNLFFDRDGDQFARADRYTSGSNSSSSPPESSLTSFISHNQTLPTLFSHSGQRSGPTKNASTLGAVPHALPHLQPKPLSSSNKPVGDCENPGSSIVTAHTQNYDEVIKAVIADMVQNRVALHVQSRNDEVTPNLADFALSSNDGNLLNIAFQSHVAPSNPHTTAYPKARNPSGNDSNESKIPFFLREKILLHVQRSRACLEVSTAQGSLELYTNLSILGETSVKASVAFVMERFFSNLSSSSMEYVTSKLCSDQELALISVRIFGPATERHFDQLPHGAQLKLFYIVIGGIIKDFGFDPCIYPLSEIMHDVILRQFPLGHHPKGDFKRAAVMSTVSMAPAAANKDVYRVVLLKFKDKEQRFTFHLLSNGPPTIAEIIANSRSLFHIVSQTKSLYLIHNNRVINDDMELARVFNRFTSEEIVIELRDVKPEPLDGLAMLSTVSASEFSDPGSQKALPNRQNGASTTPTAYYPAASPLGPDCHSKESGDSENMPSTSTIQSDRDKVASEGSGAKEQAENEQKTGSEVGQNPETSASAPPRRRFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.64
3 0.66
4 0.63
5 0.64
6 0.65
7 0.67
8 0.72
9 0.74
10 0.73
11 0.74
12 0.72
13 0.75
14 0.77
15 0.76
16 0.73
17 0.69
18 0.62
19 0.63
20 0.67
21 0.65
22 0.65
23 0.65
24 0.63
25 0.62
26 0.66
27 0.59
28 0.58
29 0.51
30 0.42
31 0.36
32 0.36
33 0.36
34 0.3
35 0.3
36 0.25
37 0.28
38 0.33
39 0.34
40 0.32
41 0.34
42 0.41
43 0.45
44 0.48
45 0.48
46 0.43
47 0.41
48 0.44
49 0.41
50 0.41
51 0.38
52 0.34
53 0.3
54 0.3
55 0.31
56 0.26
57 0.23
58 0.18
59 0.13
60 0.14
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.2
65 0.23
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.2
76 0.24
77 0.33
78 0.43
79 0.51
80 0.57
81 0.62
82 0.69
83 0.74
84 0.8
85 0.82
86 0.82
87 0.85
88 0.9
89 0.93
90 0.91
91 0.91
92 0.84
93 0.8
94 0.72
95 0.63
96 0.54
97 0.44
98 0.4
99 0.29
100 0.25
101 0.18
102 0.15
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.09
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.26
114 0.27
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.15
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.17
132 0.19
133 0.2
134 0.21
135 0.24
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.22
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.2
152 0.24
153 0.23
154 0.22
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.22
164 0.22
165 0.25
166 0.25
167 0.27
168 0.27
169 0.3
170 0.33
171 0.3
172 0.3
173 0.29
174 0.3
175 0.27
176 0.25
177 0.23
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.15
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.27
192 0.34
193 0.4
194 0.36
195 0.42
196 0.46
197 0.51
198 0.5
199 0.44
200 0.42
201 0.39
202 0.38
203 0.31
204 0.26
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.16
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.11
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.19
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.1
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.11
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.23
279 0.3
280 0.34
281 0.32
282 0.36
283 0.39
284 0.42
285 0.43
286 0.46
287 0.46
288 0.42
289 0.43
290 0.41
291 0.39
292 0.38
293 0.35
294 0.26
295 0.19
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.2
302 0.21
303 0.22
304 0.28
305 0.27
306 0.28
307 0.28
308 0.3
309 0.31
310 0.32
311 0.31
312 0.25
313 0.23
314 0.2
315 0.18
316 0.17
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.09
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.09
381 0.12
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.22
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.2
394 0.19
395 0.2
396 0.18
397 0.12
398 0.11
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.18
433 0.23
434 0.23
435 0.24
436 0.26
437 0.34
438 0.37
439 0.44
440 0.36
441 0.31
442 0.38
443 0.36
444 0.35
445 0.28
446 0.25
447 0.18
448 0.18
449 0.18
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.13
465 0.17
466 0.18
467 0.24
468 0.26
469 0.31
470 0.39
471 0.4
472 0.47
473 0.46
474 0.51
475 0.47
476 0.51
477 0.48
478 0.41
479 0.42
480 0.34
481 0.32
482 0.3
483 0.27
484 0.21
485 0.18
486 0.16
487 0.14
488 0.13
489 0.11
490 0.08
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.12
497 0.13
498 0.13
499 0.1
500 0.18
501 0.2
502 0.22
503 0.24
504 0.24
505 0.22
506 0.23
507 0.23
508 0.18
509 0.25
510 0.3
511 0.33
512 0.39
513 0.39
514 0.38
515 0.4
516 0.38
517 0.3
518 0.23
519 0.21
520 0.15
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.13
525 0.13
526 0.12
527 0.1
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.18
532 0.18
533 0.17
534 0.19
535 0.19
536 0.15
537 0.15
538 0.16
539 0.12
540 0.14
541 0.15
542 0.14
543 0.14
544 0.15
545 0.15
546 0.13
547 0.14
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.05
559 0.07
560 0.07
561 0.09
562 0.16
563 0.16
564 0.17
565 0.2
566 0.21
567 0.24
568 0.33
569 0.41
570 0.41
571 0.47
572 0.5
573 0.5
574 0.52
575 0.5
576 0.46
577 0.4
578 0.36
579 0.31
580 0.28
581 0.25
582 0.25
583 0.23
584 0.19
585 0.16
586 0.17
587 0.17
588 0.15
589 0.16
590 0.17
591 0.22
592 0.22
593 0.25
594 0.25
595 0.29
596 0.3
597 0.3
598 0.29
599 0.3
600 0.34
601 0.35
602 0.34
603 0.32
604 0.35
605 0.34
606 0.32
607 0.27
608 0.25
609 0.22
610 0.22
611 0.21
612 0.22
613 0.27
614 0.3
615 0.32
616 0.31
617 0.32
618 0.3
619 0.3
620 0.26
621 0.24
622 0.25
623 0.25
624 0.28
625 0.25
626 0.26
627 0.25
628 0.25
629 0.31
630 0.36
631 0.35
632 0.32
633 0.33
634 0.32
635 0.32
636 0.34
637 0.26
638 0.24
639 0.26
640 0.3
641 0.33
642 0.34
643 0.32
644 0.31
645 0.3
646 0.24
647 0.26
648 0.29
649 0.33
650 0.42
651 0.48
652 0.55
653 0.59