Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CHD9

Protein Details
Accession A0A550CHD9    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-42ADAILSKVGKKKKRKAPASAPAPTGHydrophilic
238-259AAFLSKKKSKGPRRPEYTGPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-34KVGKKKKRKAP
75-77KKR
166-188KAAKAEAARLKREREEKEAAKME
243-252KKKSKGPRRP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018609  Bud13  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09736  Bud13  
Amino Acid Sequences MTDKQAYLAAKYMSGPKADAILSKVGKKKKRKAPASAPAPTGGVIVHDDASWADQGQEEEEDATEAVVASDRKFKKRKVARVEEGSGWATLQEGERTMKEETPPPGEDEQPTVVGETPFTGGLVPASQLRKILPQSAPVQDLSAEDIARAQETVYRDASGRKIDTKAAKAEAARLKREREEKEAAKMEWGKGLVQRAERDKQREEMEKNRARPFSRYADDKELNAELKQKELWNDPAAAFLSKKKSKGPRRPEYTGPPPPPNRYGIKPGYRWDGVDRGNGFEKKLFQAQNTRKQNTLASYQWGAEDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.2
4 0.23
5 0.22
6 0.22
7 0.19
8 0.24
9 0.25
10 0.32
11 0.38
12 0.44
13 0.52
14 0.61
15 0.68
16 0.71
17 0.79
18 0.82
19 0.85
20 0.88
21 0.89
22 0.88
23 0.84
24 0.76
25 0.66
26 0.57
27 0.46
28 0.36
29 0.25
30 0.16
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.17
58 0.21
59 0.29
60 0.36
61 0.4
62 0.48
63 0.57
64 0.66
65 0.69
66 0.76
67 0.76
68 0.77
69 0.77
70 0.68
71 0.61
72 0.52
73 0.41
74 0.3
75 0.21
76 0.14
77 0.1
78 0.1
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.16
87 0.2
88 0.22
89 0.25
90 0.26
91 0.27
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.18
98 0.17
99 0.14
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.14
118 0.15
119 0.2
120 0.18
121 0.21
122 0.24
123 0.26
124 0.27
125 0.23
126 0.22
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.11
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.2
151 0.23
152 0.24
153 0.25
154 0.23
155 0.24
156 0.22
157 0.28
158 0.29
159 0.29
160 0.32
161 0.33
162 0.34
163 0.37
164 0.44
165 0.41
166 0.42
167 0.46
168 0.43
169 0.47
170 0.48
171 0.43
172 0.41
173 0.39
174 0.33
175 0.27
176 0.26
177 0.19
178 0.18
179 0.21
180 0.19
181 0.2
182 0.23
183 0.27
184 0.33
185 0.37
186 0.4
187 0.39
188 0.41
189 0.43
190 0.47
191 0.47
192 0.49
193 0.55
194 0.57
195 0.6
196 0.62
197 0.61
198 0.55
199 0.54
200 0.51
201 0.48
202 0.46
203 0.45
204 0.44
205 0.48
206 0.48
207 0.44
208 0.41
209 0.36
210 0.32
211 0.28
212 0.29
213 0.2
214 0.21
215 0.23
216 0.22
217 0.23
218 0.26
219 0.3
220 0.26
221 0.27
222 0.25
223 0.26
224 0.25
225 0.23
226 0.19
227 0.19
228 0.27
229 0.29
230 0.31
231 0.37
232 0.46
233 0.56
234 0.66
235 0.72
236 0.73
237 0.78
238 0.82
239 0.82
240 0.81
241 0.8
242 0.79
243 0.75
244 0.74
245 0.71
246 0.71
247 0.66
248 0.62
249 0.57
250 0.52
251 0.54
252 0.54
253 0.56
254 0.55
255 0.56
256 0.58
257 0.54
258 0.51
259 0.47
260 0.45
261 0.39
262 0.42
263 0.38
264 0.35
265 0.42
266 0.41
267 0.38
268 0.34
269 0.35
270 0.32
271 0.39
272 0.37
273 0.35
274 0.45
275 0.52
276 0.6
277 0.67
278 0.65
279 0.6
280 0.6
281 0.6
282 0.54
283 0.51
284 0.44
285 0.4
286 0.39
287 0.37