FuNGI

A0A550C1N2

Protein Details

Accession

A0A550C1N2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-80	FNDEIKGKARKYKKERLKKDNSIASDD	Hydrophilic
97-117	AVQPRRSSRRISRQPTEEPEP	Hydrophilic
159-184	VEEAPPRKIGRRKKNADGSKRTSRRV	Basic
204-229	SSSPVRPSPPRSKARKSSTSRKSRLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-72	KGKARKYKKERLKK
164-182	PRKIGRRKKNADGSKRTSR
211-227	SPPRSKARKSSTSRKSR

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025856 HeH/LEM_domain IPR044780 Heh2/Src1 IPR041885 MAN1_winged_helix_dom IPR018996 MSC
Gene Ontology	GO:0005637 C:nuclear inner membrane GO:0003682 F:chromatin binding
Pfam	View protein in Pfam PF12949 HeH PF09402 MSC
CDD	cd12935 LEM_like

Amino Acid Sequences

MSRLTTAQVIAQGHYLEPDFNPASLTVSQLLGVFGYHNVQYPTPYNKPTLVKLFNDEIKGKARKYKKERLKKDNSIASDDGITDGVTGRLLNGGQAAVQPRRSSRRISRQPTEEPEPLAALPEPPKRRRSSAQPTAAAPTRRAPVQPIVIEESEPEDEVEEAPPRKIGRRKKNADGSKRTSRRVSGNDDSGWEDHNIFQSGAESSSPVRPSPPRSKARKSSTSRKSRLSSSAPPESPTRPSPPVKMLSPSPIRAPLSPPSPIPMRMPSGPFTFASSSPGPSGPFHGRNDRDVEWEEGATGVSEVPELDLVPEDDDDDDEDRPFLGGEEYEDVEVPIKGEEDDEVEAVGQRISEGPRRKLEAPRLQDEEPTPASPMRRLFFTLAILALGYLSWGYKQESAQIGFCTSEQNGEPMNSYLQDLRVRRIEALECTVKDPDDPLAIPVRLSQVNMSMSPEKLEQLSNSTYCPPVPLLPVPDSCTPCPAHAVCSRDTVTCNEKFELKPNKFLFFAPPHAKVDLNGTTQPLDAWRLLDGLPGLGPVAFPPRCIDDGKWETLAMKHANRLGNMLRATRSERLCAGEYQEYAAKDGGEARQWGFSYDELASIFRKMTGNNNEKFNIKTMLDEALGRLSQYEVIMQSTDDSGQRYYAHMEDNLSWACLAKVSVRETWAYYRLYVFAATALAIFGWWKLFQHRTKTVETQRARELALQVLETLQNQELMHYTDPVRAPEEYVGSARLRDLLLQQEWNKSQRERVWKHVERLVEGNENVRANLAEEGGGDEMRVWRWVGSVGMTPMRPRKNSNIFAPEEDYEEQEQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.17
3	0.14
4	0.13
5	0.19
6	0.18
7	0.17
8	0.18
9	0.17
10	0.2
11	0.19
12	0.21
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.15
17	0.14
18	0.1
19	0.1
20	0.09
21	0.08
22	0.1
23	0.1
24	0.13
25	0.15
26	0.15
27	0.18
28	0.23
29	0.3
30	0.34
31	0.37
32	0.37
33	0.42
34	0.46
35	0.49
36	0.53
37	0.51
38	0.48
39	0.5
40	0.54
41	0.52
42	0.53
43	0.47
44	0.41
45	0.44
46	0.47
47	0.45
48	0.47
49	0.52
50	0.58
51	0.66
52	0.73
53	0.75
54	0.81
55	0.88
56	0.9
57	0.92
58	0.92
59	0.92
60	0.89
61	0.82
62	0.78
63	0.68
64	0.58
65	0.48
66	0.38
67	0.29
68	0.21
69	0.16
70	0.1
71	0.09
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.06
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.11
83	0.16
84	0.18
85	0.21
86	0.24
87	0.29
88	0.37
89	0.39
90	0.45
91	0.51
92	0.58
93	0.66
94	0.73
95	0.76
96	0.76
97	0.82
98	0.8
99	0.77
100	0.69
101	0.6
102	0.52
103	0.45
104	0.37
105	0.3
106	0.23
107	0.18
108	0.22
109	0.28
110	0.36
111	0.4
112	0.48
113	0.51
114	0.58
115	0.61
116	0.66
117	0.68
118	0.7
119	0.73
120	0.69
121	0.66
122	0.66
123	0.64
124	0.56
125	0.47
126	0.41
127	0.35
128	0.33
129	0.32
130	0.3
131	0.3
132	0.35
133	0.34
134	0.33
135	0.34
136	0.32
137	0.31
138	0.27
139	0.25
140	0.19
141	0.17
142	0.14
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.14
148	0.15
149	0.15
150	0.18
151	0.19
152	0.26
153	0.34
154	0.43
155	0.49
156	0.59
157	0.66
158	0.73
159	0.83
160	0.85
161	0.87
162	0.87
163	0.84
164	0.84
165	0.82
166	0.77
167	0.71
168	0.66
169	0.63
170	0.6
171	0.6
172	0.56
173	0.54
174	0.5
175	0.47
176	0.45
177	0.37
178	0.33
179	0.25
180	0.19
181	0.15
182	0.17
183	0.17
184	0.14
185	0.14
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.11
190	0.09
191	0.1
192	0.14
193	0.16
194	0.15
195	0.18
196	0.22
197	0.3
198	0.4
199	0.48
200	0.53
201	0.61
202	0.7
203	0.76
204	0.81
205	0.83
206	0.81
207	0.82
208	0.82
209	0.85
210	0.81
211	0.79
212	0.73
213	0.68
214	0.67
215	0.63
216	0.61
217	0.57
218	0.6
219	0.53
220	0.51
221	0.49
222	0.45
223	0.43
224	0.38
225	0.37
226	0.35
227	0.37
228	0.39
229	0.42
230	0.43
231	0.4
232	0.4
233	0.36
234	0.38
235	0.39
236	0.37
237	0.33
238	0.34
239	0.33
240	0.31
241	0.33
242	0.29
243	0.28
244	0.28
245	0.26
246	0.24
247	0.25
248	0.26
249	0.25
250	0.24
251	0.24
252	0.25
253	0.27
254	0.27
255	0.27
256	0.27
257	0.24
258	0.24
259	0.22
260	0.19
261	0.22
262	0.2
263	0.19
264	0.18
265	0.19
266	0.17
267	0.15
268	0.2
269	0.21
270	0.25
271	0.27
272	0.34
273	0.35
274	0.36
275	0.41
276	0.37
277	0.34
278	0.32
279	0.31
280	0.24
281	0.22
282	0.19
283	0.14
284	0.13
285	0.09
286	0.07
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.05
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.07
339	0.14
340	0.19
341	0.23
342	0.26
343	0.3
344	0.34
345	0.39
346	0.47
347	0.49
348	0.48
349	0.49
350	0.51
351	0.47
352	0.46
353	0.4
354	0.35
355	0.28
356	0.23
357	0.19
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.2
362	0.16
363	0.16
364	0.17
365	0.18
366	0.17
367	0.17
368	0.15
369	0.11
370	0.1
371	0.09
372	0.07
373	0.05
374	0.04
375	0.03
376	0.02
377	0.02
378	0.03
379	0.04
380	0.05
381	0.07
382	0.07
383	0.11
384	0.14
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.13
390	0.14
391	0.11
392	0.08
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.1
405	0.14
406	0.14
407	0.16
408	0.19
409	0.19
410	0.19
411	0.2
412	0.19
413	0.15
414	0.19
415	0.19
416	0.16
417	0.17
418	0.17
419	0.15
420	0.14
421	0.13
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.13
431	0.12
432	0.12
433	0.11
434	0.11
435	0.12
436	0.12
437	0.15
438	0.13
439	0.13
440	0.14
441	0.14
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.09
446	0.11
447	0.14
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.13
453	0.14
454	0.11
455	0.1
456	0.12
457	0.12
458	0.14
459	0.16
460	0.17
461	0.2
462	0.24
463	0.26
464	0.24
465	0.26
466	0.23
467	0.21
468	0.24
469	0.21
470	0.21
471	0.22
472	0.24
473	0.22
474	0.26
475	0.27
476	0.24
477	0.25
478	0.24
479	0.25
480	0.25
481	0.26
482	0.23
483	0.25
484	0.25
485	0.33
486	0.4
487	0.36
488	0.42
489	0.42
490	0.43
491	0.41
492	0.41
493	0.38
494	0.31
495	0.37
496	0.33
497	0.34
498	0.34
499	0.34
500	0.33
501	0.27
502	0.29
503	0.25
504	0.23
505	0.2
506	0.19
507	0.19
508	0.19
509	0.18
510	0.14
511	0.12
512	0.1
513	0.1
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.1
518	0.09
519	0.07
520	0.07
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.04
525	0.04
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.13
530	0.16
531	0.18
532	0.2
533	0.2
534	0.23
535	0.27
536	0.29
537	0.29
538	0.26
539	0.25
540	0.24
541	0.28
542	0.23
543	0.2
544	0.2
545	0.25
546	0.27
547	0.26
548	0.29
549	0.26
550	0.27
551	0.27
552	0.26
553	0.23
554	0.23
555	0.27
556	0.29
557	0.29
558	0.25
559	0.25
560	0.27
561	0.28
562	0.27
563	0.27
564	0.24
565	0.23
566	0.22
567	0.24
568	0.2
569	0.19
570	0.19
571	0.14
572	0.11
573	0.14
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.13
578	0.16
579	0.16
580	0.17
581	0.16
582	0.14
583	0.15
584	0.13
585	0.14
586	0.11
587	0.12
588	0.12
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.12
593	0.12
594	0.2
595	0.3
596	0.37
597	0.4
598	0.44
599	0.44
600	0.45
601	0.45
602	0.39
603	0.33
604	0.26
605	0.23
606	0.2
607	0.2
608	0.19
609	0.18
610	0.16
611	0.14
612	0.14
613	0.12
614	0.11
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.08
620	0.09
621	0.1
622	0.09
623	0.1
624	0.09
625	0.11
626	0.1
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.13
631	0.13
632	0.15
633	0.15
634	0.17
635	0.16
636	0.18
637	0.17
638	0.21
639	0.2
640	0.17
641	0.16
642	0.13
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.1
647	0.14
648	0.17
649	0.2
650	0.21
651	0.23
652	0.25
653	0.28
654	0.29
655	0.26
656	0.24
657	0.23
658	0.22
659	0.21
660	0.19
661	0.15
662	0.11
663	0.1
664	0.09
665	0.08
666	0.06
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.07
674	0.13
675	0.21
676	0.28
677	0.36
678	0.44
679	0.47
680	0.53
681	0.61
682	0.65
683	0.67
684	0.65
685	0.62
686	0.6
687	0.58
688	0.53
689	0.47
690	0.4
691	0.34
692	0.31
693	0.26
694	0.2
695	0.2
696	0.19
697	0.16
698	0.16
699	0.12
700	0.14
701	0.13
702	0.14
703	0.14
704	0.16
705	0.17
706	0.17
707	0.18
708	0.21
709	0.23
710	0.24
711	0.25
712	0.22
713	0.23
714	0.23
715	0.24
716	0.21
717	0.2
718	0.21
719	0.19
720	0.2
721	0.18
722	0.17
723	0.15
724	0.15
725	0.17
726	0.21
727	0.23
728	0.3
729	0.32
730	0.38
731	0.42
732	0.45
733	0.48
734	0.43
735	0.48
736	0.49
737	0.57
738	0.55
739	0.61
740	0.68
741	0.7
742	0.74
743	0.71
744	0.66
745	0.59
746	0.57
747	0.52
748	0.47
749	0.4
750	0.37
751	0.38
752	0.35
753	0.31
754	0.27
755	0.22
756	0.17
757	0.18
758	0.15
759	0.1
760	0.1
761	0.12
762	0.12
763	0.11
764	0.1
765	0.1
766	0.11
767	0.12
768	0.13
769	0.12
770	0.11
771	0.12
772	0.14
773	0.13
774	0.14
775	0.17
776	0.2
777	0.23
778	0.24
779	0.3
780	0.37
781	0.44
782	0.45
783	0.47
784	0.54
785	0.6
786	0.66
787	0.69
788	0.69
789	0.65
790	0.65
791	0.64
792	0.55
793	0.49
794	0.43
795	0.38

A0A550C1N2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer