FuNGI

A0A550BYB4

Protein Details

Accession

A0A550BYB4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-95	LAFAPVRRPQKQKPAAPRLPA	Hydrophilic
158-181	SHGSKKKGGHGKGKGRKNKNVPVI	Basic
200-219	EYKVWKSKERIERRHRLAKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
159-176	HGSKKKGGHGKGKGRKNK
205-225	KSKERIERRHRLAKESLKRRR

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto 7.5, cyto_nucl 6, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000467 G_patch_dom IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR040052 RBM17 IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF01585 G-patch
PROSITE	View protein in PROSITE PS50174 G_PATCH PS50102 RRM
CDD	cd12374 RRM_UHM_SPF45_PUF60

Amino Acid Sequences

MSGLYGGIKFASGTTVNYSATPPPTRPAASEKPAAQPAASAPKEASAAPENPIQGEITPPTTDASKGAAGWSASLAFAPVRRPQKQKPAAPRLPAGIALNALSATATVFAPPVLVEPPKPAEDKAGASASDSQTQGWGKKVKPPSMILEEDVNGFKASHGSKKKGGHGKGKGRKNKNVPVIVAWDPMEPYDPVRPNDYNEYKVWKSKERIERRHRLAKESLKRRRSGSYSGSDYTDSEDERPRKSGRYDESQDQWSRGGDEMAVDPPPAVVDKTLSGDDAYARRLAMSAGIRPQAPPAFEPPVAVEPSPTPSGTLDAPSLAFAVPAPDETGEEAYLRRLAMATRPQPAAAQPSPPAASPSPLAYNPFAPPSVPPPPPPAGGPPSAVNAAVLDARAKAAAAIAARLSAMAPGGSKPGETTSAQASVPSQATPPPDQHSFAARLMAKYGHKEGQGLGADGSGIVNALTVEQVGAGAGGKKKGKQQQQQQLAPQPKGLAAKMGKIVNNNEDARAREDRERFGEPSRVVVLTNMVSPEDVGDEELRGEIGDECSKNGTVQRVIVHLVTPPPPTLEDAVRIFVLFQGPAGAWKTVREMDGRYFGGRSVRARYYPESSFTQYSLDQPL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.2
4	0.21
5	0.23
6	0.23
7	0.29
8	0.31
9	0.28
10	0.29
11	0.34
12	0.34
13	0.36
14	0.4
15	0.43
16	0.44
17	0.5
18	0.49
19	0.5
20	0.53
21	0.51
22	0.41
23	0.34
24	0.33
25	0.37
26	0.34
27	0.28
28	0.24
29	0.25
30	0.27
31	0.25
32	0.25
33	0.2
34	0.21
35	0.23
36	0.26
37	0.24
38	0.24
39	0.25
40	0.21
41	0.15
42	0.17
43	0.17
44	0.16
45	0.16
46	0.16
47	0.16
48	0.17
49	0.17
50	0.15
51	0.16
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.16
56	0.15
57	0.15
58	0.14
59	0.12
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.08
64	0.1
65	0.13
66	0.2
67	0.28
68	0.35
69	0.43
70	0.51
71	0.61
72	0.69
73	0.75
74	0.78
75	0.81
76	0.81
77	0.79
78	0.73
79	0.65
80	0.57
81	0.5
82	0.41
83	0.3
84	0.24
85	0.18
86	0.15
87	0.12
88	0.1
89	0.07
90	0.06
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.08
101	0.1
102	0.1
103	0.14
104	0.18
105	0.21
106	0.22
107	0.21
108	0.23
109	0.25
110	0.26
111	0.26
112	0.24
113	0.21
114	0.22
115	0.27
116	0.24
117	0.25
118	0.23
119	0.19
120	0.21
121	0.24
122	0.24
123	0.25
124	0.29
125	0.26
126	0.34
127	0.42
128	0.45
129	0.47
130	0.48
131	0.49
132	0.49
133	0.5
134	0.43
135	0.37
136	0.32
137	0.29
138	0.26
139	0.2
140	0.14
141	0.12
142	0.11
143	0.13
144	0.14
145	0.21
146	0.27
147	0.31
148	0.38
149	0.43
150	0.51
151	0.56
152	0.61
153	0.63
154	0.66
155	0.72
156	0.75
157	0.79
158	0.81
159	0.8
160	0.82
161	0.82
162	0.8
163	0.78
164	0.74
165	0.66
166	0.58
167	0.55
168	0.47
169	0.4
170	0.32
171	0.23
172	0.18
173	0.17
174	0.16
175	0.11
176	0.12
177	0.17
178	0.2
179	0.21
180	0.26
181	0.27
182	0.29
183	0.38
184	0.39
185	0.35
186	0.33
187	0.39
188	0.36
189	0.4
190	0.41
191	0.39
192	0.4
193	0.46
194	0.54
195	0.58
196	0.67
197	0.72
198	0.78
199	0.79
200	0.84
201	0.77
202	0.73
203	0.7
204	0.7
205	0.7
206	0.7
207	0.72
208	0.69
209	0.7
210	0.67
211	0.65
212	0.59
213	0.56
214	0.51
215	0.48
216	0.47
217	0.45
218	0.43
219	0.37
220	0.32
221	0.28
222	0.23
223	0.17
224	0.15
225	0.2
226	0.22
227	0.23
228	0.27
229	0.25
230	0.28
231	0.3
232	0.35
233	0.33
234	0.39
235	0.42
236	0.43
237	0.46
238	0.48
239	0.47
240	0.4
241	0.36
242	0.27
243	0.23
244	0.19
245	0.15
246	0.09
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.04
258	0.05
259	0.06
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.12
277	0.14
278	0.14
279	0.14
280	0.16
281	0.14
282	0.14
283	0.13
284	0.14
285	0.17
286	0.16
287	0.17
288	0.16
289	0.17
290	0.17
291	0.16
292	0.13
293	0.09
294	0.12
295	0.13
296	0.12
297	0.1
298	0.09
299	0.11
300	0.1
301	0.11
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.04
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.04
315	0.05
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.1
328	0.18
329	0.2
330	0.23
331	0.23
332	0.23
333	0.23
334	0.24
335	0.27
336	0.2
337	0.19
338	0.17
339	0.18
340	0.19
341	0.19
342	0.2
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.14
349	0.16
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.12
356	0.12
357	0.15
358	0.21
359	0.21
360	0.21
361	0.25
362	0.27
363	0.28
364	0.28
365	0.27
366	0.24
367	0.24
368	0.24
369	0.2
370	0.19
371	0.19
372	0.18
373	0.13
374	0.1
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.06
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.13
414	0.11
415	0.12
416	0.15
417	0.17
418	0.19
419	0.21
420	0.23
421	0.24
422	0.25
423	0.27
424	0.27
425	0.25
426	0.28
427	0.25
428	0.23
429	0.23
430	0.25
431	0.23
432	0.23
433	0.27
434	0.24
435	0.24
436	0.24
437	0.23
438	0.26
439	0.25
440	0.22
441	0.18
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.05
447	0.04
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.07
461	0.08
462	0.13
463	0.15
464	0.18
465	0.26
466	0.34
467	0.44
468	0.51
469	0.6
470	0.66
471	0.74
472	0.78
473	0.77
474	0.78
475	0.75
476	0.66
477	0.57
478	0.47
479	0.4
480	0.37
481	0.3
482	0.28
483	0.22
484	0.25
485	0.29
486	0.31
487	0.3
488	0.32
489	0.35
490	0.31
491	0.37
492	0.34
493	0.32
494	0.31
495	0.31
496	0.32
497	0.33
498	0.33
499	0.34
500	0.37
501	0.4
502	0.42
503	0.44
504	0.42
505	0.42
506	0.46
507	0.38
508	0.38
509	0.35
510	0.31
511	0.26
512	0.24
513	0.23
514	0.16
515	0.18
516	0.14
517	0.12
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.09
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.1
533	0.15
534	0.15
535	0.17
536	0.19
537	0.2
538	0.2
539	0.22
540	0.25
541	0.22
542	0.25
543	0.26
544	0.25
545	0.27
546	0.26
547	0.23
548	0.2
549	0.22
550	0.22
551	0.22
552	0.2
553	0.2
554	0.21
555	0.23
556	0.24
557	0.22
558	0.24
559	0.24
560	0.26
561	0.24
562	0.23
563	0.2
564	0.18
565	0.18
566	0.12
567	0.1
568	0.1
569	0.1
570	0.13
571	0.15
572	0.15
573	0.14
574	0.16
575	0.2
576	0.21
577	0.23
578	0.23
579	0.25
580	0.28
581	0.35
582	0.35
583	0.33
584	0.3
585	0.3
586	0.33
587	0.34
588	0.33
589	0.33
590	0.37
591	0.39
592	0.44
593	0.47
594	0.47
595	0.46
596	0.47
597	0.46
598	0.46
599	0.45
600	0.4
601	0.38
602	0.33

A0A550BYB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer