Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DLQ4

Protein Details
Accession C5DLQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34KAGKVSKKTASSEKKKKRANIFNDADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-26KVSKKTASSEKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0G02618g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MVGFSINLKAGKVSKKTASSEKKKKRANIFNDADANKVPKSKIRITHIDEHQNSAEPQLVIKPPPANKGWNVPIVDENGRDEESLGYGLNQSTSGARDLRRQHNREALALSRKPNSVVHLPTETAQEEYETVPVEEFGDALLRGMGWNGELENEVVAKSAGKSKPVLPHEQFRPSLLGLGAKASQNTVSEGINKSEPFLPIIKVSRRRGKPIEEQQLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.45
3 0.5
4 0.58
5 0.63
6 0.67
7 0.73
8 0.78
9 0.81
10 0.83
11 0.87
12 0.87
13 0.87
14 0.84
15 0.83
16 0.78
17 0.75
18 0.75
19 0.66
20 0.57
21 0.49
22 0.43
23 0.34
24 0.31
25 0.26
26 0.23
27 0.3
28 0.35
29 0.41
30 0.45
31 0.53
32 0.56
33 0.64
34 0.66
35 0.69
36 0.62
37 0.58
38 0.52
39 0.46
40 0.39
41 0.31
42 0.27
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.15
48 0.19
49 0.23
50 0.22
51 0.27
52 0.29
53 0.28
54 0.28
55 0.34
56 0.35
57 0.35
58 0.33
59 0.3
60 0.29
61 0.29
62 0.28
63 0.21
64 0.19
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.17
85 0.24
86 0.33
87 0.42
88 0.44
89 0.46
90 0.51
91 0.51
92 0.46
93 0.41
94 0.35
95 0.32
96 0.32
97 0.3
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.21
104 0.2
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.2
109 0.21
110 0.18
111 0.14
112 0.12
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.18
150 0.23
151 0.31
152 0.35
153 0.44
154 0.4
155 0.47
156 0.51
157 0.56
158 0.53
159 0.46
160 0.44
161 0.35
162 0.33
163 0.26
164 0.22
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.17
177 0.19
178 0.21
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.23
188 0.31
189 0.37
190 0.43
191 0.52
192 0.59
193 0.63
194 0.7
195 0.72
196 0.73
197 0.75
198 0.76