Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CMD4

Protein Details
Accession A0A550CMD4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-79EWLQCPNCRTKAKKKKSRRRYPDTPTLWTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-70KAKKKKSRRR
Subcellular Location(s) mito 19, cyto 5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
Amino Acid Sequences MPKAATQKYYAVLNGRHGPKIYDTIDEYRAALDGLSGAVGQKFYSRGKAEEWLQCPNCRTKAKKKKSRRRYPDTPTLWTEFEDDPRIIESKADAIVEVAKVEACVQTDEPVEYDAPIRIQGSPPPLPTPAGSPKREYPSCAATVPPAEHASAGPERQVAAVAPVVTNDVQLSPEQLMVLDLVKTGKNVFFTGPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.41
4 0.39
5 0.38
6 0.35
7 0.39
8 0.34
9 0.29
10 0.3
11 0.31
12 0.33
13 0.31
14 0.28
15 0.22
16 0.2
17 0.17
18 0.12
19 0.08
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.04
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.07
29 0.1
30 0.11
31 0.17
32 0.19
33 0.2
34 0.22
35 0.28
36 0.32
37 0.36
38 0.38
39 0.41
40 0.41
41 0.42
42 0.42
43 0.43
44 0.44
45 0.44
46 0.49
47 0.51
48 0.6
49 0.69
50 0.77
51 0.82
52 0.86
53 0.91
54 0.95
55 0.94
56 0.92
57 0.91
58 0.89
59 0.88
60 0.82
61 0.76
62 0.68
63 0.6
64 0.51
65 0.41
66 0.36
67 0.26
68 0.23
69 0.21
70 0.17
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.1
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.2
114 0.2
115 0.23
116 0.27
117 0.32
118 0.33
119 0.35
120 0.4
121 0.47
122 0.48
123 0.45
124 0.4
125 0.37
126 0.38
127 0.34
128 0.29
129 0.23
130 0.25
131 0.23
132 0.21
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.14
173 0.15
174 0.17