Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJW8

Protein Details
Accession C5DJW8    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-177KVYKCRKNKLWGYERKKGPRBasic
427-460NRAAWTKEMKSKKRDAIRQLKRKNFKAKGNGILIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-455MKSKKRDAIRQLKRKNFKAKG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8, mito 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0F19712g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTTEKRLFVGNIFNDPEGSLKELYHRFQRFGKCISTEFERYDHFGYIDMEFDNEAAFLKLKQSFNGVKFKGNALKVDIAKMGWKERWEMEQEQGQRVEQVKEKQIRKSQWEHFKKLENINMSWTDRQQLIAGRLRRTPRGRAQLRNITFRVNQDGELKVYKCRKNKLWGYERKKGPRDLVCKFTDHHYWRDGNDHIVDRLDYSRAAPHWGPRRDTNIQTTEDDHSEEESFEKDKTKDVLANILGNFDFDKPLALEEDEGEDAASDYEYNALFEGNEASGRKTEVAAQPAAEKSPEASEDEGQEEFIPTFAPAGTEAESSTGGENNVEKLRSLFNPGHQGADFRLIDESDEDIDNEKSVPQTDVPYEEEELVLETHVDAEAPTHSSKGLFFPHFTSPFLHSQSQLAKLKPPTDHQELFSNWENHYWENRAAWTKEMKSKKRDAIRQLKRKNFKAKGNGILI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.29
4 0.21
5 0.22
6 0.17
7 0.15
8 0.22
9 0.27
10 0.31
11 0.39
12 0.4
13 0.41
14 0.47
15 0.56
16 0.54
17 0.54
18 0.56
19 0.5
20 0.49
21 0.49
22 0.49
23 0.44
24 0.41
25 0.39
26 0.35
27 0.36
28 0.36
29 0.33
30 0.26
31 0.23
32 0.23
33 0.2
34 0.19
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.12
46 0.19
47 0.2
48 0.21
49 0.27
50 0.33
51 0.38
52 0.48
53 0.44
54 0.43
55 0.44
56 0.48
57 0.48
58 0.44
59 0.41
60 0.35
61 0.4
62 0.36
63 0.37
64 0.32
65 0.25
66 0.27
67 0.27
68 0.28
69 0.24
70 0.25
71 0.26
72 0.27
73 0.31
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.36
78 0.38
79 0.4
80 0.38
81 0.34
82 0.32
83 0.32
84 0.32
85 0.31
86 0.33
87 0.37
88 0.45
89 0.49
90 0.54
91 0.59
92 0.62
93 0.64
94 0.67
95 0.67
96 0.7
97 0.74
98 0.72
99 0.68
100 0.7
101 0.69
102 0.66
103 0.63
104 0.56
105 0.48
106 0.46
107 0.46
108 0.41
109 0.36
110 0.31
111 0.27
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.22
117 0.28
118 0.32
119 0.32
120 0.37
121 0.4
122 0.46
123 0.47
124 0.49
125 0.51
126 0.57
127 0.62
128 0.64
129 0.7
130 0.72
131 0.72
132 0.71
133 0.62
134 0.56
135 0.51
136 0.45
137 0.42
138 0.33
139 0.31
140 0.27
141 0.27
142 0.24
143 0.26
144 0.25
145 0.25
146 0.32
147 0.37
148 0.4
149 0.46
150 0.5
151 0.56
152 0.63
153 0.67
154 0.69
155 0.74
156 0.76
157 0.78
158 0.8
159 0.79
160 0.77
161 0.71
162 0.67
163 0.65
164 0.64
165 0.59
166 0.57
167 0.5
168 0.46
169 0.43
170 0.39
171 0.4
172 0.35
173 0.34
174 0.32
175 0.32
176 0.31
177 0.35
178 0.32
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.1
192 0.14
193 0.13
194 0.19
195 0.28
196 0.31
197 0.34
198 0.34
199 0.41
200 0.42
201 0.44
202 0.43
203 0.38
204 0.36
205 0.34
206 0.34
207 0.29
208 0.25
209 0.23
210 0.17
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.2
226 0.17
227 0.2
228 0.17
229 0.17
230 0.15
231 0.13
232 0.13
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.03
252 0.03
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.14
270 0.15
271 0.18
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.15
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.11
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.22
319 0.21
320 0.23
321 0.31
322 0.32
323 0.33
324 0.3
325 0.3
326 0.25
327 0.3
328 0.26
329 0.18
330 0.18
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.11
347 0.14
348 0.15
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.21
353 0.2
354 0.18
355 0.15
356 0.15
357 0.12
358 0.09
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.21
375 0.2
376 0.22
377 0.25
378 0.33
379 0.34
380 0.34
381 0.33
382 0.31
383 0.35
384 0.38
385 0.36
386 0.29
387 0.32
388 0.36
389 0.41
390 0.42
391 0.37
392 0.4
393 0.43
394 0.47
395 0.46
396 0.48
397 0.47
398 0.51
399 0.52
400 0.48
401 0.5
402 0.46
403 0.48
404 0.5
405 0.44
406 0.36
407 0.38
408 0.37
409 0.33
410 0.37
411 0.35
412 0.3
413 0.3
414 0.35
415 0.38
416 0.37
417 0.39
418 0.42
419 0.44
420 0.51
421 0.59
422 0.62
423 0.63
424 0.71
425 0.76
426 0.78
427 0.81
428 0.83
429 0.83
430 0.86
431 0.88
432 0.89
433 0.91
434 0.91
435 0.91
436 0.91
437 0.89
438 0.88
439 0.87
440 0.85