Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C544

Protein Details
Accession A0A550C544    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
649-673LKAPGRGFRPRPRASPRRRLSHADABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
650-667KAPGRGFRPRPRASPRRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025332  DUF4238  
Pfam View protein in Pfam  
PF14022  DUF4238  
Amino Acid Sequences MSYPASFYADNKLAQSKAERNKTFRATGVIPEYINFYDIATRTLDVRPIGQVYGVKNLYRDASNLSNANHIEEKLAKLENRAAQVINFMHESIPTGTFTVSRSDLGQLRKFLFIMQYRRQAMSLSYFDKDNPENSFLRRRLEEYGETKGLHTPVDIWLDAMQYYLDTPHDQLNKDGAAWSDKYKPSLNAMLGVLTDPNTVENVKAMAYQQDTQMYFLGVWEAADADEFIIAPHSFGLWEGYVAPTREFQLHHLYIVSPRLAIVLRSNFLRGGVDWDGGIRARSISDFIDIPLEPPTPTYAGNFFTLRSESELQDYRVSAEAQQDKFAFRIVKLSSAQTVAVNAVTLLNAHRDGSLTFTSKSMVVRAIRLYLPRVPAWDDQNRDSYKALVQQLVRPPASDPPPVREYWVFREEAFDSLMMLVLAATRSEDFLPFYDCGVVAVEDSGELVGPEARARGDMVFADDYVRHVLNVVAHLYLHANTKKLTGLDTLPIACPYGLDPESSIRLINAARPLLRAVVPSCACSSTSSPTDRLLEAAVIVKVLDAVVQDARLRHALRKRCPALASYLYICPESTPLTIPIDPMAMQKNLNDILFAMVDGDMRFPNSYQVGRTLHFYYSLLQDTANITNPVVVQCRRVLPMVISRMQKLLKAPGRGFRPRPRASPRRRLSHADAVLIMNMLTAICNNLGFNPSTSDSSNTATGKMLAWTGDAVIFGFLDWLLKNRHDVAEGLLSDLSPTGLFSFIEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.37
3 0.38
4 0.44
5 0.54
6 0.58
7 0.59
8 0.67
9 0.7
10 0.67
11 0.6
12 0.56
13 0.48
14 0.48
15 0.48
16 0.42
17 0.35
18 0.32
19 0.34
20 0.27
21 0.26
22 0.19
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.15
28 0.15
29 0.17
30 0.19
31 0.22
32 0.18
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.23
39 0.21
40 0.29
41 0.29
42 0.27
43 0.26
44 0.27
45 0.28
46 0.25
47 0.25
48 0.22
49 0.24
50 0.27
51 0.3
52 0.29
53 0.32
54 0.31
55 0.34
56 0.3
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.23
62 0.27
63 0.24
64 0.25
65 0.32
66 0.33
67 0.34
68 0.34
69 0.31
70 0.27
71 0.31
72 0.29
73 0.24
74 0.21
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.18
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.2
91 0.24
92 0.3
93 0.34
94 0.34
95 0.35
96 0.36
97 0.34
98 0.31
99 0.33
100 0.34
101 0.37
102 0.4
103 0.47
104 0.48
105 0.49
106 0.48
107 0.42
108 0.37
109 0.35
110 0.33
111 0.28
112 0.26
113 0.26
114 0.26
115 0.29
116 0.29
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.27
121 0.31
122 0.4
123 0.38
124 0.41
125 0.4
126 0.39
127 0.4
128 0.43
129 0.45
130 0.39
131 0.43
132 0.41
133 0.39
134 0.37
135 0.35
136 0.31
137 0.24
138 0.2
139 0.15
140 0.15
141 0.18
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.09
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.15
156 0.19
157 0.2
158 0.22
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.24
168 0.25
169 0.28
170 0.29
171 0.3
172 0.31
173 0.35
174 0.32
175 0.27
176 0.26
177 0.23
178 0.2
179 0.19
180 0.15
181 0.1
182 0.09
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.11
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.19
201 0.16
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.08
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.08
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.22
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.2
241 0.2
242 0.22
243 0.19
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.1
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.13
306 0.17
307 0.22
308 0.21
309 0.24
310 0.23
311 0.22
312 0.22
313 0.23
314 0.18
315 0.11
316 0.16
317 0.14
318 0.18
319 0.18
320 0.19
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.11
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.17
357 0.15
358 0.17
359 0.16
360 0.16
361 0.18
362 0.19
363 0.24
364 0.26
365 0.26
366 0.26
367 0.32
368 0.32
369 0.3
370 0.27
371 0.23
372 0.2
373 0.23
374 0.22
375 0.19
376 0.19
377 0.22
378 0.27
379 0.3
380 0.28
381 0.23
382 0.23
383 0.24
384 0.27
385 0.27
386 0.23
387 0.24
388 0.27
389 0.27
390 0.29
391 0.26
392 0.26
393 0.27
394 0.29
395 0.25
396 0.22
397 0.25
398 0.23
399 0.21
400 0.18
401 0.12
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.06
406 0.05
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.02
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.11
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.15
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.13
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.09
492 0.11
493 0.11
494 0.13
495 0.15
496 0.15
497 0.15
498 0.16
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.16
503 0.13
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.19
508 0.18
509 0.18
510 0.19
511 0.2
512 0.18
513 0.22
514 0.23
515 0.24
516 0.25
517 0.27
518 0.24
519 0.23
520 0.18
521 0.14
522 0.12
523 0.13
524 0.1
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.04
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.11
538 0.15
539 0.16
540 0.21
541 0.29
542 0.37
543 0.44
544 0.54
545 0.56
546 0.56
547 0.56
548 0.51
549 0.51
550 0.45
551 0.41
552 0.33
553 0.31
554 0.28
555 0.27
556 0.25
557 0.18
558 0.16
559 0.14
560 0.13
561 0.13
562 0.14
563 0.17
564 0.17
565 0.18
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.16
570 0.17
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.19
575 0.2
576 0.19
577 0.16
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.09
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.07
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.13
592 0.15
593 0.16
594 0.16
595 0.22
596 0.24
597 0.24
598 0.28
599 0.27
600 0.24
601 0.24
602 0.23
603 0.2
604 0.21
605 0.23
606 0.19
607 0.16
608 0.17
609 0.18
610 0.2
611 0.21
612 0.18
613 0.15
614 0.16
615 0.17
616 0.18
617 0.21
618 0.19
619 0.19
620 0.22
621 0.25
622 0.26
623 0.26
624 0.25
625 0.23
626 0.3
627 0.33
628 0.36
629 0.36
630 0.35
631 0.38
632 0.38
633 0.37
634 0.32
635 0.36
636 0.36
637 0.41
638 0.44
639 0.46
640 0.54
641 0.6
642 0.66
643 0.66
644 0.7
645 0.68
646 0.74
647 0.77
648 0.8
649 0.81
650 0.84
651 0.83
652 0.82
653 0.82
654 0.81
655 0.79
656 0.78
657 0.71
658 0.62
659 0.55
660 0.46
661 0.41
662 0.32
663 0.24
664 0.13
665 0.1
666 0.07
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.17
678 0.19
679 0.21
680 0.22
681 0.25
682 0.25
683 0.27
684 0.31
685 0.27
686 0.26
687 0.24
688 0.23
689 0.21
690 0.19
691 0.18
692 0.12
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.11
697 0.1
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.11
707 0.14
708 0.16
709 0.2
710 0.23
711 0.25
712 0.25
713 0.25
714 0.26
715 0.3
716 0.28
717 0.27
718 0.23
719 0.21
720 0.19
721 0.19
722 0.15
723 0.07
724 0.08
725 0.07
726 0.08
727 0.08