Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CLQ6

Protein Details
Accession A0A550CLQ6    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-32PAARNSGKRIRARVKPNARRMEIHHydrophilic
148-171DEPAPPPPPKKEKKKSGGETREVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-27NSGKRIRARVKPNAR
153-164PPPPKKEKKKSG
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006886  RNA_pol_III_Rpc5  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04801  RPC5  
Amino Acid Sequences MTRPLQAPPAARNSGKRIRARVKPNARRMEIHIPTDTRPEVWNADRGKELGAARVDDDREKNQEESSRSSVEPRLSEVRLRSEEVPHKGVHMLGIVREGELHLHPISQTHQFRPTLTYMDYLTRKNRRGRGGAGSDSDSDDGPPPDPDEPAPPPPPKKEKKKSGGETREVTVSARKNEERNGVLMQGNITAWRREMLQTIHAEEDEEWANLDFRDENTSTAEDTFERIFSQKSSELQFKSELTDLMHDIQQDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.61
4 0.63
5 0.66
6 0.73
7 0.76
8 0.79
9 0.81
10 0.82
11 0.86
12 0.86
13 0.81
14 0.75
15 0.73
16 0.73
17 0.67
18 0.61
19 0.56
20 0.48
21 0.45
22 0.47
23 0.41
24 0.31
25 0.27
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.32
30 0.28
31 0.29
32 0.29
33 0.29
34 0.27
35 0.26
36 0.24
37 0.22
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.23
42 0.23
43 0.22
44 0.25
45 0.23
46 0.26
47 0.28
48 0.28
49 0.28
50 0.32
51 0.31
52 0.34
53 0.35
54 0.33
55 0.31
56 0.33
57 0.33
58 0.31
59 0.29
60 0.27
61 0.28
62 0.26
63 0.29
64 0.28
65 0.31
66 0.3
67 0.32
68 0.29
69 0.31
70 0.36
71 0.37
72 0.37
73 0.31
74 0.3
75 0.28
76 0.26
77 0.2
78 0.15
79 0.11
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.17
95 0.2
96 0.19
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.27
101 0.27
102 0.21
103 0.19
104 0.19
105 0.15
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.26
110 0.3
111 0.35
112 0.4
113 0.45
114 0.45
115 0.47
116 0.48
117 0.48
118 0.46
119 0.41
120 0.37
121 0.32
122 0.28
123 0.25
124 0.22
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.15
137 0.19
138 0.24
139 0.27
140 0.3
141 0.37
142 0.46
143 0.51
144 0.59
145 0.64
146 0.7
147 0.75
148 0.82
149 0.84
150 0.86
151 0.85
152 0.8
153 0.73
154 0.64
155 0.56
156 0.45
157 0.37
158 0.32
159 0.27
160 0.24
161 0.27
162 0.28
163 0.29
164 0.33
165 0.38
166 0.33
167 0.32
168 0.3
169 0.27
170 0.25
171 0.23
172 0.19
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.17
183 0.16
184 0.21
185 0.23
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.13
210 0.16
211 0.15
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.19
218 0.2
219 0.23
220 0.28
221 0.34
222 0.35
223 0.36
224 0.38
225 0.34
226 0.34
227 0.32
228 0.28
229 0.22
230 0.24
231 0.23
232 0.23
233 0.24