Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1F2

Protein Details
Accession A0A550C1F2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-126QTKNSRTPYKFRNGRKKYAGFRKEEHydrophilic
361-387LDIDHKKRSKHYIAKRLAKYRRRWLDQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-125RNGRKKYAGFRKE
366-381KKRSKHYIAKRLAKYR
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MLRLLSSLGSSLGSILGKRRREPETEVQAPVPLTEEPAVEEVVEEEVDVQVDDGPIVVSKEPGPDDEEESDTDEESPSKRARVETPPVEEPPAPKARVVDWQTKNSRTPYKFRNGRKKYAGFRKEERGARFKDICPPSVFATLGVMKEQVNDIWVCKSWIPEGTALVRNYHVLGHSGKYYTTHIGRKPMCECPHFIKGNHCKHIIYIYLKVLNVPETSYIWYQRALTRRELRMVFNNAPDIEHDAPDHILTAYLWSLRIDDDNASKPTPEDNCIVCQSVPSEKEKSDLVYCECCGKAQHRACYLPWVEQVRKTHMKQLPYNRLHKLNCLNCGRRWLGPEGLEGYRKFKVTKAGYMNLAEVLDIDHKKRSKHYIAKRLAKYRRRWLDQQYYNMLGKARDPQFIKYRQIEVHMKRRADEDKRRQQVIDAAQEAAAKVNVLSMQPASLRRGKQAKKPAHTYDYRKAGEQKARLLNFAELQVKAQAASPEVFAGLAAPVNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.19
3 0.26
4 0.31
5 0.36
6 0.42
7 0.44
8 0.49
9 0.56
10 0.59
11 0.61
12 0.61
13 0.6
14 0.54
15 0.52
16 0.46
17 0.38
18 0.3
19 0.2
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.15
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.18
51 0.18
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.19
64 0.17
65 0.2
66 0.22
67 0.24
68 0.3
69 0.37
70 0.45
71 0.47
72 0.51
73 0.53
74 0.53
75 0.53
76 0.49
77 0.42
78 0.4
79 0.4
80 0.34
81 0.3
82 0.3
83 0.28
84 0.36
85 0.4
86 0.42
87 0.41
88 0.5
89 0.55
90 0.58
91 0.6
92 0.58
93 0.63
94 0.57
95 0.59
96 0.58
97 0.63
98 0.67
99 0.73
100 0.78
101 0.76
102 0.8
103 0.82
104 0.82
105 0.81
106 0.83
107 0.81
108 0.77
109 0.75
110 0.75
111 0.73
112 0.72
113 0.68
114 0.65
115 0.6
116 0.61
117 0.59
118 0.52
119 0.53
120 0.5
121 0.47
122 0.42
123 0.4
124 0.35
125 0.34
126 0.32
127 0.22
128 0.23
129 0.21
130 0.18
131 0.16
132 0.14
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.17
150 0.2
151 0.24
152 0.24
153 0.23
154 0.21
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.14
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.17
168 0.2
169 0.25
170 0.26
171 0.34
172 0.35
173 0.38
174 0.4
175 0.44
176 0.44
177 0.4
178 0.41
179 0.39
180 0.45
181 0.44
182 0.41
183 0.43
184 0.48
185 0.55
186 0.56
187 0.51
188 0.43
189 0.41
190 0.42
191 0.37
192 0.29
193 0.24
194 0.22
195 0.23
196 0.22
197 0.22
198 0.2
199 0.17
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.22
212 0.22
213 0.29
214 0.34
215 0.35
216 0.4
217 0.4
218 0.39
219 0.39
220 0.42
221 0.37
222 0.31
223 0.31
224 0.25
225 0.24
226 0.22
227 0.21
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.1
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.18
260 0.2
261 0.2
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.18
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.24
284 0.27
285 0.33
286 0.34
287 0.36
288 0.36
289 0.42
290 0.4
291 0.33
292 0.33
293 0.33
294 0.31
295 0.33
296 0.36
297 0.37
298 0.43
299 0.41
300 0.46
301 0.43
302 0.48
303 0.5
304 0.58
305 0.61
306 0.6
307 0.65
308 0.6
309 0.64
310 0.58
311 0.58
312 0.57
313 0.5
314 0.52
315 0.53
316 0.53
317 0.47
318 0.52
319 0.48
320 0.41
321 0.4
322 0.35
323 0.31
324 0.28
325 0.29
326 0.26
327 0.26
328 0.27
329 0.24
330 0.25
331 0.23
332 0.23
333 0.22
334 0.21
335 0.28
336 0.28
337 0.36
338 0.38
339 0.39
340 0.41
341 0.41
342 0.39
343 0.31
344 0.27
345 0.19
346 0.13
347 0.1
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.19
352 0.21
353 0.24
354 0.29
355 0.37
356 0.42
357 0.51
358 0.6
359 0.65
360 0.72
361 0.81
362 0.83
363 0.85
364 0.85
365 0.83
366 0.82
367 0.82
368 0.82
369 0.79
370 0.78
371 0.78
372 0.79
373 0.77
374 0.75
375 0.7
376 0.64
377 0.58
378 0.53
379 0.44
380 0.34
381 0.29
382 0.31
383 0.28
384 0.29
385 0.3
386 0.35
387 0.42
388 0.47
389 0.53
390 0.48
391 0.5
392 0.46
393 0.51
394 0.55
395 0.55
396 0.59
397 0.58
398 0.55
399 0.51
400 0.56
401 0.58
402 0.58
403 0.61
404 0.62
405 0.65
406 0.72
407 0.74
408 0.68
409 0.62
410 0.59
411 0.56
412 0.52
413 0.43
414 0.36
415 0.34
416 0.34
417 0.32
418 0.25
419 0.18
420 0.1
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.09
427 0.11
428 0.14
429 0.17
430 0.21
431 0.26
432 0.28
433 0.35
434 0.45
435 0.5
436 0.56
437 0.64
438 0.69
439 0.71
440 0.78
441 0.78
442 0.77
443 0.8
444 0.79
445 0.78
446 0.78
447 0.7
448 0.67
449 0.65
450 0.65
451 0.65
452 0.62
453 0.62
454 0.61
455 0.61
456 0.58
457 0.53
458 0.48
459 0.41
460 0.41
461 0.36
462 0.26
463 0.27
464 0.27
465 0.24
466 0.21
467 0.22
468 0.19
469 0.17
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.11
476 0.1
477 0.08