Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNQ0

Protein Details
Accession C5DNQ0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-87SQRSALIKCLHRRKAHKDVVLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 13, mito 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0G18898g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MDGVRTSLLRHMQCWHSHCQSRYSSTVTSCLPRKIKDIFDDGKAEPLQTRQLNRILSFVRESRPHSSQRSALIKCLHRRKAHKDVVLVAKSALFDFNHNLQPDVSAYELKKYFSSLLSIGKSIQMEQAMFQLIKQFSLTNKSMVTNVINATFVQSTTTESVSQALLTWVRFNNYLHGHADFTNYEQYKYILKTLLFFLRAEKPEPHVLAETLNFVNSTQGPLITSQFASTLIYLSCYNRDFSVTESLWNYKREKEYPIIKSDLTSICKAYAHFEKFEQIQAAWSEFPDAQDDAQFDYLLIAHAKLQDWGNLQNQFNALFGIGDLPSINHYGIVMFSIAHLGEREMVEKLYNQLLRRKMIPTLPVLQSLLQVCYKTGDMNGCFQHFELFKKYGIKPTPSTCNIMLRIFRNLSDIDGSLRFLKRMTENGIEVSEKHFSTIINTCAKTTNYAIAGELFQVMKDHYDIKPTGSSVAALMHVYIKSDLPQEALKVFKEYRYTKAPLESEISIYNKAVEAYMRMNRSDMSEKIFEQILSKNLPADSEFYRVMIKHSALYMKDFETAENILTQLLSHSKLKATPTHFEALMGAYDKYSNRRGVLDLYQRMLENNVPVNSKVLFYLIKATFKTRLRSRENLDEAISLVDDIMSQAANRTLDITFEKLHPSVMAWPMRAAAKYHSPLRALELMNKYNDMFFDKTDSAESRLVVIRSLMVLSAEVHQWDDFQKFFERYMNRIQYYQNLPSATVRNRNFASLLRGVLTYKIKHLVATNRATEIPALLEDVSAKNFVIDNEAWNEAITSMFADMRTIGKGLQAVDTKLIHGFNLIHKYRLLRNKAASNTSTDRGSWFLEKKRQAPSSYQPKLYLKSNVLEKTFESMDNYLSTISNVESELKDLTSRFKYYMKRYLMHPRNKIPGWNEIEVKHAAYFQKLRDSKRAISPEELSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.52
4 0.58
5 0.58
6 0.6
7 0.59
8 0.58
9 0.57
10 0.54
11 0.49
12 0.44
13 0.46
14 0.42
15 0.43
16 0.42
17 0.47
18 0.48
19 0.46
20 0.5
21 0.52
22 0.54
23 0.52
24 0.56
25 0.51
26 0.5
27 0.53
28 0.47
29 0.48
30 0.42
31 0.37
32 0.3
33 0.29
34 0.32
35 0.33
36 0.36
37 0.35
38 0.41
39 0.45
40 0.43
41 0.47
42 0.4
43 0.38
44 0.4
45 0.38
46 0.39
47 0.39
48 0.43
49 0.44
50 0.49
51 0.52
52 0.53
53 0.55
54 0.53
55 0.57
56 0.61
57 0.56
58 0.56
59 0.57
60 0.59
61 0.63
62 0.69
63 0.68
64 0.68
65 0.75
66 0.78
67 0.81
68 0.82
69 0.78
70 0.72
71 0.72
72 0.73
73 0.66
74 0.57
75 0.47
76 0.39
77 0.33
78 0.29
79 0.24
80 0.14
81 0.14
82 0.19
83 0.23
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.25
88 0.26
89 0.24
90 0.21
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.24
95 0.25
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.22
101 0.25
102 0.2
103 0.25
104 0.25
105 0.26
106 0.24
107 0.25
108 0.25
109 0.22
110 0.22
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.25
125 0.27
126 0.22
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.25
131 0.24
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.19
158 0.19
159 0.24
160 0.25
161 0.28
162 0.26
163 0.26
164 0.26
165 0.24
166 0.27
167 0.2
168 0.19
169 0.25
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.26
177 0.21
178 0.21
179 0.22
180 0.25
181 0.28
182 0.25
183 0.24
184 0.25
185 0.29
186 0.31
187 0.33
188 0.31
189 0.31
190 0.36
191 0.37
192 0.35
193 0.28
194 0.26
195 0.25
196 0.23
197 0.22
198 0.16
199 0.15
200 0.13
201 0.11
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.15
228 0.17
229 0.23
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.27
234 0.29
235 0.32
236 0.31
237 0.29
238 0.35
239 0.35
240 0.37
241 0.41
242 0.47
243 0.48
244 0.51
245 0.48
246 0.43
247 0.4
248 0.41
249 0.38
250 0.32
251 0.28
252 0.24
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.26
258 0.25
259 0.25
260 0.25
261 0.28
262 0.28
263 0.3
264 0.26
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.13
294 0.14
295 0.17
296 0.21
297 0.25
298 0.25
299 0.24
300 0.24
301 0.22
302 0.2
303 0.17
304 0.12
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.14
337 0.16
338 0.17
339 0.23
340 0.27
341 0.28
342 0.3
343 0.3
344 0.28
345 0.28
346 0.29
347 0.26
348 0.28
349 0.27
350 0.26
351 0.25
352 0.23
353 0.22
354 0.2
355 0.18
356 0.13
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.16
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.19
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.18
375 0.19
376 0.25
377 0.26
378 0.3
379 0.33
380 0.35
381 0.34
382 0.36
383 0.42
384 0.39
385 0.41
386 0.35
387 0.36
388 0.34
389 0.33
390 0.32
391 0.25
392 0.27
393 0.24
394 0.23
395 0.21
396 0.18
397 0.17
398 0.15
399 0.13
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.19
414 0.2
415 0.18
416 0.17
417 0.16
418 0.14
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.12
424 0.15
425 0.17
426 0.19
427 0.19
428 0.2
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.19
433 0.17
434 0.14
435 0.14
436 0.13
437 0.11
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.06
442 0.05
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.08
448 0.08
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.11
456 0.11
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.1
476 0.12
477 0.12
478 0.13
479 0.2
480 0.21
481 0.24
482 0.29
483 0.31
484 0.29
485 0.34
486 0.32
487 0.27
488 0.28
489 0.24
490 0.2
491 0.2
492 0.2
493 0.15
494 0.15
495 0.13
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.06
500 0.07
501 0.1
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.18
508 0.2
509 0.18
510 0.18
511 0.18
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.16
516 0.15
517 0.16
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.12
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.15
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.11
536 0.13
537 0.15
538 0.14
539 0.16
540 0.16
541 0.14
542 0.17
543 0.16
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.12
548 0.11
549 0.1
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.06
555 0.08
556 0.09
557 0.1
558 0.11
559 0.14
560 0.16
561 0.21
562 0.23
563 0.25
564 0.27
565 0.29
566 0.28
567 0.26
568 0.24
569 0.18
570 0.15
571 0.13
572 0.09
573 0.07
574 0.09
575 0.09
576 0.13
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.18
581 0.2
582 0.22
583 0.28
584 0.32
585 0.3
586 0.3
587 0.3
588 0.28
589 0.27
590 0.25
591 0.19
592 0.14
593 0.15
594 0.16
595 0.16
596 0.16
597 0.18
598 0.17
599 0.16
600 0.14
601 0.11
602 0.1
603 0.09
604 0.17
605 0.17
606 0.19
607 0.2
608 0.22
609 0.28
610 0.31
611 0.39
612 0.37
613 0.45
614 0.49
615 0.55
616 0.58
617 0.61
618 0.61
619 0.55
620 0.5
621 0.41
622 0.34
623 0.28
624 0.22
625 0.12
626 0.08
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.03
632 0.03
633 0.04
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.09
638 0.08
639 0.1
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.14
644 0.16
645 0.15
646 0.15
647 0.13
648 0.13
649 0.15
650 0.2
651 0.21
652 0.19
653 0.19
654 0.2
655 0.22
656 0.22
657 0.19
658 0.16
659 0.21
660 0.25
661 0.29
662 0.3
663 0.3
664 0.29
665 0.33
666 0.35
667 0.29
668 0.32
669 0.33
670 0.33
671 0.33
672 0.34
673 0.29
674 0.24
675 0.24
676 0.21
677 0.16
678 0.14
679 0.18
680 0.18
681 0.18
682 0.2
683 0.21
684 0.2
685 0.21
686 0.2
687 0.18
688 0.2
689 0.2
690 0.17
691 0.16
692 0.13
693 0.12
694 0.11
695 0.09
696 0.06
697 0.06
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.1
705 0.11
706 0.13
707 0.11
708 0.13
709 0.18
710 0.18
711 0.19
712 0.25
713 0.26
714 0.28
715 0.38
716 0.43
717 0.4
718 0.41
719 0.42
720 0.42
721 0.45
722 0.45
723 0.39
724 0.32
725 0.31
726 0.33
727 0.38
728 0.36
729 0.39
730 0.37
731 0.39
732 0.39
733 0.39
734 0.37
735 0.33
736 0.34
737 0.27
738 0.26
739 0.22
740 0.21
741 0.2
742 0.24
743 0.26
744 0.21
745 0.22
746 0.25
747 0.24
748 0.25
749 0.3
750 0.33
751 0.36
752 0.4
753 0.39
754 0.37
755 0.37
756 0.36
757 0.31
758 0.23
759 0.17
760 0.11
761 0.11
762 0.09
763 0.08
764 0.09
765 0.1
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.09
770 0.1
771 0.1
772 0.14
773 0.14
774 0.15
775 0.17
776 0.19
777 0.18
778 0.17
779 0.17
780 0.12
781 0.11
782 0.09
783 0.06
784 0.06
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.09
790 0.1
791 0.1
792 0.09
793 0.1
794 0.12
795 0.13
796 0.18
797 0.19
798 0.19
799 0.22
800 0.22
801 0.21
802 0.22
803 0.21
804 0.15
805 0.15
806 0.16
807 0.19
808 0.28
809 0.28
810 0.27
811 0.29
812 0.33
813 0.39
814 0.47
815 0.48
816 0.45
817 0.51
818 0.58
819 0.62
820 0.64
821 0.57
822 0.55
823 0.53
824 0.48
825 0.43
826 0.35
827 0.31
828 0.27
829 0.29
830 0.29
831 0.31
832 0.37
833 0.44
834 0.51
835 0.55
836 0.62
837 0.65
838 0.61
839 0.62
840 0.64
841 0.66
842 0.67
843 0.65
844 0.62
845 0.61
846 0.62
847 0.6
848 0.57
849 0.5
850 0.48
851 0.53
852 0.51
853 0.48
854 0.46
855 0.41
856 0.39
857 0.37
858 0.31
859 0.27
860 0.23
861 0.22
862 0.22
863 0.21
864 0.17
865 0.15
866 0.15
867 0.12
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.13
872 0.12
873 0.14
874 0.15
875 0.15
876 0.16
877 0.16
878 0.22
879 0.24
880 0.27
881 0.28
882 0.34
883 0.42
884 0.48
885 0.57
886 0.57
887 0.54
888 0.58
889 0.67
890 0.7
891 0.72
892 0.72
893 0.7
894 0.73
895 0.73
896 0.73
897 0.65
898 0.65
899 0.62
900 0.58
901 0.54
902 0.45
903 0.47
904 0.42
905 0.4
906 0.31
907 0.28
908 0.24
909 0.27
910 0.31
911 0.31
912 0.4
913 0.44
914 0.48
915 0.54
916 0.59
917 0.58
918 0.64
919 0.68
920 0.62
921 0.62