Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNM0

Protein Details
Accession C5DNM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
522-552GVAKESKAAAKNKKKRESKKKETTPDATQPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
489-491ARR
519-542AVPGVAKESKAAAKNKKKRESKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG lth:KLTH0G18238g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSTQLFAKTSTEINLFQGYPSFDELTRDEAETIQVSLLSPCGRFMALATADAVQIFTGMEFSNRLLRVALKDVYDMQFSPSGNFLSTWERPSIAEPDHKNVKIWDLNVETPPEVPRYAYQAKVQSGWVLQFSKLDNFALKQFGKEIRIVKLDGEESTFNFDKPYSKLVPEQPISSFLISPAEFPTICTFSPEKSGKPAVLSIYAIAEGVTDKKIASKTFFKADSCQLKWNQQGNAVLCVAITDFDSSNKSYYGENTLYLLSFQGVNGALGGKSVRVPLSKEGPIHDFTWSPTSRQFGVIYGYMPATITFFDLRGNVVHSLPEQPKNTMLFSPSGRYILIAGFGNLQGSVEVLDRHDKFNCISKFDAANTSVCKWSPGGEFILTATTSPRLRVDNGLKIWHVSGTLCFVKEYKELLKIDWRHKVSQNLEKSHVIAKNEDPASDNFSDPKLGKIEVKIHPSVLEYNAKRQKNGSSDGAKDKPTGAYRPPHARRAGGAASVPGAAVKPSQRVIPGMAPPPGAVPGVAKESKAAAKNKKKRESKKKETTPDATQPDADSQAANQPRVNKEASPEEKKIRSLLKKLRAIESLKQKLAAGESLEDTQLLKIQTEDKVCKELEFLGWKNEDAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.23
4 0.24
5 0.22
6 0.21
7 0.23
8 0.22
9 0.19
10 0.23
11 0.23
12 0.25
13 0.25
14 0.24
15 0.21
16 0.19
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.18
33 0.16
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.19
54 0.22
55 0.26
56 0.28
57 0.22
58 0.23
59 0.27
60 0.28
61 0.27
62 0.24
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.2
73 0.22
74 0.24
75 0.23
76 0.23
77 0.23
78 0.26
79 0.29
80 0.26
81 0.31
82 0.32
83 0.38
84 0.46
85 0.45
86 0.44
87 0.4
88 0.43
89 0.39
90 0.37
91 0.36
92 0.32
93 0.34
94 0.35
95 0.36
96 0.29
97 0.26
98 0.27
99 0.23
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.22
104 0.25
105 0.27
106 0.3
107 0.34
108 0.36
109 0.36
110 0.35
111 0.3
112 0.27
113 0.26
114 0.24
115 0.19
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.2
121 0.2
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.23
126 0.22
127 0.2
128 0.23
129 0.26
130 0.27
131 0.3
132 0.31
133 0.29
134 0.31
135 0.31
136 0.27
137 0.27
138 0.25
139 0.21
140 0.21
141 0.17
142 0.15
143 0.21
144 0.2
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.24
151 0.21
152 0.22
153 0.28
154 0.34
155 0.41
156 0.4
157 0.39
158 0.34
159 0.35
160 0.34
161 0.3
162 0.23
163 0.16
164 0.18
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.26
178 0.26
179 0.24
180 0.27
181 0.29
182 0.26
183 0.27
184 0.28
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.22
204 0.24
205 0.3
206 0.32
207 0.3
208 0.31
209 0.38
210 0.42
211 0.38
212 0.42
213 0.39
214 0.43
215 0.49
216 0.5
217 0.44
218 0.39
219 0.42
220 0.37
221 0.37
222 0.3
223 0.23
224 0.17
225 0.16
226 0.12
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.13
265 0.18
266 0.2
267 0.2
268 0.21
269 0.23
270 0.24
271 0.23
272 0.21
273 0.16
274 0.15
275 0.21
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.19
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.13
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.14
307 0.16
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.19
315 0.18
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.09
325 0.1
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.11
340 0.12
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.24
346 0.25
347 0.23
348 0.23
349 0.24
350 0.25
351 0.25
352 0.27
353 0.19
354 0.2
355 0.19
356 0.19
357 0.18
358 0.16
359 0.16
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.21
379 0.25
380 0.29
381 0.31
382 0.32
383 0.3
384 0.29
385 0.28
386 0.21
387 0.17
388 0.1
389 0.09
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.18
398 0.16
399 0.21
400 0.21
401 0.23
402 0.31
403 0.35
404 0.39
405 0.45
406 0.46
407 0.44
408 0.48
409 0.54
410 0.52
411 0.55
412 0.57
413 0.52
414 0.53
415 0.49
416 0.47
417 0.45
418 0.41
419 0.34
420 0.29
421 0.26
422 0.3
423 0.29
424 0.28
425 0.24
426 0.22
427 0.27
428 0.25
429 0.24
430 0.17
431 0.18
432 0.2
433 0.18
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.18
438 0.2
439 0.28
440 0.3
441 0.35
442 0.33
443 0.32
444 0.31
445 0.31
446 0.29
447 0.25
448 0.28
449 0.24
450 0.33
451 0.41
452 0.42
453 0.41
454 0.42
455 0.44
456 0.41
457 0.45
458 0.43
459 0.4
460 0.44
461 0.51
462 0.52
463 0.46
464 0.42
465 0.38
466 0.35
467 0.34
468 0.33
469 0.31
470 0.34
471 0.4
472 0.5
473 0.54
474 0.56
475 0.55
476 0.52
477 0.48
478 0.48
479 0.43
480 0.34
481 0.3
482 0.23
483 0.2
484 0.19
485 0.17
486 0.1
487 0.08
488 0.07
489 0.09
490 0.1
491 0.13
492 0.14
493 0.16
494 0.17
495 0.19
496 0.21
497 0.24
498 0.27
499 0.28
500 0.29
501 0.27
502 0.26
503 0.25
504 0.23
505 0.18
506 0.13
507 0.1
508 0.1
509 0.16
510 0.17
511 0.16
512 0.16
513 0.18
514 0.24
515 0.29
516 0.36
517 0.4
518 0.51
519 0.61
520 0.71
521 0.78
522 0.83
523 0.88
524 0.91
525 0.91
526 0.92
527 0.93
528 0.93
529 0.93
530 0.92
531 0.87
532 0.84
533 0.83
534 0.77
535 0.67
536 0.58
537 0.49
538 0.43
539 0.38
540 0.3
541 0.21
542 0.17
543 0.23
544 0.26
545 0.26
546 0.26
547 0.3
548 0.33
549 0.37
550 0.38
551 0.31
552 0.32
553 0.41
554 0.48
555 0.48
556 0.52
557 0.56
558 0.57
559 0.58
560 0.58
561 0.58
562 0.58
563 0.6
564 0.64
565 0.66
566 0.69
567 0.72
568 0.72
569 0.69
570 0.66
571 0.64
572 0.65
573 0.63
574 0.58
575 0.55
576 0.49
577 0.45
578 0.42
579 0.36
580 0.27
581 0.21
582 0.21
583 0.21
584 0.21
585 0.19
586 0.17
587 0.15
588 0.16
589 0.14
590 0.12
591 0.13
592 0.17
593 0.22
594 0.29
595 0.33
596 0.33
597 0.37
598 0.37
599 0.36
600 0.34
601 0.31
602 0.3
603 0.34
604 0.32
605 0.35
606 0.36