Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CPE6

Protein Details
Accession A0A550CPE6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSSKLKNKAKQTKFPVARIKKIMHydrophilic
146-241ASDAEQKPKKRSRAKPKEPKPPKEPKPPKEPKPPKPPKEPKPPKEPKPPKVPKEKKEPKPRVRKPKAEGASGDANGDEPPKRRRRKKADEPEVMGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-119PKRRGKGKARGRA
152-232KPKKRSRAKPKEPKPPKEPKPPKEPKPPKPPKEPKPPKEPKPPKVPKEKKEPKPRVRKPKAEGASGDANGDEPPKRRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSSKLKNKAKQTKFPVARIKKIMQKDEDVGKVAQATPVVISKALELFLKTIVDESAKVTVHRGARKVEAYHLKHAVETTEVLDFLKDIVAAVPDPSAGGTIDPGDGPKRRGKGKARGRARDDDDEDNDNDPNDDEDEDGDAHMDDASDAEQKPKKRSRAKPKEPKPPKEPKPPKEPKPPKPPKEPKPPKEPKPPKVPKEKKEPKPRVRKPKAEGASGDANGDEPPKRRRRKKADEPEVMGEGMGAFEVKLEPPYGAADAPPFGGSGVAYEAGGYEAGAGEYEAGGHYSAAPAGGGFDDAYGGGSMYVEPAGYGSAGAGGGMYDAGADYTEEDRPYVPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.82
4 0.81
5 0.78
6 0.76
7 0.73
8 0.75
9 0.74
10 0.68
11 0.65
12 0.62
13 0.61
14 0.57
15 0.52
16 0.43
17 0.36
18 0.33
19 0.27
20 0.23
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.14
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.21
47 0.26
48 0.31
49 0.32
50 0.31
51 0.36
52 0.4
53 0.4
54 0.43
55 0.46
56 0.46
57 0.49
58 0.49
59 0.44
60 0.41
61 0.4
62 0.32
63 0.23
64 0.2
65 0.15
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.1
92 0.12
93 0.16
94 0.2
95 0.25
96 0.29
97 0.37
98 0.45
99 0.52
100 0.6
101 0.67
102 0.72
103 0.76
104 0.77
105 0.76
106 0.73
107 0.7
108 0.64
109 0.58
110 0.51
111 0.45
112 0.41
113 0.34
114 0.29
115 0.21
116 0.17
117 0.13
118 0.11
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.06
135 0.06
136 0.11
137 0.15
138 0.18
139 0.27
140 0.33
141 0.42
142 0.5
143 0.6
144 0.67
145 0.75
146 0.84
147 0.87
148 0.89
149 0.91
150 0.91
151 0.89
152 0.87
153 0.86
154 0.83
155 0.84
156 0.85
157 0.8
158 0.81
159 0.82
160 0.81
161 0.82
162 0.84
163 0.82
164 0.84
165 0.88
166 0.84
167 0.86
168 0.87
169 0.85
170 0.87
171 0.88
172 0.83
173 0.83
174 0.86
175 0.83
176 0.84
177 0.85
178 0.81
179 0.81
180 0.84
181 0.81
182 0.83
183 0.84
184 0.79
185 0.81
186 0.84
187 0.82
188 0.84
189 0.87
190 0.86
191 0.88
192 0.91
193 0.91
194 0.9
195 0.89
196 0.83
197 0.82
198 0.76
199 0.68
200 0.59
201 0.52
202 0.47
203 0.38
204 0.34
205 0.23
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.22
212 0.32
213 0.43
214 0.52
215 0.63
216 0.72
217 0.8
218 0.88
219 0.9
220 0.91
221 0.9
222 0.85
223 0.78
224 0.68
225 0.57
226 0.45
227 0.33
228 0.22
229 0.13
230 0.08
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.06
315 0.09
316 0.12
317 0.12
318 0.13