FuNGI

C5DLD0

Protein Details

Accession

C5DLD0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-117	PQPMREKRREALKRLREREDQ	Basic
119-141	LEEKTAKKLQKQKRDSSKPGIDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
101-114	REKRREALKRLRER
125-127	KKL
129-129	K

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	lth:KLTH0F11968g -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12565 RRM1_MRD1 cd12568 RRM3_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRVIVKGLPKYLTDDQLKDHFSKRLAHLHKGADVTEAITDVKILKNRAGESRRFAFVGFRSEEDAFDAVNYFDQSFIHTCKIEVTMAKSFADPRVPQPMREKRREALKRLREREDQLLEEKTAKKLQKQKRDSSKPGIDAEIKSNKQLQEFIDTMKPSSQVASWDNLGGAVKSAPSNQLAVQADAPQGNSLLAQALAMKSEDKEPQGFRAQENESDDEYTTLDGQKGQGDDGGTEEEQMVKLDNFNEPAGENIAQDQEVSDFDWLKQRRTRIKEQQENSVGAGTAPEKPTETTQVDEPTETPPAEDKEPEQSPAEPPMDTSEEEKFIQKIRTTGRLFLRNILYTATEEDFKGLLAPFGELEEVHVALDTRTGKSKGFAYVMFRNPEDAVNAYVELDKHIFQGRLLHILPADAKKSHRLDEFDLKNLPLKKQRALKRKANAAHETFSWNSLYMNQNAVLGSVAAKLGVQKSDLIDATDASAAVKQALAEAHVIGDVRKYFESKGMDLAKFAEMKSPNDRDDTVLLVKNFPFGTTHSELAELFLPFGKLLRLLLPPAQTIAVVQYRDATSARAAFTKLSYKRFKDGILYLEKGPKGCFKRDPEGDEIVDLHEEPQSATAREARATGDEIMEVDKDDKQDEDGTDDVLDGPTVSIFVKNLNFSTTTKELTEKFKPFSGFVVAQVKTKPDPKNANKTLSMGFGFAEFKTKEQAVAVIDALDGAVLDGHRIQLKLSHRQGSAAPTSGQSKKKSSGKIVVKNLPFEAERKQVFELFSSFGQLKSVRVPKKFDKSTRGFAFVEFLLPKEAENAMEQLQGVHLLGRRLVMQHAEQEPQDAEEQIARMTKKVRSQVATQELAALRNGGRRKVDLEDELDENDGLNGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.42
3	0.41
4	0.46
5	0.49
6	0.45
7	0.45
8	0.41
9	0.39
10	0.45
11	0.46
12	0.49
13	0.51
14	0.56
15	0.58
16	0.57
17	0.58
18	0.52
19	0.47
20	0.39
21	0.33
22	0.26
23	0.2
24	0.17
25	0.13
26	0.11
27	0.11
28	0.1
29	0.15
30	0.18
31	0.2
32	0.23
33	0.28
34	0.31
35	0.4
36	0.46
37	0.47
38	0.5
39	0.53
40	0.52
41	0.47
42	0.44
43	0.4
44	0.37
45	0.39
46	0.34
47	0.3
48	0.32
49	0.32
50	0.32
51	0.29
52	0.26
53	0.18
54	0.15
55	0.15
56	0.11
57	0.12
58	0.12
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.13
63	0.15
64	0.18
65	0.2
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.24
70	0.23
71	0.23
72	0.25
73	0.27
74	0.28
75	0.29
76	0.28
77	0.28
78	0.28
79	0.33
80	0.29
81	0.27
82	0.37
83	0.37
84	0.41
85	0.49
86	0.57
87	0.6
88	0.67
89	0.68
90	0.63
91	0.73
92	0.77
93	0.76
94	0.76
95	0.77
96	0.79
97	0.81
98	0.83
99	0.79
100	0.75
101	0.75
102	0.69
103	0.62
104	0.56
105	0.51
106	0.45
107	0.44
108	0.41
109	0.36
110	0.37
111	0.37
112	0.41
113	0.48
114	0.56
115	0.62
116	0.69
117	0.75
118	0.8
119	0.87
120	0.87
121	0.87
122	0.85
123	0.79
124	0.72
125	0.66
126	0.59
127	0.51
128	0.5
129	0.5
130	0.42
131	0.4
132	0.42
133	0.39
134	0.37
135	0.38
136	0.32
137	0.29
138	0.29
139	0.3
140	0.3
141	0.29
142	0.28
143	0.27
144	0.26
145	0.2
146	0.2
147	0.18
148	0.17
149	0.18
150	0.2
151	0.19
152	0.18
153	0.18
154	0.17
155	0.17
156	0.12
157	0.11
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.13
165	0.13
166	0.2
167	0.2
168	0.21
169	0.21
170	0.2
171	0.21
172	0.2
173	0.2
174	0.13
175	0.12
176	0.1
177	0.09
178	0.08
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.12
189	0.15
190	0.16
191	0.2
192	0.21
193	0.25
194	0.32
195	0.33
196	0.31
197	0.35
198	0.34
199	0.34
200	0.37
201	0.35
202	0.29
203	0.29
204	0.28
205	0.22
206	0.2
207	0.16
208	0.13
209	0.11
210	0.1
211	0.09
212	0.1
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.13
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.07
229	0.08
230	0.09
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.11
236	0.12
237	0.13
238	0.13
239	0.11
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.17
252	0.18
253	0.23
254	0.27
255	0.34
256	0.42
257	0.49
258	0.59
259	0.61
260	0.71
261	0.75
262	0.74
263	0.76
264	0.7
265	0.64
266	0.54
267	0.44
268	0.33
269	0.23
270	0.21
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.15
278	0.2
279	0.2
280	0.18
281	0.2
282	0.23
283	0.23
284	0.22
285	0.22
286	0.18
287	0.19
288	0.17
289	0.15
290	0.13
291	0.15
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.2
296	0.21
297	0.23
298	0.21
299	0.2
300	0.2
301	0.24
302	0.24
303	0.17
304	0.16
305	0.18
306	0.18
307	0.18
308	0.18
309	0.15
310	0.17
311	0.17
312	0.18
313	0.16
314	0.17
315	0.2
316	0.19
317	0.22
318	0.23
319	0.32
320	0.32
321	0.37
322	0.4
323	0.44
324	0.43
325	0.43
326	0.43
327	0.35
328	0.34
329	0.28
330	0.23
331	0.16
332	0.17
333	0.14
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.04
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.12
359	0.13
360	0.13
361	0.15
362	0.17
363	0.16
364	0.17
365	0.17
366	0.2
367	0.25
368	0.29
369	0.3
370	0.28
371	0.26
372	0.25
373	0.24
374	0.2
375	0.14
376	0.11
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.08
386	0.11
387	0.1
388	0.1
389	0.15
390	0.15
391	0.18
392	0.18
393	0.17
394	0.14
395	0.15
396	0.17
397	0.13
398	0.14
399	0.11
400	0.12
401	0.18
402	0.2
403	0.23
404	0.24
405	0.25
406	0.28
407	0.36
408	0.37
409	0.33
410	0.32
411	0.29
412	0.3
413	0.29
414	0.28
415	0.27
416	0.27
417	0.3
418	0.37
419	0.46
420	0.52
421	0.58
422	0.63
423	0.61
424	0.67
425	0.67
426	0.65
427	0.62
428	0.55
429	0.48
430	0.41
431	0.38
432	0.3
433	0.25
434	0.19
435	0.14
436	0.11
437	0.13
438	0.14
439	0.12
440	0.13
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.09
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.07
465	0.07
466	0.05
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.14
488	0.17
489	0.16
490	0.21
491	0.24
492	0.24
493	0.23
494	0.24
495	0.21
496	0.19
497	0.19
498	0.18
499	0.16
500	0.19
501	0.25
502	0.26
503	0.26
504	0.27
505	0.28
506	0.24
507	0.23
508	0.23
509	0.19
510	0.19
511	0.18
512	0.18
513	0.17
514	0.18
515	0.16
516	0.14
517	0.12
518	0.1
519	0.17
520	0.19
521	0.2
522	0.17
523	0.18
524	0.18
525	0.18
526	0.19
527	0.11
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.08
533	0.07
534	0.05
535	0.06
536	0.08
537	0.09
538	0.1
539	0.13
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.14
544	0.11
545	0.1
546	0.12
547	0.12
548	0.11
549	0.11
550	0.12
551	0.12
552	0.14
553	0.14
554	0.12
555	0.1
556	0.12
557	0.13
558	0.12
559	0.13
560	0.12
561	0.14
562	0.21
563	0.24
564	0.3
565	0.36
566	0.38
567	0.42
568	0.43
569	0.42
570	0.38
571	0.37
572	0.35
573	0.34
574	0.33
575	0.31
576	0.34
577	0.34
578	0.29
579	0.28
580	0.29
581	0.28
582	0.31
583	0.36
584	0.37
585	0.46
586	0.5
587	0.53
588	0.5
589	0.5
590	0.45
591	0.38
592	0.33
593	0.24
594	0.2
595	0.15
596	0.11
597	0.08
598	0.08
599	0.07
600	0.1
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.15
605	0.15
606	0.16
607	0.16
608	0.14
609	0.14
610	0.15
611	0.15
612	0.12
613	0.11
614	0.11
615	0.11
616	0.1
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.1
622	0.1
623	0.11
624	0.14
625	0.13
626	0.15
627	0.14
628	0.14
629	0.13
630	0.13
631	0.12
632	0.09
633	0.09
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.09
642	0.11
643	0.12
644	0.13
645	0.14
646	0.16
647	0.16
648	0.23
649	0.22
650	0.22
651	0.22
652	0.24
653	0.26
654	0.3
655	0.38
656	0.35
657	0.36
658	0.38
659	0.38
660	0.36
661	0.35
662	0.35
663	0.27
664	0.27
665	0.32
666	0.28
667	0.29
668	0.29
669	0.3
670	0.28
671	0.35
672	0.35
673	0.36
674	0.47
675	0.53
676	0.63
677	0.66
678	0.69
679	0.63
680	0.62
681	0.54
682	0.47
683	0.39
684	0.28
685	0.22
686	0.18
687	0.17
688	0.14
689	0.19
690	0.15
691	0.15
692	0.19
693	0.19
694	0.18
695	0.17
696	0.2
697	0.15
698	0.16
699	0.16
700	0.12
701	0.11
702	0.1
703	0.09
704	0.07
705	0.05
706	0.03
707	0.04
708	0.03
709	0.04
710	0.05
711	0.07
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.15
716	0.21
717	0.3
718	0.37
719	0.42
720	0.4
721	0.42
722	0.44
723	0.44
724	0.42
725	0.35
726	0.29
727	0.25
728	0.3
729	0.35
730	0.39
731	0.38
732	0.4
733	0.46
734	0.52
735	0.57
736	0.59
737	0.62
738	0.66
739	0.71
740	0.75
741	0.75
742	0.71
743	0.67
744	0.6
745	0.53
746	0.44
747	0.37
748	0.33
749	0.33
750	0.31
751	0.31
752	0.32
753	0.32
754	0.32
755	0.32
756	0.28
757	0.23
758	0.22
759	0.22
760	0.21
761	0.17
762	0.2
763	0.18
764	0.18
765	0.24
766	0.33
767	0.36
768	0.41
769	0.48
770	0.54
771	0.64
772	0.72
773	0.71
774	0.73
775	0.73
776	0.78
777	0.76
778	0.72
779	0.62
780	0.53
781	0.48
782	0.38
783	0.36
784	0.26
785	0.22
786	0.19
787	0.18
788	0.18
789	0.17
790	0.17
791	0.13
792	0.15
793	0.16
794	0.15
795	0.16
796	0.16
797	0.13
798	0.13
799	0.12
800	0.11
801	0.12
802	0.12
803	0.13
804	0.13
805	0.14
806	0.15
807	0.16
808	0.18
809	0.19
810	0.19
811	0.25
812	0.27
813	0.29
814	0.28
815	0.3
816	0.28
817	0.26
818	0.25
819	0.19
820	0.17
821	0.16
822	0.17
823	0.15
824	0.2
825	0.18
826	0.2
827	0.25
828	0.29
829	0.35
830	0.42
831	0.48
832	0.48
833	0.53
834	0.6
835	0.63
836	0.6
837	0.52
838	0.51
839	0.44
840	0.41
841	0.36
842	0.28
843	0.21
844	0.25
845	0.29
846	0.28
847	0.3
848	0.31
849	0.34
850	0.38
851	0.42
852	0.4
853	0.41
854	0.39
855	0.38
856	0.36
857	0.34
858	0.28
859	0.22

C5DLD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer